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相同的組み換え蛋白質を用いた新しい核内ゲノムマッピング法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22657044
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 分子生物学
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

前島 一博  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (00392118)

研究分担者 高田 英昭  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (20455207)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 510千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2011年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワード核酸 / ゲノム / 生体分子
研究概要

従来、ゲノムDNA上の特定配列を細胞内で標識するためには、激しい処理で二本鎖DNAを解離させる必要があり、細胞構造のダメージが大きかった。本研究では相同的組換え蛋白質を用いて、蛍光標識したDNA配列を温和な条件でゲノムDNA 上にターゲットさせることを試みた。組換え蛋白質である大腸菌RecA蛋白質・真核生物XRad51蛋白質と固定した培養細胞を用い、特定のゲノムDNA配列のターゲッティングをおこなったが、非特異的な結合が多く、ゲノムDNA上の特定配列を細胞内で効率的に標識することはできなかった。一方、これに代わる手段として、特定のDNA配列を認識できる蛍光ポリアミド化合物を合成し、固定した細胞のゲノム上のテロメア配列の効率的な標識に成功した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 15件) 学会発表 (15件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] ヒトゲノムDNAの不規則で柔軟な収納原理2013

    • 著者名/発表者名
      前島一博、城地保昌、西野吉則、高田英昭、鎌田福美、日原さえら
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 53 ページ: 4-10

    • NAID

      10031139018

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The organisation of genomic DNA in mitotic chromosomes: a novel view2013

    • 著者名/発表者名
      Takata H., Matsunaga, S., Maeshima, K
    • 雑誌名

      In Greilhuber, J., Leitch, I., Wendel, J.,Dolezel, J

      ページ: 33-34

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The organisation of genomic DNA in mitotic chromosomes: a novel view2013

    • 著者名/発表者名
      H. Takata
    • 雑誌名

      Plant Genome Diversity

      巻: 2 ページ: 33-34

    • DOI

      10.1007/978-3-7091-1160-4_3

    • ISBN
      9783709111598, 9783709111604
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chromosomes without a 30-nm chromatin fiber2012

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti、Takaaki Hikima、Yoshinori Nishino、Fukumi Kamada、Saera Hihara、Hideaki Takata、Tetsuya Ishikawa、Kazuhiro Maeshima
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 3巻 号: 5 ページ: 404-410

    • DOI

      10.4161/nucl.21222

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human mitotic chromosomes consist predominantly of irregularly folded nucleosome fibres without a 30-nm chromatin structure2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Nishino、Mikhail Eltsov、Yasumasa Joti、Kazuki Ito、Hideaki Takata、Yukio Takahashi、Saera Hihara、Achilleas S Frangakis、Naoko Imamoto、Tetsuya Ishikawa、Kazuhiro Maeshima
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 31巻 号: 7 ページ: 1644-1653

    • DOI

      10.1038/emboj.2012.35

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The integrator complex is required for the integrity of Cajal bodies2012

    • 著者名/発表者名
      H.Takata
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 125 号: 1 ページ: 166-175

    • DOI

      10.1242/jcs.090837

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear Size, Nuclear pore number, and Cell Cycle2011

    • 著者名/発表者名
      K.Maeshima
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 2 号: 9 ページ: 113-118

    • DOI

      10.1038/nsmb.1878

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Irregular folding of nucleosomes in the cell (Commentary)2011

    • 著者名/発表者名
      Takata, H.
    • 雑誌名

      Physics of Life Reviews

      巻: 8 号: 1 ページ: 51-52

    • DOI

      10.1016/j.plrev.2011.01.005

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear Size, Nuclear Pore Number, and Cell Cycle2011

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: (In press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Irregular folding of nucleosomes in the cell (Comment).2011

    • 著者名/発表者名
      Takata H
    • 雑誌名

      Phys.Life Rev.

      巻: 8 ページ: 51-52

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] New insight into the mitotic chromosome structure : irregular folding of nucleosome fibres?2011

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 雑誌名

      Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology

      巻: (In press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear pore formation but not nuclear growth is governed by cyclin-dependent kinases (Cdks) during interphase.2010

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 雑誌名

      Nat.Struct.Mol.Biol.

      巻: 17 ページ: 1065-1071

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chromatin structure : does the 30-nm fibre exist in vivo?2010

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 雑誌名

      Curr.Opin.Cell Biol.

      巻: 22 ページ: 291-297

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure of mitotic chromosomes : irregular folding of nucleosome fibers?2010

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 雑誌名

      Advances in Chromosome Science

      巻: 3 ページ: 72-75

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Live imaging system for visualizing nuclear pore complex (NPC) formation during interphase in mammalian cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Iino H
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 15 ページ: 647-666

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ヒトテロメア配列に特異的に結合するタンデム型 ピロール・イミダゾールポリアミドの合成2013

    • 著者名/発表者名
      河本佑介
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂期染色体におけるDNAの収納2012

    • 著者名/発表者名
      前島一博
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第19回臨床細胞遺伝学セミナー
    • 発表場所
      東京慈恵会医科大学
    • 年月日
      2012-08-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] "How is a long strandof DNA organized in the cells?"2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Lorentz Center Workshop "Genome Mechanics at the Nuclear Scale", Leiden
    • 発表場所
      Leiden,Netherlands
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] "Human genome organization and dynamics Paradigm Innovation in Biology2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Academia Sinica,
    • 発表場所
      Taipei,
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] "Human genome organization and dynamics"2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] How is a long strand of DNA organized in the cells?2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Lorentz Center Workshop “Genome Mechanics at the Nuclear Scale”
    • 発表場所
      Leiden, Netherlands
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Human genome organization and dynamics2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Paradigm Innovation in Biology
    • 発表場所
      Academia Sinica ,Taipei,Taiwan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Human genome organization and dynamics2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      第50 回日本生物物理学会年会 シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 分裂期染色体におけるDNAの収納2012

    • 著者名/発表者名
      前島一博
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第19回臨床細胞遺伝学セミナ
    • 発表場所
      東京慈恵会医科大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生きた細胞の動的クロマチン構造2011

    • 著者名/発表者名
      日原さえら
    • 学会等名
      第1回細胞環境の測定とモデリングワークショップ(第4回JSBi応用システムバイオロジー研究会)
    • 発表場所
      神戸(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] How is a Long Strand of DNA Compacted into a Chromosome?2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Albany 2011 : 17^<th> Conversation
    • 発表場所
      Albany, SUNY, NY, USA(招待講演)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Mitotic chromosome structure : irregular folding of nucleosome fibers without the 30-nm chromatin fiber2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      Gordon Research Conference : Chromosome Dynamics
    • 発表場所
      Mount Snow Resort, VT, USA
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] How can we know the chromatin environment in living cells?-Structural analysis of mitotic chromosomes in living cells-2011

    • 著者名/発表者名
      Saera Hihara
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      姫路
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] How is a long strand of genomic DNA organized into chromosome?2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      姫路
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] How is a long strand of DNA compacted into a chromosome?2010

    • 著者名/発表者名
      Maeshima K
    • 学会等名
      IUBS International workshop Structural and functional diversity of the eukaryotic genome
    • 発表場所
      Brno, Czech Republic
    • 年月日
      2010-11-14
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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