RNA修飾と自己識別:自己免疫疾患発症の新たな分子機構

• 研究課題/領域番号: 22659186
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 膠原病・アレルギー内科学
• 研究機関: 宮崎大学
• 研究代表者: 剣持 直哉 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (00133124)
• 連携研究者: 高柳 淳 慶應義塾大学, 医学部, 講師 (80245464)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,290千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 390千円); 2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2010年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
• キーワード: RNA修飾 / ノンコーディングRNA / 抗RNA抗体 / リボソームRNA / snoRNA / 自己免疫疾患 / RNA抗体 / ゼブラフィッシュ / 人工抗体ライブラリー

研究概要

生体内の機能性RNAは多数の修飾を受けている。RNA修飾と自己免疫疾患との関連を明らかにするために、RNAに結合する人工抗体の作製および修飾欠損モデル(ゼブラフィッシュ)の作製を試みた。その結果、自己抗体が結合するRNA部位(エピトープ)を認識する人工抗体の作製に成功した。また、ゼブラフィッシュのRNA修飾欠損モデルを用いて、脊椎動物の初期発生におけるRNA修飾の重要性を初めて明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Dissecting the protein-RNA interface : the role of protein surface shapes and RNA secondary structures in protein-RNA recognition (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwakiri, J., Tateishi, H., Chakraborty, A., Patil, P. and Kenmochi, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 ページ: 3299-3306
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Higa-Nakamine, S., Suzuki, T., Uechi, T., Chakraborty, A., Nakajima, Y., Nakamura, M., Hirano, N., Suzuki, T. and Kenmochi, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 ページ: 391-398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dissecting the protein-RNA interface : the role of protein surface shapes and RNA secondary structures in protein-RNA recognition (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwakiri J., Tateishi H., Chakraborty A., Patil P., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 号: 8 ページ: 3299-3306
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1225
  • 査読あり
• [雑誌論文] リボソーム病とp53経路 (2011)
  • 著者名/発表者名: 剣持直哉
  • 雑誌名: 医学のあゆみ(RNA医学・医療) 巻: 238 ページ: 476-480
• [雑誌論文] Guarding the' Translation Apparatus': Defective ribosome biogenesis and the p53 signaling pathway (2011)
  • 著者名/発表者名: Chakraborty, A., Uechi, T. and Kenmochi, N.
  • 雑誌名: Wiley Interdiscip Rev RNA 巻: 2 ページ: 507-522
  • 査読あり
• [雑誌論文] Erythropoiesis failure due to RPS19 deficiency is independent of an activated p53 response in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anaemia (2011)
  • 著者名/発表者名: Torihara, H., Uechi, U., Chakraborty, A., Shinya, M., Sakai N. and Kenmochi, N.
  • 雑誌名: Brit. J. Haematol 巻: 152 ページ: 648-654
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening of scFv-displaying phages recognizing distinct extracellular domains of EGF receptor by target-guided proximity labeling method (2011)
  • 著者名/発表者名: Chang, C., Takayanagi, A., Yoshida, T. and Shimizu, N.
  • 雑誌名: J. Immunol. Methods 巻: 372 ページ: 127-136
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: Higa-Nakamine S, Suzuki T (第2著者) 他7名
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40 号: 1 ページ: 391-398
  • DOI: 10.1093/nar/gkr700
  • 査読あり
• [雑誌論文] Erythropoiesis failure due to RPS19 deficiency is independent of an activated p53 response in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anaemia (2011)
  • 著者名/発表者名: Torihara H
  • 雑誌名: Br J Haematol 巻: 152(5) ページ: 648-654
  • 査読あり
• [雑誌論文] The NPC motif of aquaporin-11, unlike the NPA motif of known aquaporins, is essential for full expression of molecular function (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikeda M
  • 雑誌名: J.Biol.Chem 巻: 286(5) ページ: 3342-3350
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guarding the 'translation apparatus' : defective ribosome biogenesis and the p53 signaling pathway
  • 著者名/発表者名: Chakraborty A
  • 雑誌名: WIREs RNA 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Loss of snoRNA expression impairs ribosomal RNA modification and causes developmental defects in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Naoya Kenmochi
  • 学会等名: Protein-RNA Interactions in Biology and Disease
  • 発表場所: Santa Fe, USA
  • 年月日: 2012-03-04
• [学会発表] Loss of snoRNA expression impairs ribosomal RNA modification and causes developmental defects in zebrafish. (2012)
  • 著者名/発表者名: N. Kenmochi, S. Higa-Nakamine, T. Uechi, A. Chakraborty, Y. Nakajima, T. Suzuki and T. Suzuki
  • 学会等名: Protein-RNA Interactions in Biology and Disease
  • 発表場所: Santa Fe
• [学会発表] Identification and characterization of phage-displayed single chain antibodies recognizing U1 snRNA : A new method for generating anti-RNA antibodies (2011)
