ヒト病理組織のアダクトーム解析

• 研究課題/領域番号: 22659072
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 人体病理学
• 研究機関: 浜松医科大学
• 研究代表者: 椙村 春彦 浜松医科大学, 医学部, 教授 (00196742)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,030千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 330千円); 2011年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2010年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
• キーワード: DNA付加体 / adductome / 炎症 / 脂質過酸化物 / 胃がん / 塩基除去修復LC-MS / ゲノム / 塩基除去修復 / LC-MS / DNA修復 / 遺伝子多型 / がんの分子疫学 / 変異原 / 環境発がん

研究概要

がん周囲組織にあるDNA付加体10種類(すでにannotation済み)の量と分布をhigh performance liquid chromatographyとtandem mass spectrometryを使用することによって、明らかにし、腫瘍の種類、腫瘍におこる変異のパターン、生活習慣(喫煙歴、アルコール歴)などと比較を行い、病理学的意義を明らかにすることをおこなったが、とくに、環境要因の異なる地域中国と日本で発生した胃がんの非腫瘍胃粘膜22例について上記のうち下記の7種について解析を行った。Seven lipid peroxidation related DNA adducts, 1, N6-etheno-2'-deoxyadenosine(εdA), butanone-etheno-2'-deoxycytidine(BεdC), butanone-etheno-2'-deoxy-5-methylcytidine(BεmedC), butanone-etheno-2'-deoxyadenosine(BεdA), heptanone-etheno-2'-deoxycytidine(HεdC), heptanone-etheno-2'-deoxyadenosine(HεdA), and heptanone-etheno-2'-deoxyguanosine(HεdG)これらの7種の付加体レベルは0から3万個/10^9塩基対の範囲でヒト胃粘膜に存在したが、そのprofileを判別解析することによって、日本と中国のoriginを判別することができた。上記の課程であきらかになった6個の主として脂質代謝の結果生じた修飾塩基を含む30merのオリゴヌクレオチドを合成し、大腸菌で精製した以下の修復酵素タンパクと混和し、修復活性のある組み合わせを同定し、gene-environmental interactionの生物学的基礎を調べたところ、TDG(Thymine DNA glycosylase)の関与が推定され、その機能的解析のために、制御発現システムを作成した。

