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新規構造をもつ色素依存性プロリン脱水素酵素の構造と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 22780098
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用生物化学
研究機関福井大学 (2011-2012)
米子工業高等専門学校 (2010)

研究代表者

里村 武範  福井大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (50412317)

研究協力者 櫻庭 春彦  香川大学, 農学部, 教授 (90205823)
大島 敏久  九州大学, 農学研究科, 教授 (10093345)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2011年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード超好熱菌 / 色素依存性脱水素酵素 / L-プロリン脱水素酵素 / バイオセンサー / バイオ電池
研究概要

本研究では、現在までに見いだされている2種類のタイプの色素依存性プロリン脱水素酵素(Dye-ProDH)とは、構造、酵素化学的性質が大きく異なる第3のタイプの新規色素依存性L-プロリン脱水素酵素の機能と構造解析を行った。本酵素はホモ二量体構造をとり、既知のヘテロオリゴマータイプの酵素とはサブユニット構造が大きく異なっていた。また、本酵素の立体構造解析にも成功し酵素と基質との親和性に関与するアミノ酸残基の特定、および電子受容体特異性に関与するアミノ酸残基の特定に成功した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] フラビン含有色素依存性脱水素酵素の機能・構造解析とその応用2012

    • 著者名/発表者名
      里村武範、川上竜巳、櫻庭春彦、大島敏久
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 70巻 ページ: 340-345

    • NAID

      10031003368

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of novel dye-linked L-proline dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix.2012

    • 著者名/発表者名
      H. Sakuraba, T. Satomura, R. Kawakami, K. Kim, Y. Hara, K. Yaneda, T. Ohshima
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 287 ページ: 20070-20080

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene expression and characterization of a third type of dye-linked L-proline dehydrogenase from the aerobic hyperthermophilic archaeon, Aeropyrum pernix.2012

    • 著者名/発表者名
      T. Satomura, Y. Hara, S. Suye, H. Sakuraba, T. Ohshima
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 76 ページ: 589-593

    • NAID

      10030750977

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] フラビン含有色素依存性脱水素酵素の機能・構造解析とその応用2012

    • 著者名/発表者名
      里村武範
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 70 ページ: 340-345

    • NAID

      10031003368

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Gene Expression and Characterization of a Third Type of Dye-Linked <small>L</small>-Proline Dehydrogenase from the Aerobic Hyperthermophilic Archaeon, <I>Aeropyrum pernix</I>2012

    • 著者名/発表者名
      T.Satomura, Y.Hara, S.Suye, H.Sakuraba, T.Ohshima
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 76 号: 3 ページ: 589-593

    • DOI

      10.1271/bbb.110775

    • NAID

      10030750977

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of a novel dye-linked L -proline dehydrogenase from an aerobic hyperthermophilic archaeon,Pyrobaculum calidifontis.2011

    • 著者名/発表者名
      T. Satomura, X. Zhang, Y. Hara, K. Doi,H. Sakuraba, T. Ohshima
    • 雑誌名

      Appl. Microbiol. Biotechnol.

      巻: 89 ページ: 1075-1082

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of a novel dye-linked L-proline dehydrogenase from an aerobic hyperthermophilic archaeon, Pyrobaculum calidifontis.2011

    • 著者名/発表者名
      T.Satomura, X.Zhang, Y.Hara, K.Doi, H.Sakuraba, T.Ohshima
    • 雑誌名

      Applied microbiology and biotechnology

      巻: 89 ページ: 1075-1082

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysisof a novel dye-linked L-proline dehydrogenase from the aerobic hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix2010

    • 著者名/発表者名
      T. Satomura, H. Sakuraba, Y. Hara, T. Ohshima
    • 雑誌名

      Acta. Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.

      巻: 66 ページ: 1508-1510

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel dye-linked L-proline dehydrogenase from the aerobic hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Satomura, H.Sakuraba, Y.Hara, T.Ohshima
    • 雑誌名

      Acta crystallographica.Section F, Structural biology and crystallization communications

      巻: 66 ページ: 1508-1510

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Functional and structural characterization of Dye-linked L-proline dehydrogenase from hyperthermophiles2012

    • 著者名/発表者名
      T. Satomura, R. Kawakami, S. Suye, H. Sakuraba, T. Ohshima
    • 学会等名
      9th International Congress On Extremophiles
    • 発表場所
      Hotel NH Central Convencionesセビリア(スペイン)
    • 年月日
      2012-09-13
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 好気性超好熱アーキアAeropyrum pernix由来色素依存性L-プロリン脱水素酵素の構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      里村武範、川上竜巳、末信一朗、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      2012年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都女子大学、京都
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 好気性超好熱アーキアAeropyrum pernix由来色素依存性L-プロリン脱水素酵素の構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      里村武範、川上竜巳、末信一朗、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      2012年度農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都府)
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] クレンアーキオータに存在する新規ホモダイマー型色素依存性L-プロリン脱水素酵素の機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      里村武範、川上竜巳、末信一朗、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      第12回極限環境生物学会
    • 発表場所
      長崎大学、長崎県
    • 年月日
      2011-11-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] クレンアーキオータに存在する新規ホモダイマー型色素依存性L-プロリン脱水素酵素の機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      里村武範、川上竜巳、末信一朗、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      第12回極限環境生物学会
    • 発表場所
      長崎大学良順会館(長崎県)
    • 年月日
      2011-11-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 色素依存性脱水素酵素の網羅的な機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      里村武範、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      日本農芸化学会中四国支部例会第28回講演会
    • 発表場所
      香川大学、香川
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 色素依存性脱水素酵素の網羅的な機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      里村武範、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      日本農芸化学会中四国支部例会第28回講演会
    • 発表場所
      香川大学農学部(香川県)
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] クレンアーキオータに存在する新規色素依存性L-プロリン脱水素酵素の構造と機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      里村武範、原佑介、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      酵素補酵素研究会
    • 発表場所
      西日本総合展示場、福岡
    • 年月日
      2010-09-11
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] クレンアーキオータに存在する新規色素依存性L-プロリン脱水素酵素の構造と機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      里村武範、原佑介、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      酵素補酵素研究会
    • 発表場所
      西日本総合展示場(福岡県)
    • 年月日
      2010-09-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Functional and structural characterization of Dye-linked L-proline dehydrogenase from hyperthermophiles

    • 著者名/発表者名
      Takenori Satomura
    • 学会等名
      9th INTERNATIONAL CONGRESS ON EXTREMOPHILES
    • 発表場所
      Hotel NH Central Convencionesセビリア スペイン
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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