On-siteプロテオミクスによるIgA腎症・膜性腎症の抗原同定と発症機序解明

• 研究課題/領域番号: 22659165
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 腎臓内科学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 許 波 新潟大学, 医歯学総合研究科, 研究員 (70463982)
• 研究分担者: 山本 格 新潟大学, 医歯学系, 教授 (30092737) ; 張 エイ 新潟大学, 医歯学総合研究科, 研究員 (00529472)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,300千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 300千円); 2012年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2010年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
• キーワード: IgA腎症 / 膜性腎症 / プロテオミクス / On-siteプロテオミクス

研究概要

IgA腎症と膜性腎症は免疫複合体の形成などに深く関わっていると考えられているが、その抗原についてはまだ不明な点が多い状況である。本研究はIgA腎症・膜性腎症の症例の10μm厚さの切片を特別な前処理を行った後、レーザーマイクロダイセックション(LMD)を用いて、切片から糸球体を切り出した。当研究室で開発したOn-siteプロテオミクス法で解析し、バイオインフォマテクス解析や疾患パスウェ解析に介して、正常糸球体検体と発現差異のあるタンパク質群はIgA・膜性腎症の発生機序への関わりを探求することを試みした。

研究成果

• [雑誌論文] Extracellular heat shock protein A9 is a novel interaction partner of podoplanin in oral squamous cell carcinoma cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Tsuneki
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 434 号: 1 ページ: 124-130
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.03.057
  • 査読あり
• [雑誌論文] Profiling of kidney vascular endothelial cell plasma membrane proteins by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Liu Z, Xu B, Nameta M, Zhang Y, Magdeldin S, Yoshida Y, Yamamoto K, Fujinaka H, Yaoita E, Tasaki M, Nakagawa Y, Saito K, Takahashi K, Yamamoto T
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol 巻: 掲載予定 号: 3 ページ: 327-337
  • DOI: 10.1007/s10157-012-0708-1
  • NAID: 10031184238
  • 査読あり
• [雑誌論文] Murine colon proteome and characterization of the protein pathways. (2012)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S
  • 雑誌名: BioData Min. 巻: 5 号: 1 ページ: 11-11
  • DOI: 10.1186/1756-0381-5-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Extensive proteomic profiling of the secretome of European community acquired methicillin resistant Staphylococcus aureus clone (2012)
  • 著者名/発表者名: Enany S, Yoshida Y, Magdeldin S, Zhang Y, Xu B, Yamamoto T
  • 雑誌名: Peptides 巻: 37 号: 1 ページ: 128-37
  • DOI: 10.1016/j.peptides.2012.06.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic approach to human kidney glomerulus prepared by laser microdissection from frozen biopsy specimens: exploration of proteome after removal of blood-derived proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y, Nameta M, Kuwano M, Zhang Y, Bo X, Magdeldin S, Cui Z, Fujinaka H, Yaoita E, Tomonaga T, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteomics Clin Appl 巻: 6 号: 7-8 ページ: 412-417
  • DOI: 10.1002/prca.201200016
  • 査読あり
• [雑誌論文] "All and None" Refining Strategy; Fishing Your Correct Protein from Proteomics Ocean (2011)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S, Yoshida Y, Zhang Y, Xu B, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: J Proteomics Bioinform 巻: 4 ページ: 123-124
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of human glomerulus proteomic profiles obtained from low quantities of samples by different mass spectrometry with the comprehe nsive database (2011)
  • 著者名/発表者名: Ying Zhang
  • 雑誌名: Proteome Science 巻: VOL.9 号: 1 ページ: 47-57
  • DOI: 10.1186/1477-5956-9-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Usage of electrostatic eliminator reduces human keratin contamination significantly in gel-based proteomics analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: 許波
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: VOL.74 号: 7 ページ: 1022-1029
  • DOI: 10.1016/j.jprot.2011.03.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel expression of claudin-5 in glomerular podocytes (2011)
  • 著者名/発表者名: Koda R, Zhao L, Yaoita E, Yoshida Y, Tsukita S, Tamura A, Nameta M, Zhang Y, Fujinaka H, Magdeldin S, Xu B, Narita I, Yamamoto T
  • 雑誌名: Cell Tissue Res 巻: 343(3) 号: 3 ページ: 637-48
  • DOI: 10.1007/s00441-010-1117-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] プロテオミクスの試料調製 (2010)
  • 著者名/発表者名: 許波
  • 雑誌名: 日本腎臓学会誌 巻: 52 ページ: 495-498
  • NAID: 10026409300
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of two dimensional electrophoresis mouse colon proteomes before and after knocking out Aquaporin 8 (2010)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S, Li H, Yoshida Y, Enany S, Zhang YXB, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T.
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 73 ページ: 2031-2040
  • 査読あり
• [雑誌論文] Usage of electrostatic eliminator reduces human keratin contamination significantly in gel-based proteomics analysis.
  • 著者名/発表者名: Bo Xu, Ying Zhang, Zongjiang Zhao, Yutaka Yoshida, Sameh Magdeldin, Hidehiko Fujinaka, Tamer Ahmed Ismail, Eishin Yaoita, Tadashi Yamamoto.
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: In Press
  • 査読あり
• [学会発表] Proteomics analysis of laser microdissected FFPE glomerular sections from human IgA nephropathy biopsy specimens (2012)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Yoshida Y, Liu Z, Magdeldin S, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
  • 学会等名: 第11回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ボス トン(アメリカ合衆国)
• [学会発表] Proteomics analysis of laser microdissected FFPE glomerular sections from human IgA nephropathy biopsy specimens. (2012)
