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光合成のストレス後遺症の原因を指標する発現遺伝子のゲノム網羅的探索

研究課題

研究課題/領域番号 22780135
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 森林科学
研究機関北海道大学

研究代表者

斎藤 秀之 (齋藤 秀之)  北海道大学, 大学院・農学研究院, 講師 (70312395)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2010年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード遺伝子発現 / 機能ゲノム学 / ゲノム生物学的情報 / ストレス診断 / DNAマイクロアレイ / ブナ / ゲノム生理生態学 / 土壌乾燥ストレス / マクロアレイ
研究概要

ブナ葉の発現遺伝子について次世代シーケンサーで355, 845, 739塩基を解読した。ブナ葉の遺伝子発現をゲノム網羅的に解析できるDNAマイクロアレイを開発した(機能推定済みが12, 446個と未推定が31, 357個)。ブナ成木の葉で高温、乾燥、酸化(過酸化水素)に特異的に発現する遺伝子を明らかにした。土壌乾燥の強度ならびにその前歴と光合成低下の関係を明らかにし、これらの土壌乾燥ストレスに特異的な発現遺伝子を明らかにした。以上、発現遺伝子はブナ葉のストレス診断において有望な指標になると考えられた。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] ブナ林のたどっている道-分布域北限の動向-2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 雑誌名

      北方林業

      巻: 64巻(2) ページ: 38-41

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ブナのDNAマイクロアレイの開発2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之、瀬々潤、清水(稲継)理恵、神村章子、山田宰靖、清水健太郎
    • 雑誌名

      北海道の林木育種

      巻: 54巻(2) ページ: 11-14

    • NAID

      40019244788

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] ブナのDNAマイクロアレイの開発2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之・瀬々潤・清水(稲継)理恵・神村章子・山田宰靖・清水健太郎
    • 雑誌名

      北海道の林木育種

      巻: 54(2) ページ: 11-14

    • NAID

      40019244788

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌水分変動がブナ苗木の葉の遺伝子発現に与える影響のゲノム網羅的解析2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之、石堂光、神村章子、瀬々潤、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • 学会等名
      第123回日本森林学会
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • 年月日
      2012-03-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナにおける花芽形成の日長誘導経路に関わる遺伝子群の発現特性2012

    • 著者名/発表者名
      小倉俊治、斎藤秀之、門松昌彦、渋谷正人、小池孝良
    • 学会等名
      第123回日本森林学会
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • 年月日
      2012-03-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナ林の遺伝子診断による環境ストレス評価2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 学会等名
      富士山の自然環境保全に関するワークショップ2012
    • 発表場所
      静岡県環境衛生科学研究所(静岡市)
    • 年月日
      2012-03-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナの遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発に向けて-コンセプトと診断指標性のある遺伝子の探索-ワークショップ2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 学会等名
      ブナ林生態系における生物・環境モニタリングシステムの構築
    • 発表場所
      国立環境研究所(つくば市)
    • 年月日
      2012-03-11
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナの遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発に向けて-コンセプトと診断指標性のある遺伝子の探索-2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 学会等名
      ワークショップ「ブナ林生態系における生物・環境モニタリングシステムの構築」
    • 発表場所
      国立環境研究所(つくば市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ブナ林の衰退現象と樹木のストレス評価について-遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発-2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 学会等名
      神奈川県研究人材活性化のための講演会
    • 発表場所
      神奈川県自然環境保全センター(厚木市)
    • 年月日
      2012-02-21
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナ林の衰退現象と樹木のストレス評価について-遺伝子発現情報を用いたストレス診断技術の開発-2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之
    • 学会等名
      神奈川県研究人材活性化のための講演会
    • 発表場所
      神奈川県自然環境保全センター(厚木市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ブナのDNAマイクロアレイの開発-遺伝子発現情報によるストレス診断技術にむけて-2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之、山田宰靖、神村章子、瀬々潤、福崎睦美、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • 学会等名
      第60回北方森林学会
    • 発表場所
      札幌市コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-11-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之、山田宰靖、瀬々潤、福崎睦美、清水(稲継)理恵、清水健太郎
    • 学会等名
      第122回日本森林学会
    • 発表場所
      静岡大学(静岡市)
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索2011

    • 著者名/発表者名
      斎藤秀之・山田宰靖・瀬々潤・福崎睦美・清水(稲継)理恵・清水健太郎
    • 学会等名
      第122回日本森林学会
    • 発表場所
      静岡市,静岡大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について2010

    • 著者名/発表者名
      山口高志、龍田慎平、渡辺誠、渡邊忠、久保島康行、斎藤秀之、野口泉、小池孝良
    • 学会等名
      第51回大気環境学
    • 発表場所
      大阪大学(豊中市)
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について2010

    • 著者名/発表者名
      山口高志・龍田慎平・渡辺誠・渡邊忠・久保島康行・斎藤秀之・野口泉・小池孝良
    • 学会等名
      第51回大気環境学
    • 発表場所
      豊中市,大阪大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2016-04-21  

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