顔面形態における三次元デジタル解析およびゲノムワイド関連解析

• 研究課題/領域番号: 22687023
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 自然人類学
• 研究機関: 琉球大学
• 研究代表者: 木村 亮介 琉球大学, 大学院医学研究科, 准教授 (00453712)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 26,000千円 (直接経費: 20,000千円、間接経費: 6,000千円); 2013年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2012年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2011年度: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円); 2010年度: 12,350千円 (直接経費: 9,500千円、間接経費: 2,850千円)
• キーワード: 顔 / 形態 / 三次元解析 / 多型 / ゲノム

研究概要

ヒトの顔面形態については、その遺伝性が認識されているにもかかわらず、未だ多くの遺伝因子が不明である。本研究は、非接触三次元スキャナを導入した現代日本人の顔面形態解析と、DNAマイクロアレイを用いたゲノムワイド関連解析を行うことで、顔面形態と関連する遺伝子多型を同定することを目的とする。本研究では、沖縄在住のボランティアから顔面形状データおよび血液または唾液を取得した。756人の日本人について顔面形態の解析を行った結果、顔面形態のパターンおよび琉球出身者と本土出身者間の違いを示すことができた。さらに、ゲノムワイド関連解析によって、顔幅や下顔面高などに関連する一塩基多型を同定することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Comparative analysis of facial morphology between Okinawa islanders and mainland Japanese using three-dimensional images (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyazato E, (3名省略), Kimura R
  • 雑誌名: Am J Hum Biol 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study of degenerative bony changes of the temporomandibular joint (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, (10名省略), Kimura R, Inoue I
  • 雑誌名: Oral Dis 巻: 20 号: 4 ページ: 409-415
  • DOI: 10.1111/odi.12141
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interpretations of practical population genetics analyses of genome-wide SNP data on human demography (2014)
  • 著者名/発表者名: Kimura R
  • 雑誌名: Dynamics of Learning in Neanderthals and Modern Humans Volume 2: Cognitive and Physical Perspectives 巻: 2 ページ: 105-117
  • DOI: 10.1007/978-4-431-54553-8_12
  • ISBN: 9784431545521, 9784431545538
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of polymorphisms associated with early tooth eruption in dental and occlusal traits in East Asian populations (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Kawaguchi A, Kim YI, Haga S, Katayama K, Ishida H, Park SB, Maki K, Kimura R
  • 雑誌名: Korean Journal of Orthodontics 巻: 44 号: 2 ページ: 96-102
  • DOI: 10.4041/kjod.2014.44.2.96
  • NAID: 120006892746
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metric characteristics of human limb bones in Asian and Japanese populations (2013)
  • 著者名/発表者名: Kudaka M., Fukase H., Kimura R., Hanihara T., Matsumura H., Saso A., Fukumine T. and Ishida H.
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 121 号: 1 ページ: 49-62
  • DOI: 10.1537/ase.121125
  • NAID: 10031169434
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A genome-wide association study of third molar agenesis in Japanese and Korean populations (2013)
  • 著者名/発表者名: Haga S, Nakaoka H, Yamaguchi T, Yamamoto K, Kim YI, Samoto H, Ohno T, Katayama K, Ishida H, Park SB, Kimura R, Maki K, Inoue I
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 58 号: 12 ページ: 799-803
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.106
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying regions of the human genome that exhibit evidence of positive selection (ver. 2) (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura R, Ohashi J
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Sciences 巻: なし
  • DOI: 10.1002/9780470015902.a0020850.pub2
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノム研究で切り開かれる人類学の新たな挑戦 (2013)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 巻: 67 ページ: 327-333
• [雑誌論文] Hypertension Susceptibility Gene Prevalence in the Pacific Islands and Associations with Hypertension in Melanesia (2013)
  • 著者名/発表者名: Furusawa T
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: (in press) 号: 3 ページ: 142-149
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation of the allele-sharing approach, known as the IBS method, in kinship analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Tamura, T., et al.
  • 雑誌名: Journal of Forensic and Legal Medicine 巻: 20 号: 2 ページ: 112-116
  • DOI: 10.1016/j.jflm.2012.05.005
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of the Asian-specific nonsynoymous EDAR variation on multiple dental traits : possible hichhiking phenotypes (2012)
  • 著者名/発表者名: Park J-H, Yamaguchi T, Hanihara T
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 57 号: 8 ページ: 508-514
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.60
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of melanocortin 1 receptor gene (MC1R) polymorphisms with skin reflectance and freckles in Japanese (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi K, (8名省略), Kimura R
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 号: 11 ページ: 700-708
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.96
  • NAID: 10031126991
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of common PAX9 variants with permanent tooth size variation in non-syndromic East Asian populations. (2012)
  • 著者名/発表者名: Won-Chul Lee, Yamaguchi T, Watanabe C, Kawaguchi A, Takeda M, Yong-Il Kim, Haga S, Tomoyasu Y, Ishida H, Maki K, Soo-Byung Park,Kimura R.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 57 号: 10 ページ: 654-659
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.90
  • NAID: 10031122243
  • 査読あり
• [雑誌論文] <i>DRD4</i> VNTR polymorphism in Oceanic populations (2012)
  • 著者名/発表者名: Naka, I. et al.
