シロイヌナズナを用いたアブラナ科自家不和合性機構の解明

• 研究課題/領域番号: 22780002
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 三重大学
• 研究代表者: 諏訪部 圭太 三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 准教授 (50451612)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2010年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: シロイヌナズナ / 自家不和合性 / 自他認識下流因子 / シグナル伝達 / 柱頭 / 近縁野生種 / トランスクリプトーム / 次世代シーケンサー / 自他認識反応 / 突然変異 / ゲノム / 雄性配偶子 / 花粉

研究概要

重要な育種形質の1つである自家不和合性は、近交弱勢を回避し種内の多様性を維持する遺伝的機構としてダーウィンによる発見以来精力的に研究が行われている。本研究は、遺伝学および乳頭細胞トランスクリプトーム解析によって、遺伝資源・ゲノム情報などで優れるアブラナ科モデル植物シロイヌナズナでの本機構崩壊の歴史・過程と自家不和合性ネットワークに関与する遺伝子群を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Comprehensive network analysisof anther-expressed genes in rice by the combination of 33 laser microdissection and 143 spatiotemporal microarrays (2011)
  • 著者名/発表者名: Koichiro Aya, Go Suzuki, Keita Suwabe, Tokunori Hobo, Hirokazu Takahashi, Katsuhiro Shiono, Kentaro Yano, Nobuhiro Tsutsumi, Mikio Nakazono, Yoshiaki Nagamura, Makoto Matsuoka, Masao Watanabe
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: Vol.6 ページ: 26162-26162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oryza Express : an integrated database of gene expression networks and omics annotations in rice (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Hamada, Kohei Hongo, Keita Suwabe, Akifumi Shimizu, Taishi Nagayama, Reina Abe, Shunsuke Kikuchi, Naoki Yamamoto, Takaaki Fujii, Koji Yokoyama, Hiroko Tsuchida, Kazumi Sano, Takako Mochizuki, Nobuhiko Oki, Youko Horiuchi, Masahiro Fujita, Masao Watanabe, Makoto Matsuoka, Nori Kurata, Kentaro Yano
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.52 ページ: 220-229
  • NAID: 10029708412
  • 査読あり
• [雑誌論文] イネにおけるマイクロアレイ解析の現状と今後の展望 (2011)
  • 著者名/発表者名: 安益公一郎、諏訪部圭太
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: Vol.49 ページ: 261-268
  • NAID: 10028117266
• [雑誌論文] Comprehensive network analysis of anther-expressed genes in rice by the combination of 33 laser microdissection and 143 spatiotemporal microarrays (2011)
  • 著者名/発表者名: Koichiro Aya, et al
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microstructure of a Brassica rapa genome segment homoeologous to the resistance gene cluster on Arabidopsis chromosome 4 (2011)
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe, et al
  • 雑誌名: Breeding Science 巻: (掲載確定)
  • NAID: 10030434685
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oryza Express : an integrated database of gene expression networks and omics annotations in rice. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Hamada, et al.
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: 52 ページ: 220-229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Achievement of genetics in plant reproduction research : the past decade for the coming decade (2010)
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe, Go Suzuki, Masao Watanabe
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: Vol.85 ページ: 297-310
  • NAID: 10029515450
  • 査読あり
• [雑誌論文] Achievement of genetics in plant reproduction research : the past decade for the coming decade. (2010)
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe, et al.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 85 ページ: 297-310
  • NAID: 10029515450
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microstructure of a Brassica rapa genome segment homoeologous to the resistance gene cluster on Arabidopsis chtromosome 4
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe, Go Suzuki, Tsukasa Nunome, Katsunori Hatakeyama, Yasuhiko Mukai, Hiroyuki Fukuoka, Satoru Matsumoto
  • 雑誌名: Breeding Science
  • 査読あり
• [学会発表] アブラナ科植物における分子遺伝学研究基盤の構築と育種学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 諏訪部圭太
  • 学会等名: 日本育種学会第121回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] レーザーマイクロダイセクションによるアブラナ科乳頭細胞の単離法の構築 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田智貴、大坂正明、藤岡智明、坂園聡美、高橋宏和、中園幹生、岩野恵、高山誠司、鈴木剛、渡辺正夫、諏訪部圭太
  • 学会等名: 日本育種学会第121回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] LM-NGS法によるアブラナ科乳頭細胞のトランスクリプトーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大坂正明、松田智貴、藤岡智明、坂園聡美、高橋宏和、中園幹生、岩野恵、高山誠司、鈴木剛、諏訪部圭太、渡辺正夫
  • 学会等名: 日本育種学会第121回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] イネ雄性生殖器官におけるsmall RNAの網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤岡智明、浜田和輝、本郷耕平、矢野健太郎、増子潤美、牧野周、前忠彦、諏訪部圭太、鈴木剛、渡辺正夫
  • 学会等名: 日本育種学会第121回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] Laser Microdissection-NextGeneration Sequence Transcriptome Analysisin the Papilla Cell of Brassica rapa (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaaki Osaka, Tomoki Matsuda, Yuki Kobushiro, Kaori Nagasaka, Hirokazu Takahashi, Mikio Nakazono, Go Suzuki, Yong-Pyo Lim, Keita Suwabe, Masao Watanabe
