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魚類ゲノムの低い連鎖不平衡を活用した有用遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 22658057
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 水産学一般
研究機関東京大学

研究代表者

菊池 潔  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

研究期間 (年度) 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
2010年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワード魚類 / 連鎖不平衡 / 性決定 / ゲノム / トラフグ / 進化
研究概要

近年、穀類を中心とした農業生物を対象とする遺伝学的研究の進展により、有用遺伝子座のみならず有用遺伝子の本体が次々と同定されているが、食用魚類において有用遺伝子本体が同定された例はない。本研究では、食用魚類で初となる有用遺伝子本体の遺伝学的な同定を試みた。解析対象としては、高級食用魚であるトラフグの付加価値を左右する精巣形成能を選んだ。
トラフグは、XX-XY型の性決定様式を持ち、その性を決定する遺伝子は、課題代表者らが作製したフグゲノム地図(Fugu version5, http://www.fugu-sg.org/)による大規模連鎖マッピングにより、30-50kbのゲノム領域に存在することが示されていた。性決定遺伝子を同定するため、まず、本領域のリシーケンス解析により、多型サイトの網羅的な同定をおこなった。次に、本領域の連鎖不平衡状態を調べたところ、その度合いが著しく低いことが明らかとなった。これは、トラフグが比較的長期間にわたり大きな有効集団サイズを維持してきたことを示唆している。トラフグは乱獲によって個体数が減少していると考えられているが、その影響は連鎖不平衡状態には未だ反映されていないようであった。次に、連鎖不平衡マッピングをおこなったところ、性決定領域を一つの遺伝子にまで絞り込むことに成功した。この性決定遺伝子情報を基盤とすることにより、トラフグの性を迅速に判別する方法が開発可能となった。脊椎動物の性決定遺伝子は、これまでに、哺乳類のSRY、メダカのDMY、アフリカツメガエルのDM-Wしか同定されていない。本研究の成果は、新しい性決定遺伝子の存在を示しており、基礎科学的にも高い価値を持つと考えられる。

報告書

(1件)
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (3件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] フグ類の多様化をもたらした遺伝子の探索-種間交雑を利用したゲノムワイドマッピング-2010

    • 著者名/発表者名
      菊池潔, ら
    • 雑誌名

      月刊海洋

      巻: Vol.42 ページ: 363-371

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Genetic Basis of Parallel Evolution for the Spiny Scale in the Rapid Radiation of Pufferfishes.2011

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi, ら
    • 学会等名
      The 20th CDB Meeting Molecular Bases for Evolution of Complex Traits.
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2011-02-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] トラフグ初期生殖腺器官培養系を用いたFSHの機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      松藤由佳, ら
    • 学会等名
      日本動物学会第81回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] フグにおける形態多様化の遺伝的背景:種間交配を利用したゲノムワイド連鎖解析2010

    • 著者名/発表者名
      甲斐渉、細谷将、菊池潔, ら
    • 学会等名
      日本進化学会第12回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考] 投稿中の以下の論文が、acceptable with minor revisionsという状態である。

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考] Kai, Kikuchiら"Integration of the Genetic Map and Genome Assembly of Fugu Facilitates Insights into Distinct Features of Genome Evolution ln Teleosts and Mammals." Genome Biology and Evolution, (acceptable with minor revisions)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [産業財産権] フグの雌雄を判別する方法2010

    • 発明者名
      宮台俊明、菊池潔、鈴木康仁、鈴木譲
    • 権利者名
      宮台俊明、菊池潔、鈴木譲
    • 出願年月日
      2010-12-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2016-04-21  

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