ゲノム不安定を導くトポイソメラーゼ1の小RNA分子による調節機構

• 研究課題/領域番号: 22570169
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 小林 牧 京都大学, 大学院・医学研究科, 准教授 (20400690)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2012年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: non-B DNA / AID / 免疫グロブリン / miRNA / 免疫グロブリン遺伝子 / DNA切断 / Non-B DNA / Topoisomerase1 / RNA編集 / 翻訳調節

研究概要

シチジンデアミナーゼAID の活性化に引き続き、Topoisomerase1(Top1)の翻訳抑制が起きる分子メカニズム解明を進め、miRNAの関与、Ago2のTop1 mRNAへの結合、さらに詳細な結合部位が明らかになった。さらにAID依存性にTop1 mRNAに結合するmiRNAの同定中である。

研究成果

• [雑誌論文] The AID Dilemma: Infection, or Cancer? (2013)
  • 著者名/発表者名: Tasuku Honjo, Maki Kobayashi, Nasim Begum, Ai Kotani, Somayeh Sabour and Hitoshi Nagaoka
  • 雑誌名: Adv Cancer Res 巻: vol.113 ページ: 1-44
  • DOI: 10.1016/b978-0-12-394280-7.00001-4
  • 査読あり
• [雑誌論文] In vivo analysis of Aicda gene regulation: a critical balance between upstream enhancers and intronic silencers governs appropriate expression (2013)
  • 著者名/発表者名: Le Thi Huong, Maki Kobayashi,et al
  • 雑誌名: PLoSONE 巻: vol.8 号: 4 ページ: e61433-e61433
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0061433
  • 査読あり
• [雑誌論文] In vivo analysis of Aicda gene regulation: a critical balance between upstream enhancers and intronic silencers governs appropriate expression (2013)
  • 著者名/発表者名: Le Thi Huong
  • 雑誌名: PLosONE 巻: 未定
  • 査読あり
• [雑誌論文] An evolutionary view of the mechanism for immune and genome diversity (2012)
  • 著者名/発表者名: Lucia Kato, Andre Stanlie, Nasim A Begum, Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Tasuku Honjo
  • 雑誌名: J Immunol 巻: vol. 188 号: 8 ページ: 3559-3566
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1102397
  • 査読あり
• [雑誌論文] The AID Dilemma: Infection, or Cancer? (2012)
  • 著者名/発表者名: Tasuku Honjo
  • 雑誌名: Advances in Cancer Research 巻: 113 ページ: 1-44
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decrease in topoisomerase I is responsible for activation-induced cytidine deaminase (AID)-dependent somatic hypermutation (2011)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi,Zahra Sabouri et al
  • 雑誌名: PNAS USA 巻: vol,108 号: 48 ページ: 19305-19310
  • DOI: 10.1073/pnas.1114522108
  • NAID: 120003692414
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preventing AID, a physiological mutator, from deleterious activation: regulation of the genomic instability that is associated with antibody diversity (2010)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Nagaoka, Thinh Huy Tran, Maki Kobayashi, M a s a t o s h i A i d a a n d T a s u k u H o n j o
  • 雑誌名: International Immunology 巻: vol 22 号: 4 ページ: 227-235
  • DOI: 10.1093/intimm/dxq023
  • NAID: 10027391988
• [雑誌論文] Preventing AID, a physiological mutator, from deleterious activation : regulation of the genomic instability that is associated with antibody diversity (2010)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Nagaoka, Thinh Huy Tran, Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Tasuku Honjo.
  • 雑誌名: International Immunology 巻: 22 ページ: 227-235
  • NAID: 10027391988
• [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination (2013)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi et al
  • 学会等名: Keystone Meeting, Noncoding RNAs in Development and Cancer
  • 発表場所: Fairmont Hotel Vancouver
  • 年月日: 2013-01-22
• [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination (2012)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi et al
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination (2012)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi et al
  • 学会等名: 第41回日本免疫学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2012-12-06
• [学会発表] AID-induced Ago2 binding to the 3' UTR of Topoisomerase I (Top1) mRNA is associated with Top1 decrease, which is responsible for somatic hypermutation and class switch recombination (2012)
  • 著者名/発表者名: M Kobayashi, J Xu, Z Sabouri, S Sabouri,Y Kitawaki, Y Sasaki, Y Pommier, T Honjo
  • 学会等名: Keystone Symposia - Mutations, Malignancy and Memory - Antibodies and Immunity (C6)
  • 発表場所: ボストンパークプラザホテル
  • 年月日: 2012-03-19
• [学会発表] AID-induced Ago2 binding to the 3' UTR of Topoisomerase I (Top1) mRNA is associated with Top1 decrease, which is responsible for somatic hypermutation and class switch (2012)
