変異原性核酸認識モチーフの開発と遺伝子の網羅的解析への応用

• 研究課題/領域番号: 22750154
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 京都工芸繊維大学
• 研究代表者: 小堀 哲生 京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 准教授 (00397605)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2011年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2010年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
• キーワード: 酸化損傷塩基 / DNA / 変異原性

研究概要

様々な要因によりDNA配列中に蓄積されていく突然変異は、癌や生物個体の加齢の原因となることが報告されている。そのため、突然変異発生のメカニズムの解明、及び抑制方法に関する研究は極めて重要な課題である。そこで我々は、「DNA突然変異の要因である変異原性核酸の特異的認識モチーフの開発及びその応用」を本課題の目的として研究を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Surprising Repair Activities of Nonpolar Analogs of 8-oxoG Expose Features of Recognition and Catalysis by Base Excision Repair Glycosylases (2012)
  • 著者名/発表者名: P. L. McKibbin, A. Kobori, Y. Taniguchi, E. T. Kool, S. S. David
  • 雑誌名: Journal of The American Chemical Society 巻: 134 号: 3 ページ: 1653-1661
  • DOI: 10.1021/ja208510m
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a system to sensitively and specifically visualize-fos mRNA in living cells using bispyrene-modified RNA probes (2011)
  • 著者名/発表者名: Waki R., Yamayoshi A., Kobori A., Murakami A.
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 47 号: 14 ページ: 4204-4206
  • DOI: 10.1039/c0cc04639f
  • 査読あり
• [雑誌論文] Real-time Imaging of RNA Expression in Living Cells Using Bispyrene-modified RNA Probes (2011)
  • 著者名/発表者名: Waki R., Yamayoshi A., Kobori A., Murakami A.
  • 雑誌名: Chemistry letters 巻: 40 ページ: 1247-1248
  • NAID: 10030220013
  • URL: http://dx.doi.org/10.1246/cl.2011.1247
  • 査読あり
• [雑誌論文] Real-time Imaging of RNA Expression in Living Cells Using Bispyrene-modified RNA Probes (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Waki
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 40 ページ: 1247-1248
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a system to sensitively and specifically visualize-fos mRNA in living cells using bispyrene-modified RNA probes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Waki R., Yamayoshi A., Kobori A., Murakami A.
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 47 ページ: 4204-4206
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific regulation of point-mutated K-ras-immortalized cell proliferation by a photo-dynamic antisense strategy (2010)
  • 著者名/発表者名: Higuchi M., Yamayoshi A., Kato K., Kobori A., Wake N., Murakami A.
  • 雑誌名: Oligonucleotides 巻: 20 号: 1 ページ: 37-44
  • DOI: 10.1089/oli.2008.0173
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific regulation of point-mutated K-ras-immortalized cell proliferation by a photo-dynamic antisense strategy. (2010)
  • 著者名/発表者名: Higuchi M., Yamayoshi A., Kato K., Kobori A., Wake N., Murakami A.
  • 雑誌名: Oligonucleotides 巻: 20 ページ: 37-44
  • 査読あり
• [学会発表] RISC機能の制御を目指した光架橋性アンチセンス核酸の設計指針 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] N^4位にソラレン誘導体を導入したデオキシシチジンを含む新規光応答性核酸の合成とその機能評価 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] 2-フェニルフランを導入したDNAオリゴマーによるエテノシトシン形成反応の開発と一塩基多型診断への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] 光架橋性アンチセンス核酸を用いたRISC機能制御法の開発(II)光架橋性基の導入位置がRISC機能阻害効果におよぼす影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] FRET型ピレン修飾核酸プローブの開発とRNAの可視化への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 真田雄矢, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] 2-フェニルフランを導入したDNAオリゴマーによるエテノシトシン形成反応の開発と一塩基多型診断への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] ビスピレン修飾型2'-OMe RNAプローブを用いたRNA-タンパク質複合体検出法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村上章, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] N^4位にソラレン誘導体を導入したデオキシシチジンを含む新規光応答性核酸の合成とその機能評価 (2012)
  • 著者名/発表者名: 冨田康治, 他
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] RISC機能の制御を目指した光架橋性アンチセンス核酸の設計指針 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] RISC機能の制御を目指した光架橋性アンチセンス核酸の設計指針 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平, 他
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] A novel method to profile RNA expression in living cells using fluorescent RNA probes (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Waki, et al
  • 学会等名: 38th ISNAC
  • 発表場所: Hokkaido University (Sapporo, Japan)
