クロマチン構造変換にかかわるRNA分子の新規機能

• 研究課題/領域番号: 22570132
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 機能生物化学
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 奥脇 暢 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (50322699)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: クロマチン / 核小体 / リボソーム / RNP複合体 / RNA / ヒストンシャペロン / 遺伝子 / 細胞核 / Nucleophosmin

研究概要

本研究ではクロマチン構造変換にかかわるRNA分子の同定を目的として研究を進めた。核小体タンパク質Nucleophosmin/B23のヒストンシャペロン活性に影響を及ぼすRNA分子の機能について検討を行った。B23は核小体クロマチン制御において、RNAとの複合体形成が重要であることを明らかにした。B23のRNA結合特異性を決定する分子基盤についても明らかになった。さらにB23とともに働くRNA分子の同定を進め、いくつかの候補RNAが同定された。

研究成果

• [雑誌論文] B23/Nucleophosmin is involved in regulation of adenovirus chromatin structure at late infection stages, but not in its replication and transcription (2012)
  • 著者名/発表者名: Abdus MD.Samad, et al
  • 雑誌名: Journal of General Virology 巻: (In press) 号: 6 ページ: 1328-1338
  • DOI: 10.1099/vir.0.036665-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functions of homo- and hetero-oligomers of human Nucleoplasmin/Nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2, and NPM3 during sperm chromatin remodeling (2012)
  • 著者名/発表者名: Okuwaki M, Sumi A, Hisaoka M, Saotome-Nakamura A, Akashi S, Nishimura Y, Nagata K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 号: 11 ページ: 4861-4878
  • DOI: 10.1093/nar/gks162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of Template Activating Factor-I as a chaperone in linker histone dynamics (2011)
  • 著者名/発表者名: Kato K, Okuwaki M, Nagata K
  • 雑誌名: J Cell Sci 巻: 124(Pt 19) 号: 19 ページ: 3254-65
  • DOI: 10.1242/jcs.083139
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of nucleolar chromatin by B23/nucleophosmin jointly depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF (2010)
  • 著者名/発表者名: Hisaoka M, Ueshima S, Murano K, Nagata K, Okuwaki M
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 巻: 30(20) 号: 20 ページ: 4952-64
  • DOI: 10.1128/mcb.00299-10
  • NAID: 120007137916
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of nucleolar chromatin by B23/Nucleophosmin jointly depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF (2010)
  • 著者名/発表者名: Miharu Hisaoka
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biology 巻: 30 ページ: 4952-4964
  • 査読あり
• [学会発表] 核小体タンパク質Nucleophosmin/B23 のRNA結合特性の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 久岡美晴、永田恭介、奥脇暢
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学、東京
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] 核小体形成におけるRNP 複合体の核小体クロマチンへの集合機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上島州平、永田恭介、奥脇暢
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学、東京
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] Formation and maintenance of the nucleolus by RNA and RNA binding proteins (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: The 2nd Meeting on RNA and Biofunctions-ASIA Study
  • 発表場所: レオパレスホテル、福岡市
  • 年月日: 2013-01-09
• [学会発表] 核小体タンパク質Nucleophosmin/B23のRNA結合特性の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 久岡美晴
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学
• [学会発表] 核小体形成におけるRNP複合体の核小体クロマチンへの集合機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上島州平
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学
• [学会発表] 核小体形成におけるRNAとRNA 結合タンパク質の協調的な働き (2012)
  • 著者名/発表者名: 奥脇 暢
  • 学会等名: 第30回染色体ワークショップ・第11回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場、兵庫
  • 年月日: 2012-12-19
• [学会発表] Maintenance of the nucleolar structure by acidic RNA binding proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] Interaction between H2A/H2B heterodimer and the acidic domain of histone chaperone hNap1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Moriwaki Yoshihito, Mitsuru Okuwaki, Kyosuke Nagata, Yasuto Todokoro, Masahiko Sato, Aritaka Nagadoi, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] Assembly and maintenance of the nucleolar structure by RNA and RNA binding proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: Human Biology Symposium-Biology and Regenerative Medicine
  • 発表場所: つくば国際会議場、茨城
  • 年月日: 2012-10-31
• [学会発表] ヒストンシャペロンによる核小体クロマチンの制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛、久岡美晴、永田恭介、奥脇暢
  • 発表場所: 広島大学、広島
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 天然変性タンパク質Nucleolin による核小体クロマチン制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛、奥脇暢
  • 学会等名: 第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター 大阪
  • 年月日: 2012-01-24
• [学会発表] 分子間・分子内相互作用による核小体ヒストンシャペロンNPM1 のRNA 結合活性の制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター 大阪
  • 年月日: 2012-01-24
• [学会発表] 分子間・分子内相互作用による核小体ヒストンシャペロンNPM1のRNA結合活性の制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター
  • 年月日: 2012-01-24
• [学会発表] 天然変性タンパク質Nucleolinによる核小体クロマチン制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛
  • 学会等名: 第2回新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター
  • 年月日: 2012-01-24
• [学会発表] 核小体形成におけるRNAとRNA結合タンパク質の協調的な働き (2012)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第30回染色体ワークショップ・第11回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場
• [学会発表] Interaction between H2A/H2B heterodimer and the acidic domain of histone chaperone hNap1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Moriwaki Yoshihiro
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
• [学会発表] Maintenance of the nucleolar structure by acidic RNA binding proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
• [学会発表] Function of homo- andhetero-oligomers of humanNucleophosmin/Nucleoplasmin familyproteins, NPM1, NPM2, and NPM3in sperm chromatin remodeling (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki, Ayako Sumi, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Intramolecular regulation of the RNA binding activity of nucleolar protein nucleophosmin/B23 (2011)
  • 著者名/発表者名: Miharu Hisaoka, Kyosuke Nagata, Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Nopp140 regulates rRNA production in both RNA -dependent and -independent manners (2011)