研究成果

• [雑誌論文] Germline alterations of the CDH1 gene in familial gastric cancer in the Japanese population (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamada, H., Shinmura, K., Ito, H., Kasami, M., Sasaki, N., Shima, H., Ikeda, M., Tao, H., Goto, M., Ozawa, T., Tsuneyoshi, T., Tanioka, F., and Sugimura
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 103 ページ: 1782-1788
  • NAID: 10030243664
• [雑誌論文] Novel Single Nucleotide Polymorphism of the CYP2A13 gene in Japanese individuals (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamaki, Y., Honda, M., Muroi, Y., Arai, T., Sugimura, H., Matsubara, Y., Kanno, S., Ishikawa, M., Hirasawa, N., and Hiratsuka, M.
  • 雑誌名: Drug Metab Pharmacokinet 巻: 26(5) ページ: 544-547
  • NAID: 130004463219
• [雑誌論文] Genetic susceptibility to lung cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: Front Biosci 巻: 3 ページ: 1463-1477
• [雑誌論文] Germline alterations of the CDH1 gene in familial gastric cancer in the Japanese population (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamada H, et.al
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 102 号: 10 ページ: 1782-1788
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.02038.x
  • NAID: 10030243664
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel Single Nucleotide Polymorphism of the CYP2A13 gene in Japanese individuals (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamaki Y, Sugimura H, et al
  • 雑誌名: Drug Metab Pharmacokinet 巻: 26 ページ: 516-522
  • NAID: 130004463219
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic susceptibility to lung cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Sugimura H, et al
  • 雑誌名: Front Biosci 巻: 3 ページ: 1463-77
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detection of lipid peroxidation-induced DNA adducts caused by 4-oxo-2(E)-nonenal and 4-oxo-2(E)-hexenal in human autopsy tissues (2010)
  • 著者名/発表者名: Chou, P. H., Kageyama, S., Matsuda, S., Kanemoto, K., Sasada, Y., Oka, M., Shinmura, K., Mori, H., Kawai, K., Kasai, H., Sugimura, H., and Matsuda, T.
  • 雑誌名: Chem Res Toxicol 巻: 23(9) ページ: 1442-8
• [雑誌論文] Adenine DNA glycosylase activity of 14 Human MutY homolog(MUTYH) variant proteins found in patients with colorectal polyposis and cancer (2010)
  • 著者名/発表者名: Goto, M., Shinmura, K., Nakabeppu, Y., Tao, H., Yamada, H., Tsuneyoshi, T., and Sugimura, H.
  • 雑誌名: Hum Mutat 巻: 31
• [雑誌論文] Identification of 5 novel germline APC mutations and characterization of clinical phenotypes in Japanese patients with classical and attenuated familial adenomatous polyposis (2010)
  • 著者名/発表者名: Tao, H., Shinmura, K., Yamada, H., Maekawa, M., Osawa, S., Takayanagi, Y., Okamoto, K., Terai, T., Mori, H., Nakamura, T., and Sugimura, H.
  • 雑誌名: BMC Res Notes 巻: 3(1) ページ: 305-305
  • NAID: 120005305356
• [雑誌論文] Detection of lipid peroxidation-induced DNA adducts caused by 4-oxo-2 (E) -nonenal and 4-oxo-2(E)-hexenal in human autopsy tissues. (2010)
  • 著者名/発表者名: Chou PH, Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: Chem Res Toxicol 巻: 23 ページ: 1442-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Adenine DNA glycosylase activity of 14 Human MutY homolog (MUTYH) variant proteins found in patients with colorectal polyposis and cancer. (2010)
  • 著者名/発表者名: Goto M, Sugimura H., et al.
  • 雑誌名: Human Mutation 巻: 31
  • 査読あり
• [雑誌論文] Three novel NE1L1 promoter polymorphisms in gastric cancer patients. (2010)
  • 著者名/発表者名: Goto M, Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: World Journal of Gastrointestinal On cology 巻: 2 ページ: 117-120
  • 査読あり
• [雑誌論文] EPH-EPHRIN in human gastrointestinal cancers (2010)
  • 著者名/発表者名: Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: World Journal of Gastrointetinal Onc ology 巻: 2 ページ: 421-428
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between neuropeptide Y receptor 2 polymorphism and the smoking behavior of elderly Japanese. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato N, Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 55 ページ: 755-60
  • NAID: 10030737683
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between neurexin 1 (NRXN1) polymorphisms and the smoking behavior of elderly Japanese. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sato N, Sugimura H, et al.
  • 雑誌名: Psychiatr Genet 巻: 20 ページ: 1135-6
  • 査読あり
• [学会発表] 酸化的DNA損傷修復に関わる遺伝子多型とヒト発がん (2011)
  • 著者名/発表者名: 椙村春彦
  • 学会等名: 日本環境変異学会
  • 年月日: 2011-11-21
• [学会発表] 酸化的DNA損傷修復に関わる遺伝子多型とヒト発がん (2011)
  • 著者名/発表者名: 椙村春彦
  • 学会等名: 日本環境変異原学会
  • 発表場所: 学術総合センター(東京)
  • 年月日: 2011-11-21
• [学会発表] ヒトのcommonながんの遺伝的感受性について (2011)
  • 著者名/発表者名: 椙村春彦
  • 学会等名: 病理の立場から癌研セミナー
  • 発表場所: 癌研究会吉田講堂(東京)
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] ヒトがんの原因について北陸 (2011)
  • 著者名/発表者名: 椙村春彦
  • 学会等名: がんプロフェッショナルセミナー
  • 発表場所: 金沢大学(金沢)
  • 年月日: 2011-07-17
• [学会発表] 多様な嗜癖行動を物質依存の立場から考える遺伝子多型の観点から (2010)
  • 著者名/発表者名: Sugimura Haruhiko
  • 学会等名: 日本アルコール・薬物医学会、日本アルコール精神医学会、ニコチン・薬物依存研究フォーラム平成22年度合同学術総会シンポジウム
  • 発表場所: リーガロイヤルホテル小倉(福岡県北九州市小倉北区浅野2-14-2)
  • 年月日: 2010-10-07
• [図書] Glioma : Glioblastoma part 2 in Tumors of Central Nervous System, edt by Hayat, Springer (2011)
  • 著者名/発表者名: Sugimura H, et al.
• [図書] Gliomas : Glioblastoma (Part 2) ISBN 978-94-007-0617-0 (2011)
  • 著者名/発表者名: Sugimura H, et al (分担)
  • 総ページ数: 458
  • 出版者: Springer