DMDにおける新規スプライシング機構の証明

• 研究課題/領域番号: 22710192
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 北陸先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 鈴木 仁 北陸先端科学技術大学院大学, ナノマテリアルテクノロジーセンター, 助教 (00447690)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: RNA / スプライシング / 疾患関連遺伝子 / エキソンスキップ治療

研究概要

スプライシングでは、通常mRNAとラリアット型のイントロンRNAが生成する。本研究では、生体内のイントロンRNAに末端連結型が存在する可能性について検証した。これまでの結果、末端連結型はイントロンや生体組織に依存せず、普遍的に検出される可能性が示唆された。また、生体由来のtotal RNAを処理したRNase R耐性RNAには、予測されたイントロンRNAが含まれるだけではなく、第1エキソン領域の未知のRNAが多量に存在することが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Re-splicing of mature mRNA in cancer cells promotes activation of distant weak alternative splice sites (2012)
  • 著者名/発表者名: Kameyama, T., Suzuki, H., and Mayeda, A.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: (in press)
• [雑誌論文] Alternative splicing produces structural and functional changes in CUGBP2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Takeuchi, M., Sugiyama, A., Alam, A. H. M. K., Vu, T. L., Sekiyama, Y., Dam, C. H., Ohki, S., and Tsukahara, T.
  • 雑誌名: BMC Biochem 巻: (in press)
• [雑誌論文] Functional gene expression analysis of tissue-specific is forms of Mef2c (2012)
  • 著者名/発表者名: Sekiyama, Y., Suzuki, H., and Tsukahara, T.
  • 雑誌名: Cell. Mol 巻: 32 ページ: 129-139
• [雑誌論文] Alternative Splicing Produces Structural and Functional Changes in CUGBP2 (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 仁
  • 雑誌名: BMC Biochemistry 巻: 13 号: 1 ページ: 6-6
  • DOI: 10.1186/1471-2091-13-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional gene expression analysis of tissue-specific isoforms of Mef2c (2012)
  • 著者名/発表者名: 関山佳治
  • 雑誌名: Cellular and Molecular Neurobiology 巻: 32 号: 1 ページ: 129-139
  • DOI: 10.1007/s10571-011-9743-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive Analysis of Alternative Splicings and Functionality in Neuronal Differentiation of P19 cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Osaki, K., Sano, K., Alam, A. H. M. K., Nakamura, Y., Ishigaki, Y., Kawahara, K., and Tsukahara, T.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6
• [雑誌論文] Comprehensive Analysis of Alternative Splicings and Functionality in Neuronal Differentiation of P19 cells (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6 ページ: 16880-16880
  • 査読あり
• [雑誌論文] Retinoic acid treatment and cell aggregation independently regulate alternative splicing in P19 cells during neural differentiation (2010)
  • 著者名/発表者名: Alam, A. H. M. K., Suzuki, H., and Tsukahara, T.
  • 雑誌名: Cell. Biol. Int 巻: 34 ページ: 631-643
• [雑誌論文] Retinoic acid treatment and cell aggregation independently regulate alternative splicing in P19 cells during neural differentiation (2010)
  • 著者名/発表者名: AHMK Alam
  • 雑誌名: Cell Biol Int. 巻: 34 ページ: 631-643
  • 査読あり
• [学会発表] P19細胞の神経分化における選択的スプライシングの網羅的解析と経路網探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 第12回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-07-28
• [学会発表] P19細胞の神経分化における選択的スプライシングの網羅的解析と経路網探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 第12回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 一橋記念講堂(東京)
  • 年月日: 2010-07-28
• [備考]