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糸状菌転写因子結合配列の網羅的解析とエンジニアリング

研究課題

研究課題/領域番号 22760605
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物機能・バイオプロセス
研究機関名古屋大学

研究代表者

兒島 孝明  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (40509080)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード転写因子 / プロモーター活性 / エマルジョンPCR / 糸状菌 / ハイスループットスクリーニング / Aspergillus nidulans / DNA-タンパク質相互作用 / FACS / プロモーター / バイオプロセス / 発現制御 / 生体機能利用 / 核酸 / 蛋白質 / 遺伝子
研究概要

ビーズディスプレイ法は、DNA ライブラリーをマイクロビーズ上に高集積に構築する手法である。この手法を用いてランダムDNAライブラリー及びゲノムライブラリーを用いて糸状菌転写因子AmyRの結合配列の解析を行い、AmyR結合モチーフの抽出及び種々の新規AmyR結合配列の獲得に成功した。さらに、このビーズディスプレイ法とリガーゼリボザイムを用いたプロモーター活性ハイスループット解析法を確立した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (27件)

  • [雑誌論文] High-throughput screening method for promoter activity using bead display and a ligase ribozyme2012

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T., Ohuchi, S., Ito, Y., Nakano, H.
    • 雑誌名

      J. Biosci Bioeng.

      巻: 114 ページ: 671-676

    • NAID

      110009578164

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiosc.2012.06.011

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive Analysis of the DNA-Binding Specificity of an <i>Aspergillus nidulans</i> Transcription Factor, AmyR, Using a Bead Display System2012

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima, T., Kobayashi, T., Nakano, H.
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 76 号: 6 ページ: 1128-1134

    • DOI

      10.1271/bbb.110949

    • NAID

      10030818030

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-throughput screening method for promoter activity using bead display and a ligase ribozyme.2012

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T., Ohuchi, S., Ito, Y., Nakano, H.
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: 114 号: 6 ページ: 671-676

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2012.06.011

    • NAID

      110009578164

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive Analysis of the DNA-Binding Specificity of an Aspergillus nidulans Transcription Factor, AmyR, by using a Bead Display System2011

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima, T., Kobayashi, T., and Nakano, H
    • 雑誌名

      Biotechnol. Biochem

      巻: 76 ページ: 1128-1134

    • NAID

      10030818030

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1271/bbb.110949

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive Analysis of the DNA-Binding Specificity of an Aspergillus nidulans Transcription Factor, AmyR, by using a Bead Display System

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima, T., Kobayashi, T., Nakano, H.
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem

      巻: (In press)

    • NAID

      10030818030

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ビーズディスプレーを用いたDNA-転写因子相互作用検出システムに関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスIリガーゼ・リボザイムを用いたハイスループットなin vitroプロモータースクリーニング法の確立2012

    • 著者名/発表者名
      伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスI リガーゼ・リボザイムを用いたハイスループットなin vitro スクリーニング法の確立2012

    • 著者名/発表者名
      伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイを用いたDNA-転写因子相互作用検出システムに関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      王ハン暉、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Comprehensive analysis of transcription factor binding site using bead display of DNA2012

    • 著者名/発表者名
      Nakano, H.,Wang, P.W. and Kojima, T
    • 学会等名
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Kanazawa
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] In vitro high-throughput promoter screening system using a bead display and a class I ligase ribozyme2012

    • 著者名/発表者名
      Ito, Y., Kojima, T., Ohuchi, S. and Nakano, H
    • 学会等名
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Kanazawa
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法を用いたin vitroプロモーターハイスループットスクリーニング法の確立2012

    • 著者名/発表者名
      伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第165回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用検出システム2012

    • 著者名/発表者名
      江崎俊文、王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第165回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Comprehensive analysis of transcription factor binding site using bead display of DNA.2012

    • 著者名/発表者名
      Nakano, H., Wang, P.W., Kojima, T.
    • 学会等名
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Kanazawa
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] In vitro high-throughput promoter screening system using a bead display and a class I ligase ribozyme.2012

    • 著者名/発表者名
      Ito, Y., Kojima, T., Ohuchi, S., Nakano, H.
    • 学会等名
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Kanazawa
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスIリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitroハイスループットスクリーニング2011

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本生物工学会2010年63回大会
    • 発表場所
      小金井
    • 年月日
      2011-09-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Novel screening method for promoter activity using a bead display and a ligase ribozyme2011

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T., Ito, Y., Ohuchi, S., Nakano, H.
    • 学会等名
      第5回GCOEリトリード
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      2011-09-06
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Detections of DNA-Transcription Factor Interactions using a Microbeads Display System2011

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima, T., Nakano, H.
    • 学会等名
      第5回GCOEリトリード
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      2011-09-06
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitro選別法2011

    • 著者名/発表者名
      見島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      生物工学若手研究者の集い夏のセミナー2011
    • 発表場所
      笛吹
    • 年月日
      2011-07-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNAビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用のハイスループット検出法2011

    • 著者名/発表者名
      王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      要旨集
    • 年月日
      2011-03-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNAのビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用のハイスループット検出法2011

    • 著者名/発表者名
      王 ハン輝、児島 孝明、中野 秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都→震災の為発表中止
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitro 選別法2011

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー2011
    • 発表場所
      笛吹
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel screening method for promoter activity using a bead display and a ligase ribozyme2011

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T., Ito, Y., Ohuchi, S. and Nakano, H.
    • 学会等名
      第5回GCOEリトリート
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Detections of DNA-Transcription Factor Interactions using a Microbeads Display System2011

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima, T. and Nakano, H
    • 学会等名
      第5回GCOEリトリート
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスIリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitroハイスループットスクリーニング2011

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本生物工学会2011年63回大会
    • 発表場所
      小金井
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] エマルジョンPCRを用いた分子間相互作用ハイスループットスクリーニング系2011

    • 著者名/発表者名
      中野秀雄、兒島孝明
    • 学会等名
      平成23年度生物工学技術セミナー企画
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性選別法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2010-10-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] High-throughput Screening of DNA Binding Sites for Fungus Transcription Factor, AmyR, Using Beads Display System of DNA2010

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T., Hashimoto, Y., Kato, M., Kobayashi, T. and Nakano, H
    • 学会等名
      グローバルCOE第4回リトリート
    • 発表場所
      豊橋
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] etections of DNA-transcription factor interactions using a Microbeads Display System2010

    • 著者名/発表者名
      Wang, P., Kojima T. and Nakano, H
    • 学会等名
      グローバルCOE第4回リトリート
    • 発表場所
      豊橋
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 無細胞蛋白質合成系を用いた1分子・1細胞由来mRNAの解析技術。2010

    • 著者名/発表者名
      中野秀雄、兒島孝明
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性選別法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本生物工学会2010年62回大会
    • 発表場所
      宮崎
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Beads display:A Novel High-throughput Screening Technology to Explore Functional Biomolecules2010

    • 著者名/発表者名
      Kojima, T. and Nakano, H
    • 学会等名
      The Eleventh China-Japan-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      Chengdu, China
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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