| 研究課題/領域番号 |
22710184
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
ゲノム生物学
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| 研究機関 | 静岡大学 |
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研究代表者 |
堀池 徳祐 静岡大学, 若手グローバル研究リーダー育成拠点, 特任助教(テニュアトラック) (20535306)
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| 研究期間 (年度) |
2010 – 2011
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| 研究課題ステータス |
完了 (2011年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2011年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2010年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
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| キーワード | ゲノム進化学 / オーソログ / 系統樹 / 系統解析 |
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| 研究概要 |
全ゲノム配列が決定された生物を対象に全タンパク質のアミノ酸配列情報を用いてオーソログデータセットを作成するシステムを開発した。オーソログとは種分岐によって生じた相同遺伝子のことである。このシステムにより得られるデータセットは従来のオーソログデータセットと異なり、アウトパラログ(対象とする生物群が分岐する前に遺伝子重複によって生じた相同遺伝子)や遺伝子水平伝播によってもたらされた遺伝子を可能な限り取り除くため、大規模遺伝子情報を用いた系統解析に利用できる。
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