  • 著者名/発表者名: Xu Bo
  • 学会等名: 11th Annual World Congress of Human Proteome Organization (HUPO)
  • 発表場所: BOSTON, USA
• [学会発表] Comparison of on-site proteomics study on laser microdissected FFPE and frozen human glomerulus tissues (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 10th Annual World Congress of Human Proteome Organization (HUPO)
  • 発表場所: Room K, Geneva Palexpo, Geneva, Switzerland
  • 年月日: 2011-09-06
• [学会発表] Proteome research of murine liver tissues of NASH model mouse (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Zhang Y, Azlina E, Yamamoto T., et al
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
  • 年月日: 2011-07-29
• [学会発表] Proteomics results of small FFPE rat cortex tissues treated by 3 methods (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Zhang Y, Yaoita E, Yamamot T
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
  • 年月日: 2011-07-29
• [学会発表] Preparation of sample for proteomics research (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Yoshida Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Room 201, Toki Messe, Niigata(招待講演)
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] A VBA program for extracting keratin contamination from protecome analysis results (2011)
  • 著者名/発表者名: Makiguchi T, Xu B, Yoshida Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] Processing tool works on data of identified proteins exported by ions search engine (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikoma T,Xu B, Yamamoto T
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] Proteomic mapping oT kidney and liver endotheliai cell surface proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Liu Z, Xu B, Zhang Y, Yoshida Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
  • 発表場所: Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] Comparison of on-site proteomics study on laser microdissected FFPE and frozen human glomerulus tissues (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Magdeldin S, Fujinaka H, Yoshida Y, Yaoita Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 第10回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ジュネーブ(スイス連邦)
• [学会発表] Proteomics results of small FFPE rat cortex tissues treated by 3 methods (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Zhang Y, Shimada S, Maddeldin S, Yoshida Y, Yaoita E, Yamamot T
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会(第9回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Proteome research of murine liver tissues of NASH model mouse (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Takamura M, Zhang Y, Azlina E, Magdeldin S, Yoshida Y, Yaoita E, Yamamoto T
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会(第9回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Preparation of sample for proteomics research (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Yoshida Y, Yamamoto T
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会(第9回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Proteomics analysis on formalin-fixedparaffin-embedded human glomeruli using laser microdissection and on-site direct trypsin digestion (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Yoshida Y, Yaoita E, Morita T , Yamamoto T
  • 学会等名: 第54回日本腎臓学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] On-site Proteomics Study on Laser Microdissected Rat Renal Cortex and Human Glomerulus Tissues (2010)
  • 著者名/発表者名: Bo Xu, Shuichiro Shimada, YingZhang, Sameh Magdaldin, Hideo Fujinaka Yutaka Yoshida, Eisin Yaoita, Tadashi Yamamoto.
  • 学会等名: 2010 HUPO 9^<th> Annual World Congress
  • 発表場所: Exhibition Hall 5,Sydney Convention and Exhibition Centre,NSW,Australia
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Laser Microdissection法を用いたホルマリン固定標本のon-siteプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 許波、嶋田修一郎、張螢、五十島美千子、吉田豊、矢尾板永信、森田俊、山本格
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: インペリアホール・アメジスト&エメラルド、東京ベイホテル東急 1F
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] ホルマリン固定標本とLaser Microdissection法を用いたon-siteプロテオーム解析.;第53回日本腎臓学会.03-06-20. (2010)
  • 著者名/発表者名: 許波、嶋田修一郎、張螢、五十島美千子、吉田豊、矢尾板永信、山本格
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会
  • 発表場所: 第6会場(神戸国際会議場502会議室)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] On-site proteomics study on laser microdissected rat renal cortex and human glomerulus tissues (2010)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Magdeldin S, Fujinaka H, Yoshida Y, Yaoita E, Yamamoto T
  • 学会等名: 9th Annual World Congress of Human Proteome Organization (HUPO)
  • 発表場所: シドニー(オーストラリア連邦)
• [学会発表] Proteomics analysis on formalin-fixed paraffin-embedded tissue using laser microdissection and on-site direct trypsin digestion (2010)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Ikashima M, Yoshida Y, Yaoita E, Morita T , Yamamoto T
  • 学会等名: 第8回日本ヒトプロテオーム機構
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Proteomics study of formalin fixed paraffin embedded rat kidney by laser microdissection (2010)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Shimada S, Zhang Y, Ikashima M, Yoshida Y, Yaoita E, Yamamoto T
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会学術総会
  • 発表場所: 神戸
• [備考]
  • URL: http://hkupp.kir.jp