三連四重極型質量分析計による尿バイオマーカーのハイスループット多項目同時定量

• 研究課題/領域番号: 22590881
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腎臓内科学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 吉田 豊 新潟大学, 医歯学系, 講師 (40182795)
• 研究分担者: 山本 格 新潟大学, 医歯学系, 教授 (30092737)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 腎臓学 / 尿バイオマーカー / 尿プロテオーム / 分析化学 / 質量分析 / 多項目同時定量 / AKIバイオマーカー / 尿バイオマーカーパネル化

研究概要

尿のプロテオミクス解析と、尿に出現する糸球体局在タンパク質の探索により、尿細管傷害マーカー(NGAL、 L-FABP、 KIM-1、 Megalin)、糸球体傷害マーカー(podocalyxin、 SHPS-1、 Crumbs-like protein 2)をバイオマーカーとして選択し、三連四重極型質量分析計のSRMモードで定量するための条件を決定し、同時多項目定量法の至適化を行うところまで到達した。

研究成果

• [雑誌論文] Profiling and annotation of human kidney glomerulus proteome (2013)
  • 著者名/発表者名: Cui Z, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Nameta M, Magdeldin S, Makiguchi T, Ikoma T, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteome Sci 巻: 11 号: 1 ページ: 13-13
  • DOI: 10.1186/1477-5956-11-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Profiling of kidney vascular endothelial cell plasma membrane proteins by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Liu Z, Xu B, Nameta M, Zhang Y, Magdeldin S, Yoshida Y, Yamamoto K, Fujinaka H, Yaoita E, Tasaki M, Nakagawa Y, Saito K, Takahashi K, Yamamoto T
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol 巻: 掲載予定 号: 3 ページ: 327-337
  • DOI: 10.1007/s10157-012-0708-1
  • NAID: 10031184238
  • 査読あり
• [雑誌論文] Murine colon proteome and characterization of the protein pathways. (2012)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S
  • 雑誌名: BioData Min. 巻: 5 号: 1 ページ: 11-11
  • DOI: 10.1186/1756-0381-5-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic approach to human kidney glomerulus prepared by laser microdissection from frozen biopsy specimens: exploration of proteome after removal of blood-derived proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y, Nameta M, Kuwano M, Zhang Y, Bo X, Magdeldin S, Cui Z, Fujinaka H, Yaoita E, Tomonaga T, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteomics Clin Appl 巻: 6 号: 7-8 ページ: 412-417
  • DOI: 10.1002/prca.201200016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of human glomerulus proteomic profiles obtained from low quantities of samples by different mass spectrometry with the comprehe nsive database (2011)
  • 著者名/発表者名: Ying Zhang
  • 雑誌名: Proteome Science 巻: VOL.9 号: 1 ページ: 47-57
  • DOI: 10.1186/1477-5956-9-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Usage of electrostatic eliminator reduces human keratin contamination significantly in gel-based proteomics analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: 許波
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: VOL.74 号: 7 ページ: 1022-1029
  • DOI: 10.1016/j.jprot.2011.03.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel expression of claudin-5 in glomerular podocytes (2011)
  • 著者名/発表者名: Koda R, Zhao L, Yaoita E, Yoshida Y, Tsukita S, Tamura A, Nameta M, Zhang Y, Fujinaka H, Magdeldin S, Xu B, Narita I, Yamamoto T
  • 雑誌名: Cell Tissue Res 巻: 343(3) 号: 3 ページ: 637-48
  • DOI: 10.1007/s00441-010-1117-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential proteomic shotgun analysis elucidates involvement of water channel aquaporin 8 in presence of α-amylase in the colon (2010)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S, Li H, Yoshida Y, Satokata I, Maeda Y, Yokoyama M, Enany S, Zhang Y, Xu B, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 9 号: 12 ページ: 6635-46
  • DOI: 10.1021/pr100789v
  • 査読あり
• [雑誌論文] Glomerular proteins related to slit diaphragm and matrix adhesion inthe foot processes are highly tyrosine phosphorylated in the normal ratrat kidney. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Zhang
  • 雑誌名: Nephrol.Dial.Transplant. 巻: 25 ページ: 1785-1795
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional proteomic analysis of experimental autoimmune myocarditis-Induced chronic heart failure in the rat (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Sanzen
  • 雑誌名: Biol.Pharm.Bull. 巻: 33 ページ: 477-486
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of two dimensional electrophoresis of mouse colonProteomes before and after knocking out Aquaporin 8 (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Magdeldin
  • 雑誌名: J Proteomics 巻: 10 ページ: 2031-2010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential proteomic shotgun analysis elucidates involvement of water Channel aquaporin 8 in presence of alpha-amylase in the colon. (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Magdeldin
  • 雑誌名: J Proteome Res. 巻: 6 ページ: 6635-6646
  • 査読あり
• [学会発表] Comparative proteomic analysis of human glomerulus prepared by laser microdissection from frozen and FFPE kidney tissues (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Yoshida
  • 学会等名: 8th Management Committee meeting of the COST action EuroKUP (BM 0702)
  • 発表場所: Athens, Aegeon Hotel(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-30
• [学会発表] Increased identification of low-abundance, insoluble proteins of glomerulus laser-microdissected from frozen tissue sections exposed to repeated PBS washing (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y et al
  • 学会等名: 第11回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ボストン(アメリカ合衆国)
• [学会発表] HKUPP: Human Kidney andUrine Proteome Project (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田 豊
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会(第10回日本ヒト プロテオーム機構)