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] Whole mount in situ hybridization detection of mRNAs in the Drosophila embryos using bispyrene-conjugated RNA probes (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Ueda, et al
  • 学会等名: 38th ISNAC
  • 発表場所: Hokkaido University (Sapporo, Japan)
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] 光分解性保護基を導入した架橋性核酸の開発と機能評価 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 光分解性保護基を導入した架橋性核酸の開発と機能評価 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生, 他
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] RISC機能の制御を目指した光応答性核酸素子の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平, 他
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] Whole mount in situ hybridization detection of mRNAs in the Drosophila embryos using bispyrene-conjugated RNA probes (2011)
  • 著者名/発表者名: R. Waki
  • 学会等名: 38th ISNAC
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2011-09-09
• [学会発表] Development of novel peptide-oligonucleotide conjugates for regulation of small RNA function (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Yamayoshi
  • 学会等名: Sixth Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
  • 発表場所: Queen's college(Cambridge、UK)
  • 年月日: 2011-09-05
• [学会発表] Development of novel peptide-oligonucleotide conjugates for regulation of small RNA function (2011)
  • 著者名/発表者名: A.Yamayoshi, et al
  • 学会等名: Sixth Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
  • 発表場所: Queen's college (Cambridge、UK)
  • 年月日: 2011-09-05
• [学会発表] 核酸塩基部にソラレン誘導体を有する新規光架橋性アンチセンス核酸の合成と架橋特性の評価 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] 光分解性保護基を導入した機能性核酸の架橋特性の評価 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] 蛍光標識RNAプローブを用いた生細胞内RNAの発現プロファイリング (2011)
  • 著者名/発表者名: 脇玲子
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] RISC機能の制御を目指した光架橋性アンチセンス核酸の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平, 小堀哲生
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] マルチカラーRNAイメージングを目指したFRET型核酸プローブの開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 眞田雄矢, 他
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] ユビキチンリガーゼ活性を利用した病因タンパク質の新規細胞内分解システムの開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子
  • 学会等名: 第40回医用高分子シンポジウム
  • 発表場所: 関西大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-07-26
• [学会発表] 機能性核酸を用いたRISC機能の光制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松山洋平
  • 学会等名: 第21回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 関西大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-07-25
• [学会発表] 光応答性核酸を用いた相補鎖捕捉反応の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 第21回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 関西大学(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2011-07-25
• [学会発表] 光分解性保護基により活性を制御できる機能性核酸の合成と架橋特性の評価 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 第57回高分子研究発表会
  • 発表場所: 兵庫県民会館(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2011-07-15
• [学会発表] ロメフロキサシンを導入したオリゴ核酸合成と、相補鎖酸化反応への応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 第57回高分子研究発表会
  • 発表場所: 兵庫県民会館(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2011-07-15
• [学会発表] FRET型ピレンプローブによるRNA検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 村上章, 他
  • 学会等名: 第57回高分子研究発表会
  • 発表場所: 兵庫県民会館(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2011-07-15
• [学会発表] リンカー導入型遺伝子制御素子を用いた細胞内低分子RNAの機能制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子, 他
  • 学会等名: 第57回高分子研究発表会
  • 発表場所: 兵庫県民会館(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2011-07-15
• [学会発表] 4-フルオロインドール誘導体を用いたDNA修復酵素の基質認識特性の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 東京工業大学大岡山(東京)
• [学会発表] Interstrand photo-crosslinking using psoralen-incorporated oligodeoxyribonucleotides (2010)
  • 著者名/発表者名: A. Kobori
  • 学会等名: International roundtable on nucleosides, nucleotides and nucleic acids
  • 発表場所: France
  • 年月日: 2010-08-29
• [学会発表] Interstrand photo-crosslinking using psoralen-incorporated oligodeoxyribonucleotides (2010)
  • 著者名/発表者名: A.Kobori, K.Takaya, M.Higuchi, A.Yamayoshi, A.Murakami
  • 学会等名: International roundtable on nucleosides, nucleotides and nucleic acids
  • 発表場所: France, Lyon
  • 年月日: 2010-08-29
• [備考]
  • URL: http://www.cis.kit.ac.jp/~antisen/seijo.html
• [備考] 京都工芸繊維大学大学院工芸科学研究科生体分子工学部門生体高分子情報研究室
  • URL: http://www.cis.kit.ac.jp/~antisen/seijo.html