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転写因子TFIIHサブ複合体の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 22770110
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 構造生物化学
研究機関香川大学 (2013)
兵庫県立大学 (2010-2012)

研究代表者

小森 博文  香川大学, 教育学部, 准教授 (30382261)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードタンパク質 / X線結晶構造解析 / 結晶 / 転写因子 / タンパク質の精製 / タンパク質複合体 / X線結晶解析 / TFIIH / TFIIE
研究概要

本研究は、RNAポリメラーゼIIによるDNA転写制御機構を明らかにするために、X線結晶解析によって転写因子の立体構造を決定し、転写制御の分子機構を解明することを目的としている。転写因子は様々な種類のタンパク質の複合体として機能する。結晶化に適する試料を調整するために、転写制御に関わる重要なタンパク質複合体について、昆虫細胞や大腸菌の共発現系を利用して精製を行った。

報告書

(5件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2014 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (26件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (7件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] New insights into the catalytic active site structure of multicopper oxidase2014

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, R. Sugiyama, K. Kataoka, K. Miyazaki, Y. Higuchi & T. Sakurai
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D

      巻: 70 ページ: 772-779

    • NAID

      120005451980

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria constituents on recombinant human histidine decarboxylase2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Nitta, H. Kikuzakic, T. Azuma, Y. Ye, M. Sakaue, Y. Higuchi, H. Komori, & H. Ueno
    • 雑誌名

      Food Chemistry

      巻: 138 ページ: 1551-1556

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from D. vulgaris Miyazaki F with visible light2013

    • 著者名/発表者名
      H. Osuka, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata, S. Nagao, Y. Higuchi, & S. Hirota
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      巻: 430 ページ: 284-288

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Cyrstal structure of the CueO mutants at Glu506, the key amino acid located in the proton transfer pathway for dioxygen reduction2013

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, T. Kajikawa, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      巻: 438 ページ: 686-690

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Formation of Oligomeric Cytochrome c during Folding by Intermolecular Hydrophobic Interaction between Nand C-Terminal α-Helices2013

    • 著者名/発表者名
      P. P. Parui, M. Deshpande, S. Nagao, H. Kamikubo, H. Komori, Y. Higuchi, M. Kataoka, & S. Hirota
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 52 ページ: 8732-8744

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Cyrstal structure of the CueO mutants at Glu506, the key amino acid located in the proton transfer pathway for dioxygen reduction2013

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, T. Kajikawa, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 438 号: 4 ページ: 686-690

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.07.121

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2012

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, R. Sugiyama, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
    • 雑誌名

      Angew chem

      巻: 51 ページ: 1861-1864

    • NAID

      120003959483

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural and enzymatic characterization of BacD, an L-amino acid dipeptide ligase from B. subtilis2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura, E. Hinokuchi, H. Ikeda, A. Senoo, Y. Takahashi, J. Saito, H. Komori, N. Shibata, Y. Yonetani, & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Protein Sci

      巻: 21 ページ: 707-716

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, Y. Nitta, H. Ueno, & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Cryst. F

      巻: 68 ページ: 675-677

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural study reveals Ser345 determines substrate specificity on human histidine2012

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, Y. Nitta, H. Ueno, & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 287 ページ: 29715-19183

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Domain swapping of the heme and N-terminal α-helix in Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 dimer2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, & S. Hirota
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 52 ページ: 8608-8616

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] An O-centered structure of the trinuclear copper center in the Cys500Ser/Glu506Gln mutant of CueO and structural changes in low to high X-ray dose conditions.2012

    • 著者名/発表者名
      Komori H, Sugiyama R, Kataoka K, Higuchi Y, Sakurai T.
    • 雑誌名

      Angew Chem Int Ed Engl.

      巻: 51 ページ: 1861-1864

    • NAID

      120003959483

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and enzymatic characterization of BacD, an L-amino acid dipeptide ligase from Bacillus subtilis.2012

    • 著者名/発表者名
      Shomura Y, Hinokuchi E, Ikeda H, Senoo A, Takahashi Y, Saito J, Komori H, Shibata N, Yonetani Y, Higuchi Y.
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: 21 ページ: 707-716

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Komori H, Nitta Y, Ueno H, Higuchi Y.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.

