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ヒト由来PGD合成酵素の金属イオンによる活性化機構解明のための中性子線構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 22550152
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関大阪大学

研究代表者

井上 豪  大阪大学, 大学院・工学研究科, 教授 (20263204)

研究分担者 松村 浩由  大阪大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (30324809)
溝端 栄一  大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教 (90571183)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード中性子線解析 / 金属イオン / 酵素活性化機構 / 中性子線構造解析 / プロスタグランジンD合成酵素 / 反応メカニズムの解明 / 結晶の大型育成 / プロスタグランジンD合成酵素 / 反応メカニズムの明
研究概要

アレルギーや炎症の媒介物質であるプロスタグランジン(PG)D2 は、補酵素グルタチオン(GSH)存在下、造血器型プロスタグランジン(PG)D 合成酵素(H-PGDS)の働きによって産生される。以前、Ca,および Mgイオンの働きによって活性化される分子メカニズムをX線構造解析によって解明したが、これを中性子線解析法によって解明する目的で大型結晶の育成研究に取り組んだ結果、0.5 mm^3程度の高品質結晶が得られることが判明した

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (25件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Kado, Y. Okano, N. Okazaki, K. Aritake, N. Uodome, H. Matsumura, Y. Urade & T. Inoue
    • 雑誌名

      J. Biochem

      巻: 151 ページ: 447-455

    • NAID

      10031166083

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Three-dimensional, non-invasive, cross-sectional imaging of protein crystals using ultrahigh resolution optical coherence tomography2012

    • 著者名/発表者名
      N. Nishizawa, S. Ishida, M. Hirose, S. Sugiyama, T. Inoue, Y. Mori, K. Itoh & H. Matsumura*
    • 雑誌名

      Biomed. Opt. Express

      巻: 3 ページ: 735-740

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Growth of protein crystals in hydrogels prevents osmotic shock2012

    • 著者名/発表者名
      S. Sugiyama, M. Maruyama, G. Sazaki, M. Hirose, H. Adachi, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, Y. Mori & H. Matsumura*
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 134 ページ: 5786-5789

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the superfamily 1 helicase from Tomato mosaic virus2012

    • 著者名/発表者名
      M. Nishikiori, S. Sugiyama, H. Xiang, M. Niiyama, K. Ishibashi, T. Inoue, M. Ishikawa, H. Matsumura & E. Katoh*
    • 雑誌名

      J. Virol.

      巻: 86 ページ: 7565-7576

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Effects of a forced solution flow on the step advancement on {110} faces of tetragonal lysozyme crystals: direct visualization of individual steps under a forced solution flow2012

    • 著者名/発表者名
      M. Maruyama, K. Hisato, G. Sazaki, S. Maki, Y. Takahashi, H. Yoshikawa, S. Sugiyama, H. Adachi, K. Takano, H. Matsumura, T. Inoue, S. Murakami & Y. Mori
    • 雑誌名

      Cryst. Growth Des.

      巻: 12 ページ: 2856-2863

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The in silico screening and X-ray structure analysis of the inhibitor complex of Plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Takashima, E. Mizohata, S. R. Krungkrai, Y. Fukunishi, T. Kinoshita, T. Sakata, H. Matsumura, J. Krungkrai, T. Horii & T. Inoue
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 152 ページ: 133-138

    • NAID

      10031166122

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the N-terminal domain of the yeast general corepressor Tup1p and its functional implications2012

    • 著者名/発表者名
      H. Matsumura*, N. Kusaka, T. Nakamura, N. Tanaka, K. Sagegami, K. Uegaki, T. Inoue & Y. Mukai
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 287 ページ: 26528-26538

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of rice Rubisco and implications for activation induced by positive effectors NADPH and 6-phosphogluconate2012

    • 著者名/発表者名
      H. Matsumura, E. Mizohata, H. Ishida, A. Kogami, T. Ueno, A. Makino, T. Inoue, A. Yokota, T. Mae & Y. Kai*
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol.

      巻: 422 ページ: 75-86

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Spatially precise, soft microseeding of single protein crystals by femtosecond laser ablation2012

    • 著者名/発表者名
      H. Yoshikawa, Y. Hosokawa, R. Murai, G. Sazaki, T. Kitatani, H. Adachi, T. Inoue, H. Matsumura, K. Takano, S. Murakami, S. Nakabayashi, Y. Mori & H. Matsumura
    • 雑誌名

      Cryst. Growth Des.

