レトロポゾンを指標とした鳥類スズメ目、猛禽類、ツル目の系統的起源の解明

• 研究課題/領域番号: 22770080
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 西原 秀典 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (10450727)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2011年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 系統 / ゲノム / 進化 / 鳥類 / 転移因子

研究概要

本研究ではスズメ目ゼブラフィンチの全ゲノムおよびコンドルのBAC配列データに基づいたレトロポゾンの挿入比較により、猛禽類の多系統性を明らかにし、さらにNeoavesの共通祖先から目レベルの系統への分岐が短期間に急速に起こったことを示した。ツル目に関してもコアグループ5科の単系統性を示唆する5つのレトロポゾン挿入遺伝子座を発見した。このように鳥類の系統学において難問とされている課題に関して重要な示唆を与える結果が得られた。

研究成果

• [雑誌論文] Phylogeny of galactolipid synthase homologs together with their enzymatic analyses revealed a possible origin and divergence time for photosynthetic Membrane biogenesis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuzawa, Y., Nishihara, H., Haraguchi, T., Masuda, S., Shimojima, M., Shimoyama, A., Yuasa, H., Okada, N., and Ohta, H.
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 19 ページ: 91-102
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny of galactolipid synthase homologs together with their enzymatic analyses revealed a possible origin and divergence time for photosynthetic Membrane biogenesis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuzawa Y, Nishihara H, Haraguchi T, Masuda S, Shimojima M, Shimoyama A, Yuasa H, Okada N, Ohta H
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 19 号: 1 ページ: 91-102
  • DOI: 10.1093/dnares/dsr044
  • 査読あり
• [雑誌論文] B chromosomes have a functional effect on female sex determination in Lake Victoria cichlid fishes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Terai, Y., Mizoiri, S., Aibara, M., Nishihara, H., Watanabe, M., Kuroiwa, A., Hirai, H., Hirai, Y., Matsuda, Y., and Okada, N.
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 7
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Mammalian Conserved Element Derived from SINE Displays Enhancer Properties Recapitulating Satb2 Expression in Early-Born Callosal Projection Neurons (2011)
  • 著者名/発表者名: Tashiro, K., Teissier, A., Kobayashi, N., Nakanishi, A., Sasaki, T., Yan, K., Tarabykin, V., Vigier, L., Sumiyama, K., Hirakawa, M., Nishihara, H., Pierani, A., and Okada, N
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6(12)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reverse evolution in RH1 for adaptation of cichlids to water depth in Lake Tanganyika (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagai, H., Terai, Y., Sugawara, T., Imai, H., Nishihara, H., Hori, M., and Okada, N.
  • 雑誌名: Mol Biol Evol 巻: 28 ページ: 1769-1776
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Mammalian Conserved Element Derived from SINE Displays Enhancer Properties Recapitulating Satb2 Expression in Early-Born Callosal Projection Neurons (2011)
  • 著者名/発表者名: Tashiro K, Teissier A, Kobayashi N, Nakanishi A, Sasaki T, Yan K, Tarabykin V, Vigier L, Sumiyama K, Hirakawa M, Nishihara H, Pierani A, Okada N
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6(12) 号: 12 ページ: e28497-e28497
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0028497
  • 査読あり
• [雑誌論文] B chromosomes have a functional effect on female sex determination in lake victoria cichlid fishes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 7(8) 号: 8 ページ: e1002203-e1002203
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002203
  • NAID: 120006627278
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reverse Evolution in RH1 for adaptation of cichlids to water depth in Lake Tanganyika (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagai, H., Terai, Y., Sugawara, T., Imai, H., Nishihara, H., Hori, M.and Okada, N.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 28(6) 号: 6 ページ: 1769-1776
  • DOI: 10.1093/molbev/msq344
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reverse evolution in RH1 for adaptation of cichlids to water depth in Lake Tanganyika. (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagai H, Terai Y, Sugawara T, Imai H, Nishihara H, Hori M, Okada N.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Emergence of mammals by emergency : exaptation (2010)
  • 著者名/発表者名: Okada, N., Sasaki, T., Shimogori, T., and Nishihara, H.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 15 ページ: 801-812
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a novel SINE super family from invertebrates :"Ceph-SINEs" from the genomes of squids and cuttlefish (2010)
  • 著者名/発表者名: Akasaki, T., Nikaido, M., Nishihara, H., Tsuchiya, K., Segawa, S., and Okada, N.
  • 雑誌名: Gene 巻: 454 ページ: 8-19
  • 査読あり
• [雑誌論文] Emergence of mammals by emergency : exaptation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Okada N, Sasaki T, Shimogori T, Nishihara H.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 15 ページ: 801-812
  • 査読あり
• [学会発表] A Mammalian Conserved Element Derived from SINE Displays Enhancer Properties Recapitulating Satb2 Expression in Early-Born Callosal Projection Neurons (2012)
  • 著者名/発表者名: Hidenori Nishihara
  • 学会等名: The 59th NIBB Conference "NEOCORTICAL ORGANIZATION"
  • 発表場所: Okazaki Conference Center, Okazaki, Aichi
  • 年月日: 2012-03-12
• [学会発表] Functional analysis of the SINE-derived enhancer for Satb2 expression in neocortex (2011)
  • 著者名/発表者名: 西原秀典
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都大学(京都)
  • 年月日: 2011-07-31
• [学会発表] Molecular functional analysis of the neocortex-specific Satb2 enhancer derived from SINEs : Toward resolution of the evolutionary process of exaptation (2011)
  • 著者名/発表者名: Hidenori Nishihara
  • 学会等名: SMBE 2011-Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
  • 発表場所: Kyoto University, Kyoto
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] 大陸移動と哺乳類の進化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西原秀典、丸山茂徳、岡田典弘
  • 学会等名: 日本進化学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-08-05
• [学会発表] レトロポゾンの挿入パターンを指標としたツル目の系統解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 蔵本多恵、西原秀典、岡田典弘
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12