  • 著者名/発表者名: Prakash Patil
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Roles of protein surface shape and RNA secondary structure in protein-RNA recognition (2011)
  • 著者名/発表者名: Junichi Iwakiri
  • 学会等名: CBI/JSBi 2011合同学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2011-11-08
• [学会発表] RNA-protein interactions : Insights into the recognition mechanisms based on RNA secondary structures and protein surface shapes (2011)
  • 著者名/発表者名: Junichi Iwakiri
  • 学会等名: 第16回RNA Society Meeting "RNA 2011 Kyoto"
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-06-14
• [学会発表] タンパク質表面形状とRNA2次構造に基づくタンパク質-RNA相互作用部位の統計解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩切淳一
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2011-06-07
• [学会発表] リボソームの異常と赤血球形成不全:ゼブラフィッシュを用いた解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 上地珠代, 中島由香里, 鳥原英嗣, 剣持直哉
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Development of transgenic zebrafish using RNAi technology to investigate the role of ribosome in cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: G. V. Yadav, A. Chakraborty, T. Uechi and N. Kenmochi
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] When p53 senses faulty ribosomes : Dynamics of c-Myc target nucleolar proteins and their correlation with Tp53 response in Rpl11-deficient zebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Chakraborty, T. Uechi and N. Kenmochi
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Efficient Production of Recombinant Antibodies in Mammalian Cells by Transient Transfection of Expression Vectors with 2.5K "PEI-MAX" (2011)
  • 著者名/発表者名: 高柳淳, 吉田徹彦, 清水信義
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] ゼブラフィッシュをモデルとしたリボソーム病発症の分子機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 剣持直哉
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会(シンポジウム招待講演)
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Ribosomal stress and the p53 network : An activated Tp53 response in Rpl11-deficient. zebrafish correlates with an upregulated c-Myc activity (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Chakraborty, T. Uechi and N. Kenmochi
  • 学会等名: Protein Synthesis and Translational Control
  • 発表場所: Heidelberg
• [学会発表] Ribosomal integrity and p53 pathway : Induction of Tp53 in Rpl11-deficient zebrafish correlates with enhanced transcription of c-Myc and its target genes involved in ribosome biogenesis (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Chakraborty, T. Uechi and N. Kenmochi
  • 学会等名: RNA 2011 : Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Defective erythropoiesis and ribosomal dysfunction in zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Uechi, Y. Nakajima, H. Torihara and N. Kenmochi
  • 学会等名: RNA 2011 : Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] イントロンと共に進化するsnoRNA遺伝子の構成 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉浜麻生
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 高次構造に着目したタンパク質-RNA相互作用の統計解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 岩切淳一
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] snOPY : A Small Nucleolar RNA Orthological Gene Database (2010)
  • 著者名/発表者名: Naoya Kenmochi
  • 学会等名: 15th Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: Seattle
  • 年月日: 2010-06-22
• [学会発表] ヒトゲノム情報と人工抗体ライブラリーを活用したプロテオーム解析の新戦略 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高柳淳
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [図書] Ribosomes and ribosomal proteins : more than just 'housekeeping'. (2012)
  • 著者名/発表者名: Chakraborty, A. and Kenmochi, N
  • 出版者: John Wiley & Sons Ltd
• [図書] 【4章】真核生物のsmall RNA機能性RNAの分子生物学The molecular biology of non-coding RNA (2010)
  • 著者名/発表者名: 剣持直哉
  • 総ページ数: 40
  • 出版者: クバプロ
• [備考] (1) snoRNAデータベース
  • URL: http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [備考] (2) RPGデータベース
  • URL: http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [備考] (3)ホームページ
  • URL: http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/labo/
• [備考]
  • URL: http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [産業財産権] 抗RNA抗体のスクリーニング方法及びRNA抗体の製造方法 (2011)
  • 発明者名: 剣持直哉、吉浜麻生、高柳淳、清水信義
  • 権利者名: 宮崎大学、慶應義塾
  • 出願年月日: 2011-04-26
• [産業財産権] 抗RNA抗体のスクリーニング方法及びRNA抗体の製造方法 (2011)
  • 発明者名: 剣持直哉、吉浜麻生、高柳淳、清水信義
  • 権利者名: 剣持直哉、吉浜麻生、高柳淳、清水信義
  • 産業財産権番号: 2011-098698
  • 出願年月日: 2011-04-26