      巻: 12 ページ: 4334-4339

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kado
    • 雑誌名

      J. Biochem.,

      巻: 151(4) 号: 4 ページ: 447-455

    • DOI

      10.1093/jb/mvs024

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensional, non-invasive, cross-sectional imaging of protein crystals using ultrahigh resolution optical coherence tomography2012

    • 著者名/発表者名
      N.Nishizawa, S.Ishida, M.Hirose, S.Sugiyama, T.Inoue, Y.Mori, K.Itoh, H.Matsumura
    • 雑誌名

      Biomedical Optics Express

      巻: 3 号: 4 ページ: 735-740

    • DOI

      10.1364/boe.3.000735

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Growth of protein crystals in hydrogels prevents osmotic shock2012

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Sugiyama
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.,

      巻: 134(13) 号: 13 ページ: 5786-5789

    • DOI

      10.1021/ja301584y

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the superfamily 1 helicase from Tomato mosaic virus2012

    • 著者名/発表者名
      Masaki Nishikiori
    • 雑誌名

      J. Virol.,

      巻: 12(6) 号: 14 ページ: 2856-2863

    • DOI

      10.1128/jvi.00118-12

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The in silico screening and X-ray structure analysis of the inhibitor complex of Plasmodium falciparum orotidine 5’-monophosphate decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuhide Takashima
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 152(2) ページ: 133-138

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the N-terminal domain of the yeast general corepressor2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Matsumura
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 287(32) 号: 32 ページ: 26528-26538

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.369652

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of rice Rubisco and implications for activation2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Matsumura
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol.,

      巻: 422(1) 号: 1 ページ: 75-86

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2012.05.014

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatially precise, soft microseeding of single protein crystalsby femtosecond laser ablation2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Yoshikawa
    • 雑誌名

      Cryst. Growth Des.,

      巻: 12(9) 号: 9 ページ: 4334-4339

    • DOI

      10.1021/cg300018t

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Kado, K.Aritake, N.Uodome, Y.Okano, N.Okazaki, H.Matsumura, Y.Urade, T.Inoue
    • 雑誌名

      J.of Biochemistry

      巻: (in press)

    • NAID

      10031166083

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into the stereoselective production of PGF_2αby Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi2011

    • 著者名/発表者名
      N. Okamoto, K. Yamaguchi, E. Mizohata, K. Tokuoka, N. Uchiyama, S. Sugiyama, H. Matsumura, K. Inaka, Y. Urade, T. Inoue
    • 雑誌名

      J. of Biochemistry

      巻: 150 ページ: 563-568

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of mouse prostaglandin F_2αsynthase, AKR1B32011

    • 著者名/発表者名
      Y. Takashima, S. Hatanaka, E. Mizohata, N. Nagata, Y. Fukunishi, H. Matsumura, Y. Urade, T. Inoue
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F67 ページ: 1630-1632

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural insight into the stereoselective production of PGF2a by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi2011

    • 著者名/発表者名
      N.Okamoto, K.Yamaguchi, E.Mizohata, K.Tokuoka, N.Uchiyama, S.Sugiyama, H.Matsumura, K.Inaka, Y.Urade, T.Inoue
    • 雑誌名

      J.of Biochemistry

      巻: 150(5) 号: 5 ページ: 563-568

    • DOI

      10.1093/jb/mvr096

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of mouse prostaglandin F2a synthase, AKR1B32011

    • 著者名/発表者名
      Y.Takashima, S.Hatanaka, E.Mizohata, N.Nagata, Y.Fukunishi, H.Matsumura, Y.Urade, T.Inoue
    • 雑誌名

      Acta Cryst

      巻: F67 号: 12 ページ: 1630-1632

    • DOI

      10.1107/s1744309111036165

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of hyperthermophilic b-glucosidase from Pyrococcus furiosus2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Kado, T.Inoue, K.Ishikawa
    • 雑誌名

