ChIP-seq法によるヘテロクロマチンの多様性の解明

• 研究課題/領域番号: 22710180
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 長尾 恒治 北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 助教 (60426575)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: エピゲノム / ヘテロクロマチン / バイオインフォマティクス / ゲノム

研究概要

染色体上のヘテロクロマチンと呼ばれる領域は、遺伝情報を安定に維持するための染色体構造を作り出したり、発生・分化過程に応じた遺伝子の発現を制御するために重要な役割を果たしています。本研究では、次世代シーケンサーによる解析を駆使したChIP-seq法を用いることで、ヒト細胞のヘテロクロマチンがどのようなタンパク質の組み合わせによって成り立っているか明らかにしました。

研究成果

• [雑誌論文] CDK promotes interactions of Sld3 and Drc1 with Cut5 for initiation of DNA replication in fission yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuura, M., Nagao, K., Obuse, C., Takahashi, T. S., Nakagawa, T., and Masukata, H.
  • 雑誌名: Mol. Biol. Cell 巻: 14 ページ: 2620-2633
  • 査読あり
• [雑誌論文] CDK promotes interactions of Sld3 and Drc1 with Cut5 for initiation of DNA replication in fission yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuura M.、 Nagao K.、 Obuse C.、 Takahashi T.S.、 Nakagawa T.、Masukata H.
  • 雑誌名: Molecular biology of the cell 巻: 22(14) 号: 14 ページ: 2620-2633
  • DOI: 10.1091/mbc.e10-12-0995
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human POGZ modulates dissociation of HP1alpha from mitotic chromosome arms through Aurora B activation (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozawa, R. S., Nagao, K., Masuda, H. T., Iwasaki, O., Hirota, T., Nozaki, N., Kimura, H., and Obuse, C.
  • 雑誌名: Nat. Cell Biol 巻: 12 ページ: 719-727
  • 査読あり
• [雑誌論文] ヒトHP1結合タンパク質のプロテオーム解析からみえてきたHP1の新機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 野澤竜介、長尾恒治、小布施力史
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 28 ページ: 2983-2986
• [雑誌論文] ヒトHP1結合タンパク質POGZは分裂前期のAurora Bキナーゼの染色体腕部での活性化に寄与する (2010)
  • 著者名/発表者名: 野澤竜介、長尾恒治、小布施力史
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 29 ページ: 868-870
• [雑誌論文] Human POGZ modulates dissociation of HP1 alpha from mitotic chromosome arms through Aurora B activation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozawa, R.
  • 雑誌名: Nat.Cell.Biol. 巻: 12 ページ: 719-727
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synergistic roles of the proteasome and autophagy for mitochondrial maintenance and chronological lifespan in fission yeast. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takeda, K.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 巻: 107 ページ: 3540-3545
  • 査読あり
• [学会発表] ChIP-seq Analysis of Heterochromatin-associated Histone Modifications in Human Female Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治、野澤竜介、柴田幸子、木村宏、小布施力史
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2012-02-24
• [学会発表] ChIP-seq Analysis of Heterochromatin-associated Histone Modifications in Human Female Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治
  • 学会等名: 「哺乳類X染色体不活性化について」研究会
  • 発表場所: 北海道大学(札幌市)
  • 年月日: 2012-02-24
• [学会発表] ChIP-seq Analysis of Heterochromatin-associated Histone Modifications in Human Female Cells (2011)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治、野澤竜介、柴田幸子、木村宏、小布施力史
  • 学会等名: BMB2011第34回日本分子細胞生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] ChIP-seq Analysis of Heterochromatin-associated Histone Modifications in Human Female Cells (2011)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治
  • 学会等名: 第34回日本分子細胞生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Quantitiative Proteomic Analysis of HP1αInteraction Network-Four Different Interaction Modes of HP1αwith Its Associated Proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Koji Nagao, Ryu-suke Nozawa, and Chikashi Obuse
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場
  • 年月日: 2011-01-25
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of HP1 α Interaction Network-Four Different Interaction Modes of HP1 α with Its Associated Proteins. (2011)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治
  • 学会等名: International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: 淡路市
• [学会発表] 半定量プロテオミクスによるヒトHP1αタンパク質間相互作用ネットワークの解明-HP1は4つの異なる様式でさまざまなタンパク質と相互作用する (2010)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治、野澤竜介、小布施力史
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子細胞生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 判定量プロテオミクスによるヒトHP1αタンパク質間相互作用ネットワークの解明-HP1は4つの異なる様式でさまざまなタンパク質と相互作用する (2010)
  • 著者名/発表者名: 長尾恒治
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: 神戸市