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 120 号: 2 ページ: 151-155
  • DOI: 10.1537/ase.110901
  • NAID: 10031057349
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり
• [雑誌論文] The history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan Populations. (2012)
  • 著者名/発表者名: Jinam T, Nishida N, Hirai M, Kawamura S, Oota H, Umetsu K, Kimura R, Ohashi J, Tajima A, Yamamoto T, Tanabe H, Mano S, Suto Y, Kaname T, Naritomi K, Yanagi K, Niikawa N, Omoto K. Saitou N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 57巻 号: 12 ページ: 787-79
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.114
  • NAID: 10031145887
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Serum Leptin Level and Body Mass Index in Melanesian and Micronesian Solomon Islanders : Focus on Genetic Factors and Urbanization (2011)
  • 著者名/発表者名: Furusawa, et al.
  • 雑誌名: American Journal of Human Biology 巻: 23 号: 4 ページ: 435-444
  • DOI: 10.1002/ajhb.21124
  • 査読あり
• [雑誌論文] Advanced CT images reveal nonmetric cranial variations in living humans (2011)
  • 著者名/発表者名: Saitou, N. et al.
  • 雑誌名: Ａｎｔｈｒｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 119 号: 3 ページ: 231-237
  • DOI: 10.1537/ase.100928
  • NAID: 10030340100
  • ISSN: 0918-7960, 1348-8570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Testing the thrifty gene hypothesis : the Gly482Ser variant in PPARGC1A is associated with BMI in Tongans. (2011)
  • 著者名/発表者名: Myles S, et al.
  • 雑誌名: BMC Med Genet 巻: 12(印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノム集団遺伝学を利用した形質関連遺伝子の同定-毛髪と歯の形態を例に (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 234 ページ: 169-170
• [学会発表] 日本人における眼窩周辺の顔面形状の三次元解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 喜屋武龍介, 木村亮介, (他6名省略)
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 2013-11-03
• [学会発表] 相同モデリングを用いた三次元顔面形態の琉球‐本土間比較 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮里絵理, 木村亮介, (他5名省略)
  • 学会等名: 第67回日本人類学会
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 2013-11-02
• [学会発表] A common variant in WNT10A is associated with the variation in tooth size (2013)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介, (他5名省略)
  • 学会等名: 第118回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • 発表場所: 高松
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] ゲノムワイドSNPデータに基づく琉球列島の人々の集団構造 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤丈寛, 木村亮介, (他11名省略)
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2012-11-03
• [学会発表] Dispersals of modern humans: inferences from genome diversity data (2012)
  • 著者名/発表者名: Kimura R.
  • 学会等名: RNMH2012: the first conference
  • 発表場所: Tokyo
• [学会発表] ヒトゲノムにおける地域特異的な自然選択の探索と形質関連遺伝子の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 第42回種生物学シンポジウム
  • 発表場所: 京都府京都市
  • 年月日: 2010-12-12
• [学会発表] 最新技術で探る"ウチナンチュ" (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 日本動物行動学会公開シンポジウム
  • 発表場所: 沖縄県那覇市
  • 年月日: 2010-11-20
• [学会発表] 日本人の歯形態に関連する遺伝子多型の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介, ら
  • 学会等名: 第64回日本人類学会大会
  • 発表場所: 北海道伊達市
  • 年月日: 2010-10-01
• [学会発表] 3次元デジタル分析による琉球および本土日本人集団における生体顔面の形態比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 宮里絵里, ら
  • 学会等名: 第64回日本人類学会大会
  • 発表場所: 北海道伊達市
  • 年月日: 2010-10-01
• [学会発表] 相同モデリングを用いた三次元顔面形態の琉球－本土間比較
  • 著者名/発表者名: 宮里絵理、渡邊千晶、山口今日子、石田肇、木村亮介、河内まき子、持丸正明
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] 側方面頭部Ｘ線規格写真による琉球人と本土日本人女性の頭蓋顔面形態比較
  • 著者名/発表者名: 山内忠、木村亮介、深瀬均、山口徹太郎、当真隆、宮本潔人、石田肇
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] 日本人における眼窩周辺の顔面形状の三次元解析
  • 著者名/発表者名: 喜屋武龍介、宮里絵理、渡辺千晶、山口今日子、石田肇、木村亮介、河内まき子、持丸正明
