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ハテナ・アレニコラの次世代シーケンスを用いた核ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 22657024
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 生物多様性・分類
研究機関筑波大学

研究代表者

井上 勲  筑波大学, 生命環境系, 教授 (70168433)

研究分担者 中山 剛  筑波大学, 生命環境系, 講師 (40302369)
研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
3,280千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 180千円)
2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2010年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードゲノム / 細胞内共生 / 進化
研究概要

カタブレファリス類に属するハテナ・アレニコラは細胞内に一時的に共生藻を保持し、二次共生の中間段階にあると考えられている。しかし、本生物は培養ができないため、核ゲノム解析に十分なDNA量を確保することが困難である。そこで、本生物の1.数細胞を全ゲノム増幅試薬に供し、どの程度その核ゲノムが解読できるか確かめることを目的とし、研究を行った。結果、ハテナ複数細胞を用いた場合、ハテナ由来の配列を得ることに成功したが、得られた配列のうちの約9割が2.4塩基の繰り返し配列であった。残りの約1割の配列に対し、BLASTxを行った結果、ハテナ由来と思われる配列が得られたが、この情報量ではハテナの核ゲノム全体をカバーするには非常に難しく、さらなる条件検討が必要であると判断した。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Symbiotic Chlorella vulgaris of the ciliate Paramecium bursaria plays an important role in maintaining perialgal vacuole membrane functions.2011

    • 著者名/発表者名
      Kodama Y , Inouye I & Fujishima M.
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 162 号: 2 ページ: 288-303

    • DOI

      10.1016/j.protis.2010.06.005

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spheroid bodies in rhopalodiacean diatoms were derived from a single endosymbiotic cyanobacterium.2011

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, T, Ikegami, Y, Nakayama, T, Ishida, K.-I, Inagaki Y & Inouye I.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research.

      巻: 124 号: 1 ページ: 93-97

    • DOI

      10.1007/s10265-010-0355-0

    • NAID

      10027701764

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Green-colored plastids in the dinoflagellate genus Lepidodinium are of core chlorophyte origin.2011

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto T, 他5名, Nakayama T, Inouye I, HashimotoT & Inagaki Y.
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 162 号: 2 ページ: 268-276

    • DOI

      10.1016/j.protis.2010.07.001

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomy and Phylogeny of a New Kleptoplastidal Dinoflagellate, Gymnodinium myriopyrenoides sp.nov.(Gymnodiniales, Dinophyceae), and its Cryptophyte Symbiont2011

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Nakayama T, Kai A, Inouye I
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 162 号: 4 ページ: 650-667

    • DOI

      10.1016/j.protis.2011.01.002

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomy of Nephroselmis viridissp. nov. (Nephroselmidophyceae, Chlorophyta), a sister marinespecies to freshwater N. olivacea.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Suda S, Nakayama, T,Pienaar R. N, Chihara M & Inouye I
    • 雑誌名

      J. Plant Res

      巻: 124 号: 1 ページ: 49-62

    • DOI

      10.1007/s10265-010-0349-y

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomy and phylogeny of a new kleptoplastidal dinoflagellate, Gymnodinium myriopyrenoides sp.nov.(Gymnodiniales, Dinophyceae), and its cryptophyte symbiont2011

    • 著者名/発表者名
      Haruyo Yamaguchi, Takeshi Nakayama, Atsushi Kai, Isao Inouye
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 162 ページ: 650-667

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taxonomy of Nephroselmis viridis sp.nov.(Nephroselmidophyceae, Chlorophyta), a sister marine species to freshwater N.olivacea2010

    • 著者名/発表者名
      Haruyo Yamaguchi, Shoichiro Suda, Takeshi Nakayama, Richard N Pienaar, Isao Inouye
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 124 ページ: 49-62

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 渦鞭毛藻に見られる現在進行中の共生現象2011

    • 著者名/発表者名
      山口晴代, 井上勲
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2011年度連合大会
    • 発表場所
      幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-26
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 藻類から見た地球進化と地球環境2011

    • 著者名/発表者名
      井上勲
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合大会2011年度連合大会
    • 発表場所
      幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-26
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 藻類から見た地球進化と地球環境2011

    • 著者名/発表者名
      井上勲
    • 学会等名
      地球惑星科学連合2011年連合大会
    • 発表場所
      幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] NBRP「藻類」:未来を支える藻類リソース2011

    • 著者名/発表者名
      山口晴代, 井上勲
    • 学会等名
      地球惑星科学連合2011年連合大会
    • 発表場所
      幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Hatena arenicolaは近縁な複数種のNephroselmisを共生体とする2010

    • 著者名/発表者名
      山口晴代, 中山剛, 井上勲
    • 学会等名
      第74回日本植物学会
    • 発表場所
      中部大学
    • 年月日
      2010-09-11
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] NBRP「藻類」:未来を支える藻類リソース2010

    • 著者名/発表者名
      笠井文絵, 川井浩史, 井上勲, 中山剛, 河地正伸, 中山卓郎, 石渡邉信, 山岸隆博, 石田健一郎, 渡邉信
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] NBRP「藻類」:日本における藻類の収集・保存・提供.ナショナルバイオリソースプロジェクトの活動2010

    • 著者名/発表者名
      河地正伸, 川井浩史, 井上勲, 中山剛, 石田健一郎, 渡邉信, 羽生田岳昭, 山岸隆博, 甲斐厚, 中山卓郎, 笠井文絵
    • 学会等名
      第62回日本工学会大会
    • 発表場所
      宮崎市シーガイヤ
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] NBRP「藻類」:日本における藻類の収集・保存・提供-ナショナルバイオリソースプロジェクトの活動2010

    • 著者名/発表者名
      河地正伸, 川井浩史, 井上勲, 中山剛, 石田健一郎, 渡邉信, 羽生田岳昭, 山岸隆博, 甲斐厚, 中山卓郎, 笠井文絵
    • 学会等名
      第62回日本工学会大会
    • 発表場所
      宮崎市シーガイア
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2016-04-21  

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