レクチン様天然物Pradimicinによる糖認識機構の解析

• 研究課題/領域番号: 22780109
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物生産化学・生物有機化学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 中川 優 独立行政法人理化学研究所, 伊藤細胞制御化学研究室, 専任研究員 (90452284)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2010年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: Antibiotic / Carbohydrate recognition / Lectin / Natural product / Pradimicin / Solid-state NMR / Pradimicin A / 抗生物質 / 放線菌 / 糖受容体 / 天然物 / 固体NMR / 凝集 / 固相相互作用解析

研究概要

Pradimicin(PRM)は, Ca^<2+>イオン存在下D-マンノース(Man)と特異的に結合する天然抗生物質群である.本研究では,「固相中での分子相互作用解析」という全く新しい解析戦略のもと, PRMとManとの複合体の固体NMR解析を行なった.その結果, PRMがCa^<2+>イオンを介してManと結合していることを明らかにするとともに, PRMにおけるMan結合部位を初めて特定することに成功した.

研究成果

• [雑誌論文] Carbohydrate-Binding Molecules with Non-Peptidic Skeletons (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Trends Glycosci. Glycotechnol 巻: (in press)
  • NAID: 10030975501
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR analysis of calcium and D-mannose binding of BMY-28864, a water-soluble analogue of pradimicin A (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Doi, T., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. Lett. 巻: 22 ページ: 1038-1041
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR analysis of calcium and D-mannose binding of BMY-28864, a water-soluble analogue of pradimicin A (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., et al
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem.Lett. 巻: 22 号: 2 ページ: 1040-1043
  • DOI: 10.1016/j.bmcl.2011.11.106
  • 査読あり
• [雑誌論文] Carbohydrate-Binding Molecules with Non-Peptidic Skeletons (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Ito, Y.
  • 雑誌名: Trends Glycosci.Glycotechnol. 巻: 23(In press)
  • NAID: 10030975501
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mapping of the Primary Mannose-Binding Site of Pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Doi, T., Masuda, Y., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 巻: 133 ページ: 17485-17493
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR Spectroscopic Analysis of the Ca^<2+>-dependent Mannose Binding of Pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Masuda, Y., Yamada, K., Doi, T., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 50 ページ: 6084-6088
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR spectroscopic analysis of the Ca^<2+>-dependent mannose binding of pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Masuda, Y., Yamada, K., Doi, T., Takegoshi, K., Igarashi, Y., Ito, Y.
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: 50 号: 27 ページ: 6084-6088
  • DOI: 10.1002/anie.201007775
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mapping of the primary mannose binding site of pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Doi, T., Masuda, Y., Takegoshi, K., Igarashi, Y., Ito, Y.
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 133 号: 43 ページ: 17485-17493
  • DOI: 10.1021/ja207816h
  • 査読あり
• [学会発表] Pradimicin Aの水溶性アナログ・BMY-28864とマンノースとの複合体の固体NMR解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川優,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012年度大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-24
• [学会発表] Pradimicin Aの水溶性アナログ・BMY-28864とマンノースとの複合体の固体NMR解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川優, ほか
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012年度大会
  • 発表場所: 京都女子大学(京都)
  • 年月日: 2012-03-24
• [学会発表] 固体NMRによるPraidimicin Aのマンノース認識機構解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 第53回天然有機化合物討論会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] 固体NMRによるPraidimicin Aのマンノース認識機構解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優, ほか
  • 学会等名: 第53回天然有機化合物討論会
  • 発表場所: 大阪国際交流センター(大阪)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] Praidimicin AによるCa^<2+>依存的マンノース結合の固体NMR解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会
  • 発表場所: 長岡
  • 年月日: 2011-07-13
• [学会発表] Praidimicin AによるCa^<2+>依存的マンノース結合の固体NMR解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優, ほか
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会
  • 発表場所: ハイブ長岡(長岡)
  • 年月日: 2011-07-13
• [学会発表] Pradimicin Aによるマンノース認識機構の固体NMR解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-03-27
• [備考] RIKEN RESEARCH Highlights
  • URL: http://www.rikenresearch.riken.jp/eng/research/6837
• [備考] SpectroscopyNOW. com