      巻: 68 ページ: 675-677

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural study reveals that Ser-354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase.2012

    • 著者名/発表者名
      Komori H, Nitta Y, Ueno H, Higuchi Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 287 ページ: 29175-29183

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Domain swapping of the heme and N-terminal α-helix in Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c(552) dimer.2012

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Y, Nagao S, Osuka H, Komori H, Higuchi Y, Hirota S.
    • 雑誌名

      Biochemistry.

      巻: 51 ページ: 8608-8616

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with visible light.2012

    • 著者名/発表者名
      Osuka H, Shomura Y, Komori H, Shibata N, Nagao S, Higuchi Y, Hirota S.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 430 ページ: 284-288

    • NAID

      120005716864

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria constituents on recombinant human histidine decarboxylase.2012

    • 著者名/発表者名
      Nitta Y, Kikuzaki H, Azuma T, Ye Y, Sakaue M, Higuchi Y, Komori H, Ueno H.
    • 雑誌名

      Food Chem.

      巻: 138 ページ: 1551-1556

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Positively charged residues located downstream of PIP-box, together with TD amino acids within PIP-box, are important for CRL4Cdt2-mediated proteolysis2011

    • 著者名/発表者名
      M. Michishita, A. Morimoto, T. Ishii, H. Komori, Y. Higuchi, Y. Shiomi & H. Nishitani
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 16 ページ: 12-22

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the DIX domain of the Wnt signalling positive regulator Ccd12011

    • 著者名/発表者名
      S. Terawaki, K. Yano, T. Katsutani, K. Shiomi, K. Keino-Masu, M. Masu, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Cryst. F

      巻: 67 ページ: 758-761

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Role of π-Electron Systems in Stabilization of the Oxidized Tetraheme Architecture in Cytochrome c3 and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Takayama, M. Taketa-Sato, H. Komori, K. Morita, SJ. Kang, Y. Higuchi, & H. Akutsu
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      巻: 841 ページ: 1096-1101

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates2010

    • 著者名/発表者名
      N. Shibata, H. Tamagaki, S. Ohtsuki, N. Hieda, K. Akita, H. Komori, Y. Shomura, S. Terawaki, K. Mori, N. Yasuoka, Y. Higuchi & T. Toraya
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 285 ページ: 26484-26493

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix2010

    • 著者名/発表者名
      S. Hirota, Y. Hattori, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, Z. Wang, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 107 ページ: 12854-12859

    • NAID

      120005716875

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of dimeric and trimeric cytochromes c from horse heart2010

    • 著者名/発表者名
      M. Taketa, H. Komori, Y. Hattori, S. Nagao, S. Hirota, & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Cryst. F

      巻: 66 ページ: 1477-1479

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd32010

    • 著者名/発表者名
      R. Nishimasu, H. Komori, Y. Higuchi, H. Nishimasu & H. Hiroaki
    • 雑誌名

      Kobe J Med Sci

      巻: 56

    • NAID

      110009824994

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure analysis of Bacillus subtilis ferredoxin-NADP+ oxidoreductase and the structural basis for its substrate selectivity2010

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, D. Seo, T. Sakurai & Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Protein Sci

      巻: 19 ページ: 2279-2290

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 構造解析に向けた鉄調節性転写因子の精製2013

    • 著者名/発表者名
      小森 博文
    • 学会等名
      日本生物高分子学会2013年度大会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒト由来ヒスチジン脱炭酸酵素の構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      小森博文
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] X線照射によるマルチ銅活性中心の構造変化2012

    • 著者名/発表者名
      小森博文
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the histamine synthesis by human histidine decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Komori
    • 学会等名
      Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Adelaide (Australia)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] マルチ銅酸化酵素の構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      小森博文
    • 学会等名
      生化学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府)
    • 年月日
      2011-09-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Reconstitution of the subcomplex of yeast TFIIH2010

    • 著者名/発表者名
      小森博文
    • 学会等名
      1st HFSP Alumni Meeting Japan
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • 年月日
      2010-10-09
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 構造解析に向けた鉄調節性転写因子の精製

    • 著者名/発表者名
      小森 博文
    • 学会等名
      日本生物高分子学会2013年度大会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.ed.kagawa-u.ac.jp/~komori/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 研究内容 - 小森研究室

    • URL

      http://www.ed.kagawa-u.ac.jp/~komori/research.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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