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ニワトリの国際スタンダードSNPマーカー作製およびその解析システムを構築する

研究課題

研究課題/領域番号 22580319
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用動物科学
研究機関広島大学

研究代表者

西堀 正英  広島大学, 大学院・生物圏科学研究科, 准教授 (80237718)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードニワトリ / SNP / マーカー / DigiTag2 / 国際スタンダード / 96 組 / 集団解析 / 個体識別 / 96組
研究概要

SNPs は遺伝病や経済的特性の原因遺伝子特定, 遺伝的多様性解析に用いられている。本研究では SNPs 解析ツールの DigiTag2 法で用いるニワトリ SNPs マーカーを作製し,ヤケイとびニワトリの遺伝的類縁関係の解明のために DigiTag2 法による SNPs の検出を試みた。遺伝的類縁関係解析で、 14 集団が各々のクラスターを作った。総合同値確率(ある個体と別の個体とを誤判定する確率)が 2.70×10-20 となり, 作出した SNPs マーカーを用いれば理論的に世界中全ての鶏(2011 年の世界の鶏飼育羽数 1.99 × 1010)の個体識別を行うことが可能であることが明らかとなった。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件)

  • [雑誌論文] Genetic relationships between Japanese native and commercial breeds using 70 chicken autosomal SNP genotypes by the DigiTag2 assay2012

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Shimogiri , Nao Nishida, Miyuki Kudo, Kousuke Niwa , Masahide Nishibori, Keiji Kinoshita, Shin Okamoto, Yoshizane Maeda, Katsushi Tokunaga, and Hiroshi Yasue
    • 雑誌名

      Animal Genetics

      巻: 43(1) ページ: 98-103

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic Analysis of Native Chicken from Bangladesh and Neighboring Asian Countries Based on Complete Sequence of Mitochondrial DNA D-loop Region2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammed A. Islam, and Masahide Nishibori
    • 雑誌名

      Journal of Poultry Science

      巻: 49(4) ページ: 237-243

    • NAID

      10031120749

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Islam. Production and price of indigenous naked neck and full feathered chicken reared under rural scavenging system in Bangladesh2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammad F. Ahmed, Masahide Nishibori,and Mohammed A
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural Extension and Rural Development

      巻: 4(4) ページ: 92-97

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic Analysis of Native Chicken from Bangladesh and Neighboring Asian Countries Based on Complete Sequence of Mitochondrial DNA D-loop Region.2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammed A. Islam
    • 雑誌名

      J. Poult. Sci.

      巻: 49(4) ページ: 237-243

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Production and price of indigenous naked neck and full feathered chicken reared under rural scavenging system in Bangladesh2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammad F. Ahmed
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural Extension and Rural Development

      巻: 4(4 ページ: 92-97

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic relationships between Japanese native and commercial breeds using 70 chicken autosomal SNP genotypes by the DigiTag2 assay2012

    • 著者名/発表者名
      Shimogiri T, Nishida N, et al., 他8名
    • 雑誌名

      Animal Genetics

      巻: 43(1) 号: 1 ページ: 98-103

    • DOI

      10.1111/j.1365-2052.2011.02206.x

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Japanese Silkie fowls are widely distributed in the phylogenetic tree derived from mitochondrial complete D-loop nucleotide sequences2011

    • 著者名/発表者名
      Jahan Rowshan, Miyuki Kumagae, Masahide Nishibori, Hiroshi Yasue and Yasuhiko Wada
    • 雑誌名

      Journal of Poultry Science

      巻: 48(3) ページ: 176-180

    • NAID

      10029282702

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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