      Acta Cryst

      巻: F67 号: 12 ページ: 1473-1479

    • DOI

      10.1107/s1744309111035238

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of the inhibitor complex of old yellow enzyme from Trypanosoma cruzi2011

    • 著者名/発表者名
      Keishi Yamaguchi, Naoki Okamoto, Keiji Tokuoka, Shigeru Sugiyama, Nahoko Uchiyama, Hiroyoshi Matsumura, Koji Inaka, Yoshihiro Urade, Tsuyoshi Inoue
    • 雑誌名

      Journal of Synchrotron Radiation

      巻: 18 ページ: 66-69

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Catalytic mechanism of the primary human prostaglandin F_2α synthase, aldo-keto reductase 1B1-prostaglandin D_2 synthase activity in the absence of NADP(H)2011

    • 著者名/発表者名
      Nanae Nagata, Yukiko Kusakari, Yoshifumi Fukunishi, Tsuyoshi Inoue, Yoshihiro Urade
    • 雑誌名

      The FEBS Journal

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Atomic resolution structure of copper-containing nitrite reductase provides insights into common properties of type 2 copper-containing enzymes2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Fukuda, T. Tamada, H. Takami, T. Inoue, M. Nojiri
    • 学会等名
      Asian Crystallographic Association (AsCA) 2012
    • 発表場所
      Adelaide (Australia)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ブドウ由来フラボノール3位グルクロン酸転移酵素(VvGT5)のX線結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      井上豪
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西支部 第474回講演会
    • 発表場所
      京都府立大学合同講義棟第三講義室
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ブドウ由来糖転移酵素VvGT5のX線結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      井上豪
    • 学会等名
      第2回CSJ化学フェスタ(2012)
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ブドウ由来UDP糖依存性グリコシルトランスフェラーゼの基質特異性の構造基盤の解明2012

    • 著者名/発表者名
      井上豪
    • 学会等名
      平成24年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学片平キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural basis enzymes in the pyrimidine biosynthetic pathway of human malaria parasite Plasmodium falciparumfor in silicodrug design2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Takashima, E. Mizohata, K. Tokuoka, Y. Kusakari, T. Uchida, S. R. Krungkrai, H. Matsumura, J. Krungkrai, T. Horii, T. Inoue
    • 学会等名
      International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid(Spain)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural basis enzymes in the pyrimidine biosynthetic pathway of human malaria parasite Plasmodium falciparum for in silico drug design2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Takashima, E.Mizohata, K.Tokuoka, Y.Kusakari, T.Uchida, S.R.Krungkrai, H.Matsumura, J.Krungkrai, T.Horii, T.Inoue
    • 学会等名
      International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid (Spain)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Trypanosoma cruzi由来Old Yellow Enzymeの阻害剤複合体の結晶構造2010

    • 著者名/発表者名
      山口桂史、岡本尚毅、徳岡啓司、杉山成、溝端栄一、松村浩由、伊中浩治、内山奈穂子、裏出良博
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      北海道・札幌市
    • 年月日
      2010-06-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Novel Approach for Growth of High-Quality and Large Protein Crystals2010

    • 著者名/発表者名
      H. Matsumura, K. Kakinouchi, N. Shimizu, S. Sugiyama, Y. Takahashi, M. Maruyama, R. Murai, H. Adachi, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, Y. Mori
    • 学会等名
      3th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules
    • 発表場所
      Dublin(Ireland)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Protein Crystallization in Agarose Gel with High Strength2010

    • 著者名/発表者名
      S. Sugiyama, M. Hirose, R. Murai, Y. Takahashi, M. Maruyama, G. Sazaki, H. Adachi, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, H. Matsumura
    • 学会等名
      3th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules
    • 発表場所
      Dublin(Ireland)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Development of the new protein crystallization techniques and application for structural analysis of target Enzymes

    • 著者名/発表者名
      T. Inoue, H. Adachi, K. Takano, H. Matsumura, S. Murakami, Y. Mori
    • 学会等名
      The 10th KIAS Conference on Protein Structure for structural and Function
    • 発表場所
      Korea Institute for Advanced Study, Seoul, Korea
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考] 井上豪Home Page

    • URL

      http://www.chem.eng.osaka-u.ac.jp/~inoue-tken/ja/staffs/inoue/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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