  • 著者名/発表者名: Ueshima Shuhei, Kyosuke Nagata, Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Nopp140 regulates rRNA production in both RNA dependent and -independent manners (2011)
  • 著者名/発表者名: 上島州平
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Function of homo- and hetero-oligomers of human Nucleophosmin/Nucleoplasmin family proteins, NPM1, NPM2, and NPM3 in sperm chromatin remodeling (2011)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Intramolecular regulation of the RNA binding activity of nucleolar protein nucleophosmin/B23 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久岡美晴
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] ヒストンH1結合因子によるクロマチン動態制御機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 加藤広介、奥脇暢、永田恭介
  • 学会等名: 核ダイナミクス研究会
  • 年月日: 2011-10-26
• [学会発表] ヒストンH1結合因子によるクロマチン動態制御機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 加藤広介
  • 学会等名: 核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2011-10-26
• [学会発表] RNA-mediated chromatin association of a nucleolar histone chaperone NucleolinRNA-mediated chromatin association of a nucleolar histone chaperone Nucleolin (2011)
  • 著者名/発表者名: Ai Saotome and Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: EMBO Workshop Nuclear Structure and Dynamics
  • 発表場所: Isle sur la Sorgue, France
  • 年月日: 2011-09-30
• [学会発表] 熱帯熱マラリア原虫pf1-cys-prx 遺伝子cis-element に結合する新奇核内因子の同定およびその性状の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 駒木-安田加奈子、奥脇暢、永田恭介、河津信一郎、狩野繁之
  • 学会等名: 日本寄生虫学会年会
  • 発表場所: 東京慈恵会医科大学、東京
  • 年月日: 2011-07-19
• [学会発表] 熱帯熱マラリア原虫pf1-cys-prx遺伝子cis-elementに結合する新奇核内因子の同定およびその性状の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 駒木-安田加奈子
  • 学会等名: 第80回日本寄生虫学会総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-07-19
• [学会発表] Histone H1 chaperone-dependent histone H1 dynamics and transcriptional regulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kohsuke Kato
  • 学会等名: Interational Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: 兵庫県
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] 核小体ヒストンシャペロンNucleolinのRNAによる機能制御機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 核小体ヒストンシャペロンNucleolinのRNAによる機能制御機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛、奥脇暢
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸国際会議場、神戸
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 核小体形成の生化学的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢、上島州平、永田恭介
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸国際会議場、神戸
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] TAF-I is a linker histone chaperone in the mammalian somatic cell nucleus (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohsuke Kato, Mitsuru Okuwaki, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸国際会議場、神戸
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 核小体形成の生化学的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] TAF-I is a linker histone chaperone in the mammalian somatic cell nucleus (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohsuke Kato
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] Nucleolar Chromatin Regulation by B23/Nucleophosmin depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF. (2010)
  • 著者名/発表者名: Miharu Hisaoka, Mitsuru Okuwaki, Shuhei Ueshima, Kensaku Murano, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: 9thEMBL conference : Transcription and Chromatin
  • 発表場所: Heidelberg, Germany
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] TAF-I, a novel somatic linker histone chaperone, is involved in chromatin dynamics (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohsuke Kato, Mitsuru Okuwaki, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: 9th EMBL conference : Transcription and Chromatin
  • 発表場所: Heidelberg, Germany
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] Nucleolar chromatin regulation by B23/nucleophosmin depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF (2010)
  • 著者名/発表者名: Miharu Hisaoka
  • 学会等名: 9^<th> EMBL conference : Transcription and chromatin
  • 発表場所: ドイツ・ハイデルベルグ
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] TAF-I, a novel somatic linker histone chaperone, is involved in chromatin dynamics (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohsuke Kato
  • 学会等名: 9^<th> EMBL conference : Transcription and chromatin
  • 発表場所: ドイツ・ハイデルベルグ
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] Function of Upstream Binding Factor in the Organization of Nucleolus (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: Wellcome Trust Scientific Conference, Sub-nuclear Structure and Functions
  • 発表場所: Cambridge, UK
  • 年月日: 2010-07-28
• [学会発表] Function of Upstream Binding Factor in the Organization of Nucleolus (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: Wellcome Trust Scientific Conference, Sub-nuclear Structure and Fucntions
  • 発表場所: 英国・ケンブリッジ
  • 年月日: 2010-07-28
• [学会発表] RNAによるヒストンシャペロンNucleolin (NCL) の機能制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛、奥脇暢
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺、静岡
  • 年月日: 2010-05-28
• [学会発表] RNAによるヒストンシャペロンNucleolin(NCLI)の機能制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 早乙女愛
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 静岡県修善寺
  • 年月日: 2010-05-28
• [学会発表] Assembly and maintenance of the nucleolar structure by RNA and RNA binding proteins
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Okuwaki
  • 学会等名: Human Biology Symposium-Biology and Regenerative Medicine
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 招待講演
• [図書] タンパク質発現プロトコール (2010)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢 永田恭介
  • 総ページ数: 268
  • 出版者: 羊土社
• [備考]
  • URL: http://www.md.tsukuba.ac.jp/younginit/okuwaki/Oku1/Top.html
• [備考]
  • URL: http://www.md.tsukuba.ac.jp/younginit/okuwaki/Okul/Top.html