| 研究課題/領域番号 |
22540421
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
生物物理・化学物理
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| 研究機関 | 日本医科大学 |
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研究代表者 |
藤崎 弘士 日本医科大学, 医学部, 准教授 (60573243)
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| 研究分担者 |
高見 利也 九州大学, 情報基盤研究開発センター, 准教授 (10270472)
菊地 浩人 日本医科大学, 医学部, 准教授 (00224907)
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| 連携研究者 |
戸田 幹人 奈良女子大学, 理学部, 准教授 (70197896)
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| 研究期間 (年度) |
2010 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2011年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
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| キーワード | 生物物理 / 振動分光 / 量子ダイナミクス / 振動エネルギー緩和 / 非線形動力学 / 最適制御理論 / パスサンプリング / 化学物理 / 計算物理 / 分子機械 / 蛋白質 |
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| 研究概要 |
生体分子などの高分子を含む、比較的大きな分子の振動のダイナミク スを解明するには、通常は基準振動解析と呼ばれる線形の解析を使うが、これでは非線形・非 平衡の効果を調べることができず、また量子効果に関しても十分に取り入れることができない。 最近では時間分解の振動分光実験において、生体分子内の振動緩和や振動エネルギー移動が非 常に短い時間・空間スケールで観測されつつあるが、その分子レベルの解明のためには理論・ 計算によるアプローチが欠かせない。そこで本研究では以前われわれが開発した摂動論の考え を越えた「分子の階層モデル」を考え、そのアルゴリズムを並列計算として実装し、最近の実 験結果に適用した。また、われわれは振動状態を制御するための最適制御理論の量子古典対応、 分子の構造変化を効率的に計算するためのパスサンプリングのアルゴリズムを開発した。
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