ヘテロ複合体の形成を制御・促進する汎用タグの開発

• 研究課題/領域番号: 22657028
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 姚 閔 北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 准教授 (40311518)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,520千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
• キーワード: X線結晶解析 / 蛋白質工学 / 遺伝子工学 / タグ / ヘテロ複合体 / 多量体形 / バイオインフォマティクス

研究概要

ヘテロ複合体の形成を制御・促進する汎用タグHA-tagを開発するため,まず,タンパク質立体構造のデータベースPDBに登録された3A分解能以上のタンパク質結晶構造から, in silicoでタグの候補ペプチドを探索した.見つけたいくつかの候補ペプチド(Coiled-coil)と,転写因子SarS(自己ダイマー)およびribosomalタンパク質P1-P2(ヘテロダイマー)の内,最終的に2種類のヘテロダイマータグ2HA-tagを選抜した.それらのタグをモデルタンパク質へ融合し, 2HA-tagがヘテロ複合体の形成に及ぼす効果について検討している.

研究成果

• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of eIF5BΔN and the eIF5BΔN-eIF1AΔN complex (2011)
  • 著者名/発表者名: Aiping Zheng, Reo Yamamoto, Masaaki Sokabe, Isao Tanaka and Min Yao
  • 雑誌名: Acta Cryst. 巻: F67 号: 6 ページ: 730-733
  • DOI: 10.1107/s1744309111015910
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roll : a new algorithm for the detection of protein pockets and cavities with a rolling probe sphere (2010)
  • 著者名/発表者名: Jian Yu, Yong Zhou, Isao Tanaka and Min Yao
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 26 号: 1 ページ: 46-52
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btp599
  • NAID: 120002695775
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preliminary X-ray crystallographic study of the receptor-binding domain of the D/C mosaic neurotoxin from Clostridium botulinum (2010)
  • 著者名/発表者名: Nipawan Nuemket, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao and Isao Tanaka
  • 雑誌名: Acta Cryst. 巻: F66 号: 5 ページ: 608-610
  • DOI: 10.1107/s1744309110012182
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray studies of azoreductases from Bacillus sp. B29 (2010)
  • 著者名/発表者名: Daiki Ogata, Toshihiko Ooi, Takaaki Fujiwara, Seiichi Taguchi, Isao Tanaka and Min Yao
  • 雑誌名: Acta Cryst. 巻: F66 号: 5 ページ: 503-505
  • DOI: 10.1107/s1744309110007785
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray studies of azoreductases from Bacillus sp.B29 (2010)
  • 著者名/発表者名: D.Ogata
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F 巻: F66 ページ: 503-505
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preliminary X-ray crystallographic study of the receptor-binding domain of the D/C mosaic neurotoxin from Clostridium botulinum (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Nuemket
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F 巻: F66 ページ: 608-610
  • 査読あり
• [備考]
  • URL: http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/index.html
• [備考]
  • URL: http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/Research/POCASA_e.html