機能性小分子RNAの網羅的解析による筋線維型調節機構の解明

• 研究課題/領域番号: 22580326
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用動物科学
• 研究機関: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構
• 研究代表者: 室谷 進 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産草地研究所畜産物研究領域, 上席研究員 (50355062)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: ウシ / 筋線維型 / 骨格筋 / マイクロRNA / 次世代シーケンサー

研究概要

骨格筋部位間に特性の違いをもたらすマイクロRNA(miRNA)の網羅的発現解析を実施したところ、計192の既知miRNAと計20の新規ウシmiRNA候補配列が得られた。このうち、半腱様筋と咬筋で比較すると、2倍以上の発現差がある分子種が62%を占めた。miR-196a,-196b,-885が半腱様筋特異的に発現することが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] Profiling of differentially expressed microRNA and the bioinformatic target gene analyses in bovine fast- and slow-type muscles by massively parallel sequencing (2013)
  • 著者名/発表者名: Muroya S, Taniguchi M, Shibata M, Oe M, Ojima K, Nakajima I, Chikuni K
  • 雑誌名: J Anim Sci 巻: 91(1) 号: 1 ページ: 90-103
  • DOI: 10.2527/jas.2012-5371
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differences in mRNA expression of calpains, calpastatin isoforms and calpain/calpastatin ratios among bovine skeletal muscles (2012)
  • 著者名/発表者名: 室谷進, Neath KE, 中島郁世, 大江美香, 柴田昌宏, 尾嶋孝一, 千國幸一
  • 雑誌名: Animal Science Journal 巻: 83 号: 3 ページ: 252-259
  • DOI: 10.1111/j.1740-0929.2011.00954.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of High Ambient Temperature on Plasma 3-methylhistidine Concentration and Expression of Muscle Calpain and Calpastatin mRNA in High-yielding Lactating Holstein Cows (2012)
  • 著者名/発表者名: 神谷充, 室谷進, 神谷裕子, 鎌田寿彦, 田中正仁
  • 雑誌名: 日本暖地畜産学会報 巻: 55(In press)
  • NAID: 130004959444
  • 査読あり
• [雑誌論文] Influence of different feeding systems on the growth performance and muscle development of Japanese Black steers (2011)
  • 著者名/発表者名: 柴田昌宏, 松本和典, 曳野泰子, 大江美香, 尾嶋孝一, 中島郁世, 室谷進, 千國幸一
  • 雑誌名: Meat Science 巻: 89 号: 4 ページ: 451-456
  • DOI: 10.1016/j.meatsci.2011.05.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteome analysis of whole and water-soluble proteins in masseter and semitendinosus muscles of Holstein cows (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Oe
  • 雑誌名: Animal Science Journal 巻: 82 ページ: 181-186
  • 査読あり
• [雑誌論文] Desmin and troponin T are degraded faster in type IIb muscle fibers than in type I fibers during postmortem aging of porcine muscle (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Muroya
  • 雑誌名: Meat Science 巻: 86 ページ: 764-769
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of muscle type on beef taste-traits assessed by an electric sensing system (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Chikuni
  • 雑誌名: Animal Science Journal 巻: 81 ページ: 600-605
  • 査読あり
• [学会発表] 次世代シーケンサーによるウシ骨格筋microRNAの網羅的発現解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 室谷進,谷口雅章(生物研),柴田昌宏,大江美香,尾嶋孝一,中島郁世,千國幸一
  • 学会等名: 日本畜産学会第116回大会
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 2013-03-31
• [学会発表] 次世代シーケンサーによるウシ骨格筋microRNAの網羅的発現解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 室谷進,谷口雅章,柴田昌宏,大江美香,尾嶋孝一,中島郁世,千國幸一
  • 学会等名: 日本畜産学会第116回大会
  • 発表場所: 安田女子大学（広島）
• [学会発表] 放牧飼養下における黒毛和種子牛の筋機能関連因子mRNA発現 (2013)
  • 著者名/発表者名: 木戸恭子,室谷進,渡邊康一,麻生久
  • 学会等名: 日本畜産学会第116回大会
  • 発表場所: 安田女子大学（広島）
• [学会発表] 放牧及び飼料イネWCS給与が黒毛和種去勢牛の肥育成績、筋肉内遺伝子発現に及ぼす影響 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柴田昌宏,松本和典,曳野泰子,室谷進,大江美香,中島郁世,千國幸一,大谷一郎,山本直幸
  • 学会等名: 日本畜産学会第116回大会
  • 発表場所: 安田女子大学（広島）
• [学会発表] 牛肉熟成中のドリップにおけるトロポニンTペプチド含量の経時変化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 室谷進, 大江美香, 柴田昌宏, 中島郁世, 尾嶋孝一, 千國幸一
  • 学会等名: 日本畜産学会第115回大会
  • 発表場所: 名古屋大学(愛知県)
• [学会発表] Structural functions of skeletal muscle-specific calpain-3 in Ca2+ efflux from the sarcoplasmic reticulum (2011)
  • 著者名/発表者名: 尾嶋孝一, Ono, Y., Ottenheijm, C., Hata, S., Suzuki, H., 大江美香, 中島郁世, 室谷進, Granzier, H., Sorimachi, H.
  • 学会等名: 2011 Annual Meeting of the American Society for Cell Biology
  • 発表場所: コロラド州デンバー(アメリカ)
• [学会発表] Effect of grazing in the latter fattening period on the nutrient content and gene expression in steer muscle (2011)
  • 著者名/発表者名: 柴田昌宏, 松本和典, 曳野泰子, 室谷進, 大江美香, 中島郁世, 尾嶋孝一, 千國幸一
  • 学会等名: 57th International Congress of Meat Science and Technology
  • 発表場所: ゲント(ベルギー)
• [学会発表] Fatty acids modulate adipocyte growth and development in pig : an approach from cell culture study (2011)
  • 著者名/発表者名: 中島郁世, 大江美香, 尾嶋孝一, 室谷進, 柴田昌宏, 千國幸一
  • 学会等名: 57th International Congress of Meat Science and Technology
  • 発表場所: ゲント(ベルギー)
• [学会発表] Effects of grass-fed and grain-fed diets on expression of genes for muscle development in Japanese Black steers (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Shibata
  • 学会等名: 56th International Congress of Meat Science and Technology
  • 発表場所: 済州島(韓国)
• [備考]
  • URL: http://chk-nilgs.naro.affrc.go.jp/org/mprt/index.html