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トランスポゾン様遺伝子の進化的多様化と機能性非翻訳RNA解析

研究課題

研究課題/領域番号 22580005
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関鳥取大学

研究代表者

富田 因則  鳥取大学, 農学部, 准教授 (70207611)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードムギ類 / トランスポゾン / 進化 / RNA / 構造変異 / 翻訳領域 / 染色体 / クラスター / 遺伝子発現 / 発現量 / イスラエル / 環境 / 遺伝子座 / オオムギ
研究概要

トランスポゾンRevolverの進化的な動きを、イスラエルのエボリューション・キャニオンの温暖乾燥斜面、冷涼湿潤斜面に自生するオオムギ野生種で調べた。温暖乾燥斜面では一定の0.7 kb RNAの強い発現、冷涼湿潤斜面では1 ~2 kbの多様なRNAが弱い発現が見られ、環境による劇的変異と最近の増幅活性が示唆された。第1エキソンの長短や第2イントロン欠失など多様なノンコーディングRNAの単離、転写開始点決定、大腸菌でのタンパク質合成、染色体クラスターの検出を行った。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (8件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Rye chromosome- specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the EcoO109I recognition site2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Seno, A.
    • 雑誌名

      Genome

      巻: 55(5) ページ: 370-382

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Rye chromosome-specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the EcoO 109I recognition site2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., Seno, A.
    • 雑誌名

      Genome

      巻: 55 号: 5 ページ: 370-382

    • DOI

      10.1139/g2012-024

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomic, RNA, and ecological divergences of the Revolvertransposon- like multi-gene family in Triticeae2011

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., Okutani, A., Beiles, A., and Nevo, E.
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology

      巻: 11 号: 1 ページ: 269-269

    • DOI

      10.1186/1471-2148-11-269

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Divergent PCR products of Revolver transposon showing cluster-like chromosomal distribution2013

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Tanaka, E
    • 学会等名
      日本育種学会第123回講演会, 育種学研究15
    • 発表場所
      東京農業大学
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Divergent PCR products of Revolver transposon showing cluster-like chromosomal distribution.2013

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Tanaka, E.
    • 学会等名
      日本育種学会第123回講演会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Revolverトランスポゾン様多重遺伝子族のゲノム、RNAおよび生態における多様な変異2012

    • 著者名/発表者名
      富田因則、Nevo, E.
    • 学会等名
      日本育種学会第120回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Cluster-like chromosomal distribution of Revolver transposon and its transcription initiation site in Secale cereale2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Kanzaki, T
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Revolverトランスポゾン様多重遺伝子族のゲノム、RNAおよび生態における多様な変異, 育種学研究142012

    • 著者名/発表者名
      富田因則、Nevo, E
    • 学会等名
      日本育種学会第120回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Cluster-like chromosomal distribution of Revolver transposon and its transcription initiation site in Secale cereale.2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Kanzaki, T.
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Sequence-tagged rye chromosome-specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the EcoO 109I recognition site2011

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., Seno, A.
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフイコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      2011-12-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Sequence-tagged rye chromosome-specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the Eco0109I recognition site2011

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M., and Seno, A.
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 植物のゲノム育種.新バイオの扉 "未来に拓く生物工学"2013

    • 著者名/発表者名
      富田因則, 高木正道・池田友久
    • 出版者
      裳華房
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 植物のゲノム育種.”新バイオの扉 生物工学の広がり“ (高木正道・池田友久 編)2013

    • 著者名/発表者名
      富田因則
    • 総ページ数
      312
    • 出版者
      裳華房
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Recent patent on Revolver-2: a novel transposon-like gene useful for chromosome tags of rye. In New Developments in Chromatin Research2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M, Eds. Neil M. Simpson and Valerie J. Stewart
    • 出版者
      Nova Science Publishers
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Recent patent on Revolver-2: a novel transposon-like gene useful for chromosome tags of rye. In New Developments in Chromatin Research (Eds. Neil M. Simpson and Valerie J. Stewart, ISBN 978-1-62081-816-9)2012

    • 著者名/発表者名
      Tomita, M.
    • 総ページ数
      247
    • 出版者
      Nova Science Publishers, New York
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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