  • 著者名/発表者名: M Kobayashi, J Xu, Z Sabouri, S Sabouri, Y Kitawaki, Y Sasaki, Y
  • 学会等名: Keystone Symposia-Mutations, Malignancy and Memory-Antibodies and Immunity (C6)
  • 発表場所: ボストンパークプラザホテル
  • 年月日: 2012-03-19
• [学会発表] Decrease in topoisomerase I is responsible for AID-dependent somatic hypermutation (2011)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi1, Zahra Sabouri1, Somayeh Sabouri1 and Tasuku Honjo
  • 学会等名: 第23回日本分子生物学会、シンポジウム「ゲノムダイナミクス」
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] AID-induced Topoisomerase1 reduction regulates somatic hypermutation frequency (2011)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Zahra Sabouri, Masatoshi Aida, Yoko Kitawaki, and Tasuku Honjo
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Begum and Tasuku Honjo. AID-induced decrease in topoisomerase1 induces DNA structural alteration and DNA cleavage for class switch r e c o m b i n a t i o n (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Hitoshi Nagaoka, Nasim A
  • 学会等名: C o l d S p r i n g H a r b o r Meeting on Gene expression and signaling in the immune system
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, New York
• [学会発表] Epigenetic regulationof S region chromatin is essential to AID-induced S region DNA cleavage by topoisomerase 1 (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, M a s a t o s h i A i d a , A n d r e Stanlie, Nasim A. Begum, Hitoshi Nagaoka and Tasuku Honjo
  • 学会等名: International AID workshop: from Immune Diversification to Cancer
  • 発表場所: Stockholm、Sweden
• [学会発表] Topoisomerase1 regulates AID-induced DNA cleavage (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Zahra Sabouri, Masatoshi Aida, Yoko Kitawaki, and Tasuku Honjo
  • 学会等名: 14thInternational congress of immunology
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Transcription Factors Sox13 Regulates the Hematopoietic Expression of GATA2 in Vertebrate Embryos (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi-Osaki, Makoto Kobayashi, Miki Takeuchi and Masayuki Yamamoto
  • 学会等名: 9th Japanese Biochemical Society Bio-Frontier Symposium 2010, 5th International Symposium on GATA factors
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Topoisomerase1 regulates AID-induced DNA cleavage (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Somayeh Sabouri, Zahra Sabouri, Yoko Kitawaki, and Tasuku Honjo
  • 学会等名: Biochemistry and Molecular Biology2010
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] AID-induced decrease in topoisomerase1 induces DNA structural alteration and DNA cleavage for class switch recombination. (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Hitoshi Nagaoka, Nasim A.Begum, Tasuku Honjo.
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Meeting on Gene expression and signaling in the immune system
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, New York.
• [学会発表] Epigenetic regulation of S region chromatin is essential to AID-induced S region DNA cleavage by topoisomerase 1. (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Andre Stanlie, Nasim A.Begum, Hitoshi Nagaoka, Tasuku Honjo.
  • 学会等名: International AID workshop : from Immune Diversification to Cancer
  • 発表場所: Stockholm Sweden(招待講演)
• [学会発表] Topoisomerase1 regulates AID-induced DNA cleavage. (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Zahra Sabouri, Masatoshi Aida, Yoko Kitawaki, Tasuku Honjo.
  • 学会等名: 14^<th> International congress of immunology
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Transcription Factors Sox13 Regulates the Hematopoietic Expression of GATA2 in Vertebrate Embryos. (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi-Osaki, Makoto Kobayashi, Miki Takeuchi, Masayuki Yamamoto.
  • 学会等名: 9th Japanese Biochemical Society Bio-Frontier Symposium 2010, 5th International Symposium on GATA factors.Sendai
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Topoisomerase1 regulates AID-induced DNA cleavage. (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki Kobayashi, Somayeh Sabouri, Zahra Sabouri, Yoko Kitawaki, Tasuku Honjo.
  • 学会等名: Biochemistry and Molecular Biology2010
  • 発表場所: 神戸