| 研究課題/領域番号 |
22590300
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
人類遺伝学
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| 研究機関 | 山形大学 |
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研究代表者 |
田宮 元 山形大学, 医学部, 教授 (10317745)
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| 研究分担者 |
植木 優夫 山形大学, 医学部, 助教 (10515860)
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| 研究期間 (年度) |
2010 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
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| キーワード | SNP-GWAS / SNPs / ゲノムワイド関連解析 / モデル選択 / 変数選択 / 遺伝子×遺伝子相互作用 / 高次元変数選択 / 量的形質 |
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| 研究概要 |
多因子疾患の標準的な SNP-GWAS(ゲノムワイド関連解析)データを網羅的に用いて、「遺伝子×遺伝子相互作用」を検出するための、新しい遺伝統計学的手法を開発することを目的として、周辺回帰と罰則付回帰分析とを組み合わせた高次元変数選択の手法をゲノムワイド遺伝子×遺伝子相互作用解析に適用した遺伝統計アルゴリズムを開発した。また、それを安価な環境で実装し、 5000人× 50万 SNPの GWASデータで網羅的な相互作用検索を数時間以内に実行するソフトウェアプログラムを開発した。
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