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Analysis of Pollen Behavior on Brassica Self-Incompatibility (2012)
  • 著者名/発表者名: Kenichiro Hiroi, Keita Suwabe, Go Suzuki, Masao Watanabe
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] NGS Transcriptome of Small RNAs in Rice Male Gametophyte Development (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Fujioka, Kazuki Hamada, Kohei Hongo, Kentaro Yano, Hiromi Masuko-Suzuki, Kaori Yamamura, Amane Makino, Tadahiko Mae, Keita Suwabe, Go Suzuki, Masao Watanabe
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] The pollen specific LIM gene for pollen germination and pollen tube growth in Arabidopsis thaliana (2012)
  • 著者名/発表者名: Keisuke Sudo, Jong-In Park, Keita Suwabe, Go Suzuki, Masao Watanabe
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Improving the Agrobacterium-Mediated Transformation Protocol for Brachypodium Distachyon (2012)
  • 著者名/発表者名: Seiya Goto, Tomoaki Fujioka, Takahiro Akimoto, Hiromi Masuko-Suzuki, Masao Watanabe, Go Suzuki, Silvia C. Alves, Keita Suwabe
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] An integrated Database for Gene Expression Networks in Rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Hamada, Kai Fukazawa, Taishi Nagayama, Koji Yokoyama, Hiroko Tsuchida, Kaori Igarashi, Keita Suwabe, Masao Watanabe, Makoto Matsuoka, Nori Kurata, Kentaro Yano, Oryza Express
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Laser Microdissection-Next Generation Sequence Transcriptome Analysis in the Papilla Cell of Brassica rapa (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaaki Osaka, ら
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Oryza Express : An integrated Database for Gene Expression Networks in Rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Hamada, ら
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XX
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] レーザーマイクロダイセクションによるアブラナ科乳頭細胞の単離法の構築 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田智貴, ら
  • 学会等名: 第121回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] LM-NGS法によるアブラナ科乳頭細胞のトランスクリプトーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大坂正明, ら
  • 学会等名: 第121回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] イネ雄性生殖器官におけるsmall RNAの網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤岡智明, ら
  • 学会等名: 第121回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
• [学会発表] アブラナ科植物における分子遺伝学研究基盤の構築と育種学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 諏訪部圭太
  • 学会等名: 第121回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学(招待講演)
• [学会発表] Significance of genetic resources for self-incompatibility research in Brassica and Brassicaceae (2011)
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe
  • 学会等名: Importance of Germplasm in Crop Genomics and Breedeing
  • 発表場所: Chungnam National University, Korea
  • 年月日: 2011-08-09
• [学会発表] Significance of genetic resources for self-incompatibility research in Brassica and Brassicaceae (2011)
  • 著者名/発表者名: Keita Suwabe
  • 学会等名: Importance of Germplasm in Crop Genomics and Breedeing
  • 発表場所: Daejeon, Korea(招待講演)
  • 年月日: 2011-08-09
• [学会発表] アブラナ科植物自家不和合性反応における花粉動態の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 広井健一郎、高山誠司、鈴木剛、諏訪部圭太、渡辺正夫
  • 学会等名: 日本育種学会第120回講演会
  • 発表場所: 福井県立大学
• [学会発表] イネの遺伝子発現ネットワークとオミックス情報統合データベース (2011)
  • 著者名/発表者名: 濱田和輝、本郷耕平、諏訪部圭太、清水顕史、長山大志、阿部玲奈、菊池俊介、山本直樹、藤井貴朗、横山幸治、土田博子、佐野和美、望月孝子、大木信彦、堀内陽子、藤田雅丈、渡辺正夫、松岡信、倉田のり、矢野健太郎
  • 学会等名: 日本育種学会第118回講演会
  • 発表場所: 横浜市立大学
• [学会発表] アブラナ科植物自家不和合性反応における花粉動態の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 広井健一郎, ら
  • 学会等名: 第120回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 福井県立大学
• [学会発表] Oryza Express:イネの遺伝子発現ネットワークとおミックス情報統合データベース (2011)
  • 著者名/発表者名: 濱田和輝, ら
  • 学会等名: 第119回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 横浜市立大学(神奈川県)
• [学会発表] アブラナ科自家和合変異系統の分子遺伝学的解析と連鎖地図へのマッピング (2010)
  • 著者名/発表者名: 大坂正明、五十川祥代、白澤彰、菊田利奈、小松聡、新倉聡、高田美信、柴博史、磯貝彰、高山誠司、鈴木剛、諏訪部圭太、渡辺正夫
  • 学会等名: 日本育種学会第118回講演会
  • 発表場所: 秋田県立大学
• [学会発表] ハクサイ根こぶ病抵抗性遺伝子Crr1のマップベースクローニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 畠山勝徳、諏訪部圭太、加藤丈幸、布目司、福岡浩之、松元哲
  • 学会等名: 日本育種学会第118回講演会
  • 発表場所: 秋田県立大学
• [学会発表] イネの遺伝子発現ネットワーク解析とデータベース構築 (2010)
  • 著者名/発表者名: 濱田和輝、本郷耕平、山本直樹、藤井貴朗、望月孝子、諏訪部圭太、倉田のり、矢野健太郎
  • 学会等名: 日本育種学会第118回講演会
  • 発表場所: 秋田県立大学
• [図書] The Use of Omics Databases for Plant (2011)
  • 著者名/発表者名: Ayako Suzuki, Keita Suwabe, Kentaro Yano
  • 出版者: CRC Press
• [図書] Sustainable agriculture and new biotechnologies (2011)
  • 著者名/発表者名: Ayako Suzuki, et al
  • 出版者: CRC Press
• [備考] <受賞>日本育種学会奨励賞、2012年3月29日日本育種学会第118回講演会優秀発表賞、2010年9月24-25日