ホヤを用いた受精・発生に関わる新規プロテアーゼの探索

• 研究課題/領域番号: 22770209
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 発生生物学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 山田 力志 名古屋大学, 理学研究科, 特任助教 (10551020)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: プロテアーゼ / ゲノム / 発生 / 受精 / ホヤ / 進化 / 発生・分化

研究概要

脊索動物の基本的な体制を保持し、遺伝子重複以前のゲノムを保持するカタユウレイボにおいて、ゲノム情報を利用したプロテアーゼの網羅的同定、及び手作業での系統樹作製による詳細なアノテーションを行った。その結果、カタユウレイボヤには計506のプロテアーゼ遺伝子が存在することが明らかとなった。さらには既知の遺伝子発現のデータを利用して、進化を通じて保存性が高く、Testis特異的な発現がみられるプロテアーゼ遺伝子と、発生のある時期に特異的な発現がみられるプロテアーゼ遺伝子をそれぞれ8個抽出し、それら16遺伝子の発生過程における発現パターン及び生体組織内での実際の発現パターンを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] CIPRO 2. 5 : Ciona intestinal is protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curate annotation, with user rating and reviewing functionality (2011)
  • 著者名/発表者名: Endo, T., Ueno, K., Yonezawa, K., Mineta, K., Hotta, K., Satou, Y., Yamada, L. Endo, T., Ueno, K., Yonezawa, K., Mineta, K., Hotta, K., Satou, Y., Yamada, L.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39 ページ: 807-814
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification and localization of the sperm CRISP family protein CiUrabin involved in gamete interaction in the ascidian Ciona intestinal is (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi, A., Saito, T., Yamada, L., Taniguchi, H., Harada, Y., and Sawada, H
  • 雑誌名: Molecular Reproduction and Development 巻: 78(7) ページ: 488-497
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification and localization of the sperm CRISP family protein CiUrabin involved in gamete interaction in the ascidian Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Akira Yamaguchi
  • 雑誌名: Molecular Reproduction and Development 巻: 78(7) ページ: 488-497
  • 査読あり
• [雑誌論文] CIPRO 2.5 : Ciona intestinalis protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with user rating and reviewing functionality. (2011)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 39 ページ: 807-814
  • 査読あり
• [学会発表] 非モデル生物におけるプロテオミクス解析の実践と可能性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: 研究会「モデル生物・非モデル生物のプロテオミクスが拓く生物学」
  • 発表場所: 自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター、岡崎市
  • 年月日: 2012-05-14
• [学会発表] 非モデル生物におけるプロテオミクス解析の実践と可能性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: 研究会「モデル生物・非モデル生物のプロテオミクスが拓く生物学」
  • 発表場所: 自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター、岡崎市(招待講演)(発表確定)
  • 年月日: 2012-05-14
• [学会発表] カタユウレイボヤにおける精子及び卵膜ラフト画分のプロテオーム解析(Global protein profiling of sperm and egg membrane raft fraction during fertilization in Ciona intestinal is.) (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] カタユウレイボヤにおける精子及び卵膜ラフト画分のプロテオーム解析(Global protein profiling of sperm and egg membrane raft fraction during fertilization in Ciona intestinalis.) (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] マイナー生物におけるプロテオーム解析の試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: シンポジウム
  • 発表場所: NAIST(生駒市)
  • 年月日: 2011-11-24
• [学会発表] マイナー生物におけるプロテオーム解析の試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: シンポジウム「プロテオミクスを生命科学に生かす10の方法」
  • 発表場所: NAIST(生駒市)(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-24
• [学会発表] Grobal protein profiling of sperm and egg lipid-raft membrane during fertilization in Ciona intestinal is (2011)
  • 著者名/発表者名: Lixy Yamada
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting, McGill University
  • 発表場所: Montreal, Quebec, Canada
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] Grobal protein profiling of sperm and egg lipid-raft membrane during fertilization in Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Lixy Yamada
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: 6th International Tunicate Meeting
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] 仮想ゲルを用いたLC/MSデータの表示とタンパク質修飾の探索プログラム(Western Blot-like Presentation of Gel-enhanced LC/MS Data and Software-based Detection of Protein Modifications) (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] CIPRO 2. 5 : Ciona intestinal is Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: Biocuration 2010
  • 発表場所: Odaiba, Tokyo, JAPAN
  • 年月日: 2010-10-14
• [学会発表] CIPRO 2. 5 : Cionaintestinalis Protein Database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating andcomments (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: Beyond the Genome
  • 発表場所: Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, U.S.A.
  • 年月日: 2010-10-12
• [学会発表] Ciona intestinal is protein database CIPRO shows a variety of proteomes for a single species (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: the annual CBRC open house workshop(CBRC2010) on Bioinformatics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2010-07-29
• [学会発表] Ciona intestinalis protein database CIPRO shows a variety of proteomes for a single species (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: the annual CBRC open house workshop (CBRC2010) on Bioinformatics
  • 発表場所: Computational Biology Research Center (Tokyo)
• [学会発表] CIPRO 2.5 : Ciona intestinalis Protein Database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: Beyond the Genome
  • 発表場所: Harvard Medical School, (Boston, Massachusetts, U.S.A.)
• [学会発表] CIPRO 2.5 : Ciona intestinalis Protein integrated database with large-Beale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments (2010)
  • 著者名/発表者名: Toshinori Endo
  • 学会等名: Biocuration 2010
  • 発表場所: Tokyo International Exchange Center, (Tokyo)
• [学会発表] 仮想ゲルを用いたLC/MSデータの表示とタンパク質修飾の探索プログラム(Western Blot-like Presentation of Gel-enhanced LC/MS Data and Software-based Detection of Protein Modifications) (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [図書] Sperm Cell Research in the 21st Century : Historical Discoveries to New Horizons (2012)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Sawada
  • 出版者: Adthree Publishing Co.(出版確定)(未定)
• [図書] Sperm Cell Research in the 21st Century : Historical Discoveries to New Horizons (2011)
  • 著者名/発表者名: Sawada, H., Saito, T., Yamaguchi, A., Harda, Y., and Yamada L.
  • 出版者: Adthree Publishing Co.
• [備考] (1)研究開発web CIPRO (Ciona intestinalis protein database)
  • URL: http://cipro.ibio.jp/current/