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 凍結腎生検試料からLaser microdissectionにより調製した糸球体のプロテオーム解析:血液由来タンパク質の除去 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会(第10回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Increased identification of low-abundance, insoluble proteins of glomerulus laser-microdissected from frozen tissue sections exposed to repeated PBS washing. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Yoshida
  • 学会等名: 第11回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ボストン (アメリカ合衆国）
• [学会発表] HKUPP: Human Kidney and Urine Proteome Project. (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田 豊
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会（第10回日本ヒトプロテオーム機構）
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] Extensive profiling of human urine proteome : construction of SRM transitions for quantification of urinary biomarkers for acute and chronic kidney diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Yoshida
  • 学会等名: HUPO 2011 10th World Congress
  • 発表場所: Geneva, Palexepo Conference hall
  • 年月日: 2011-09-06
• [学会発表] Verification and standardization of comparative proteomic analysis of human glomeruli prepared by laser microdissection from frozen block (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Yoshida
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会サテライトシンポジウム
  • 発表場所: 新潟朱鷺メッセ(招待講演)
  • 年月日: 2011-07-30
• [学会発表] 健常人尿プロテオームの特徴:AKIバイオマーカーの多項目同時測定の基礎的検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊
  • 学会等名: 第54回日本腎臓学会
  • 発表場所: 横浜パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-06-15
• [学会発表] Extensive profiling of human urine proteome: construction of SRM transitions for quantification of urinary biomarkers for acute and chronic kidney diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y et al
  • 学会等名: 第10回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ジュネーブ(スイス連邦)
• [学会発表] 正常ヒト尿プロテオームの特徴:AKIバイオマーカーの多項目同時測定の基礎的検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会(第9回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] On-site proteomics study on laser microdissected rat renal cortex and human glomerulus tissues (2010)
  • 著者名/発表者名: Xu Bo
  • 学会等名: 国際プロテオーム機構第9回国際大会
  • 発表場所: シドニー
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Verification and standardization of comparative proteomic analysis of human glomerululi prepared by laser microdissection from frozen block (2010)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Yoshida
  • 学会等名: 国際プロテオーム機構第9回国際大会
  • 発表場所: シドニー
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] High confidence proteomic profile of minute amount of human kidney glomeruli (2010)
  • 著者名/発表者名: Ying Zhang
  • 学会等名: 国際プロテオーム機構第9回国際大会
  • 発表場所: シドニー
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] In-depth analysis of aquaporin 8 knockout mice colon using tandem mass spectrometry (2010)
  • 著者名/発表者名: Sameh Magdeldin
  • 学会等名: 国際プロテオーム機構第9回国際大会
  • 発表場所: シドニー
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Exploring resistant determinants of methicillin in Staphylococcus Aureuswith comparative proteomics approach. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shymaa Enany
  • 学会等名: 国際プロテオーム機構第9回国際大会
  • 発表場所: シドニー
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] High confidence proteomic profile of minute amount of human kidney glomeruli (2010)
  • 著者名/発表者名: 張螢
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2010年大会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-26
• [学会発表] Laser microdissectionを用いた腎生検試料の糸球体プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2010年大会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-26
• [学会発表] In-depth proteomic analysis of secretome of European community-Acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (2010)
  • 著者名/発表者名: Enany Shymaa
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2010年大会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-26
• [学会発表] Laser microdissectionを用いたホルマリン固定標本のon-siteプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 許波
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2010年大会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-26
• [学会発表] Proteomic profiling of aquaporin 8 knockout mice reveals its involvement in alpha amylase regulation (2010)
  • 著者名/発表者名: Magdaldin Sameh
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2010年大会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-26
• [学会発表] High confidence proteomic profile of minute amount of human kidney glomeruli (2010)
  • 著者名/発表者名: 張螢
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] ホルマリン固定標本とLaser microdissectionを用いたon-siteプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 許波
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] Laser microdissectionとLC-MSを用いた腎生検試料の糸球体プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-06-17
• [学会発表] Proteomic analysis elucidates involvement of water channel aquaporin 8 in alpha amylase regulation (2010)
  • 著者名/発表者名: Magdaldin Sameh
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-06-17
• [学会発表] 尿中インスリン様成長因子結合蛋白(IGFBP)の意義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 藤中秀彦
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-06-16
• [学会発表] Verification and standardization of comparative proteome analysis of human glomeruli prepared by laser microdissectionfrom frozen block (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y
  • 学会等名: 第9回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: シドニー(オーストラリア連邦)
• [学会発表] Laser microdissectionとLC-MSを用いた腎生検試料の糸球体プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会学術総会
  • 発表場所: 神戸
• [備考]
  • URL: http://hkupp.kir.jp
• [備考] Human Kidney and Urine Proteome Project
  • URL: http://www.hkupp.org/
• [備考]
  • URL: http://hkupp.kir.jp/DB.html
• [備考]
  • URL: http://www.hkupp.org/