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] 日本人の日焼け能に関連する遺伝子多型の探索
  • 著者名/発表者名: 山口今日子、川口亮、渡辺千晶、石田肇、木村亮介
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] 実践！ヒト集団ゲノム学
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 第67回日本人類学会大会
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] Peopling of Asia: inferences from SNP data and tasks for WGS data
  • 著者名/発表者名: Kimura R
  • 学会等名: 5th International Biological Information Objects (Bio) Conference
  • 発表場所: Suwon, Korea
  • 招待講演
• [学会発表] WNT10Aの多型は歯冠サイズと関連する
  • 著者名/発表者名: 木村亮介他
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] ゲノムワイドSNPデータに基づく琉球列島の人々の集団構造
  • 著者名/発表者名: 佐藤丈寛
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 候補遺伝子アプローチによる日本人皮膚色の関連遺伝子多型の同定
  • 著者名/発表者名: 山口今日子
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 日本およびアジア集団におけるヒト四肢骨の形態的特徴
  • 著者名/発表者名: 久高将臣
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 相同モデリングを用いたヒト顔面の三次元形態解析
  • 著者名/発表者名: 宮里絵理
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] mtDNA分析による出土魚骨の種判別：沖縄県勝連城跡からの魚骨を用いた可能性調査
  • 著者名/発表者名: 川口亮
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 若年成人における関節可動域にみられる全身的共変動パターン
  • 著者名/発表者名: 諸見里恵一
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 2D:4D比は性ホルモン関連形質の指標として妥当なのか？
  • 著者名/発表者名: 米須学美
  • 学会等名: 第66回日本人類学会大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] A common variant in WNT10A is associated with the variation in tooth size
  • 著者名/発表者名: 木村亮介他
  • 学会等名: 第118回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • 発表場所: 高松
• [学会発表] 3D morphometrics of human face based on homologous modeling
  • 著者名/発表者名: 宮里絵理他
  • 学会等名: 第118回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • 発表場所: 高松
• [学会発表] How to interpret multivariate genomic analyses of populations with admixture.
  • 著者名/発表者名: Kimura R.
  • 学会等名: ociety for Molecular Biology and Evolution 2011 Annual Meeting
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] ゲノム多変量解析の解釈
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] ゲノム集団遺伝学でみるホモ・サピエンスの拡散と遺伝適応
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 第21回日本数理生物学会大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] ゲノム多変量解析から読み解く集団の移動史
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] 若年成人の全身性関節弛緩性と左右の優位性との関係について
  • 著者名/発表者名: 諸見里恵一他
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] 本土日本－琉球人集団間における体毛分布差異の統計学的評価
  • 著者名/発表者名: 佐藤丈寛他
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] 3次元顔面画像データの特徴点による琉球および本土日本人の判別
  • 著者名/発表者名: 宮里絵理他
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] アジア人特異的EDAR 1540Cアリルは下顎第2大臼歯のhypoconulidと関連する
  • 著者名/発表者名: 川口亮他
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] 沖縄在住日本人の皮膚色変異とその遺伝的要素
  • 著者名/発表者名: 山口今日子他
  • 学会等名: 第65回日本人類学会大会
  • 発表場所: 那覇
• [学会発表] ゲノムから探る人類の拡散と遺伝適応
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 学会等名: 日本人間行動進化学会第4回大会
  • 発表場所: 札幌
  • 招待講演
• [学会発表] Peopling of Asia inferred from the genome diversity.
  • 著者名/発表者名: Kimura, R.
  • 学会等名: Symposium on the Emergence and Diversity of Modern Human Behavior in Palaeolithic Asia
  • 発表場所: Tokyo
• [図書] 系統地理学-DNA で解き明かす生きものの自然史 (2013)
  • 著者名/発表者名: 種生物学会編, 池田啓・小泉逸郎責任編集, 木村亮介他分担執筆
  • 出版者: 文一総合出版
• [図書] 人類の移動誌 (2013)
  • 著者名/発表者名: 印東道子編, 木村亮介他分担執筆
  • 出版者: 臨川書店
• [図書] 系統地理学：DNAで解き明かす生きものの自然史 （種生物学会編） (2013)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介 （分担執筆）
  • 出版者: 文一総合出版
• [図書] 人類の移動誌 （印東道子編） (2013)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介 （分担執筆）
  • 出版者: 臨川書店
• [備考]
  • URL: http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anatomy1/
• [備考] 琉球大学大学院医学研究科人体解剖学講座
  • URL: http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anatomy1/