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哺乳類胚におけるエピゲノム制御のシステムレベルでの解析

研究課題

研究課題/領域番号 22510220
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 システムゲノム科学
研究機関京都大学 (2012)
独立行政法人理化学研究所 (2010-2011)

研究代表者

熊木 勇一  京都大学, 医学研究科, 助教 (50455341)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードエピゲノム制御 / エピジェネティクス / DNA メチル化 / ヒストン修飾 / システムバイオロジー / バイオインフォマティクス / DNAメチル化 / エピゲノム
研究概要

DNA のメチル化は哺乳類の発生に必須であるが、その直接的な機能については未だ不明な点が多い。そこで、 DNA メチル化酵素を欠損した ES 細胞及び分化した中胚葉経細胞、栄養膜幹細胞を用い、野生株細胞と比較し、遺伝子発現及びヒストン修飾のゲノムワイドな解析を行った。その結果、遺伝子発現、ヒストン修飾状態のどちらについても、DNA メチル化の消失よりも主として細胞種の違いに依存すること、遺伝子群により DNA メチル化の消失に対する感受性が異なることを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2013 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] DNA methylation restricts lineage-specific functions of transcription factor Gata4 during embryonic stem cell differentiation.2013

    • 著者名/発表者名
      Oda M, Kumaki Y, Shigeta M, Jakt LM, Matsuoka C, Yamagiwa A, Niwa H, Okano M.
    • 雑誌名

      PLOS Genetics

      巻: 9 号: 6 ページ: e1003574-e1003574

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1003574

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA Methylation Is Dispensable for the Growth and Survival of the Extraembryonic Lineages2010

    • 著者名/発表者名
      Morito Sakaue#, Hiroshi Ohta#, Yuichi Kumaki, Masaaki Oda, Yuko Sakaide, Chisa Matsuoka, Akiko Yamagiwa, Hitoshi Niwa, Teruhiko Wakayama and Masaki Okano
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 20 号: 16 ページ: 1452-1457

    • DOI

      10.1016/j.cub.2010.06.050

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA Methylation is Dispensable for the Growth and Survival of the Extraembryonic Lineages2010

    • 著者名/発表者名
      Morito Sakaue, Hiroshi Ohta, Yuichi Kumaki, Masaaki Oda, Yuko Sakaide, Chisa Matsuoka, Akiko Yamagiwa, Hitoshi Niwa, Teruhiko Wakayama, Masaki Okano
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 20 ページ: 1452-1457

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Genome-wide analysis of histone modification in DNA methylation deficient cells2011

    • 著者名/発表者名
      Yuichi Kumaki, Akiko Yamagiwa, Chisa Matsuoka and Masaki Okano
    • 学会等名
      第63回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-06-27
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genome-wide analysis of histone modification in DNA methylation deficient cells2011

    • 著者名/発表者名
      Kumaki, Y., Yamagiwa, A., Matsuoka, C., Okano, M.
    • 学会等名
      第63回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌)
    • 年月日
      2011-06-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Dnmt 欠損細胞におけるヒストン修飾の ChIP-chip 法による解析2010

    • 著者名/発表者名
      熊木勇一、山際晶子、松岡智沙、岡野正樹
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt 欠損細胞におけるヒストン修飾の ChIP-chip 法による解析2010

    • 著者名/発表者名
      熊木勇一、山際晶子、松岡智沙、岡野正樹
    • 学会等名
      第4回エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      米子
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt欠損細胞におけるヒストン修飾のChIP-chip法による解析2010

    • 著者名/発表者名
      熊木勇一・山際晶子・松岡智沙・岡野正樹
    • 学会等名
      第4回エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      米子
    • 年月日
      2010-05-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Dnmt欠損細胞におけるヒストン修飾のChIP-chip法による解析2010

    • 著者名/発表者名
      熊木勇一・山際晶子・松岡智沙・岡野正樹
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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