大規模リン酸化プロテオーム解析による大腸癌の早期診断バイオマーカー探索

• 研究課題/領域番号: 22790539
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 研究代表者: 久家 貴寿 独立行政法人医薬基盤研究所, プロテオームリサーチプロジェクト, 研究員 (20551857)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 腫瘍検査学 / 大腸癌 / タンパク質リン酸化 / バイオマーカー / プロテオーム解析 / Phospho-iTRAQ法 / SRM法 / 血中バイオマーカー

研究概要

多検体の手術組織標本のタンパク質リン酸化プロファイルをプロテオミクス手法(Phospho-iTRAQ法)を用いて比較し、大腸癌で特異的に変動しているタンパク質リン酸化修飾を200種類以上同定した。さらに、癌特異的リン酸化修飾変動をハイスループットに検証する方法(Phospho-SI-SRM法)を確立した。これらの技術とバイオインフォマティクス解析を駆使して、大腸癌のリン酸化バイオマーカー候補と新規の大腸癌関連タンパク質を発見した。

研究成果

• [雑誌論文] Phosphorylation statuses at different residues of lamin B2, B1, and A/C dynamically and independently change throughout the cell cycle (2010)
  • 著者名/発表者名: Kuga T, Nozaki N, Matsushita K, Nomura F, Tomonaga T
  • 雑誌名: Exp Cell Res 巻: 316 ページ: 2301-2312
• [雑誌論文] The Lyn kinase C-lobe mediates Golgi export of Lyn through conformation-dependent ACSL3 association (2010)
  • 著者名/発表者名: Obata Y, Fukumoto Y, Nakayama Y, Kuga T, Dohmae N, Yamaguchi N
  • 雑誌名: J Cell Sci 巻: 123 ページ: 2649-2662
• [雑誌論文] 問題飲酒者マーカー5.9kDaペプチドの発現機構における血液凝固系の関与 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿,曽川一幸,野田健太,梅村啓史,佐藤守,小寺義男,松下一之,朝長毅,野村文夫
  • 雑誌名: アルコールと医学生物学 巻: 29 ページ: 89-92
• [雑誌論文] Phosphorylation statuses at different residues of lamin B2, B1, and A/C dynamically and independently change throughout the cell cycle. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takahisa Kuga
  • 雑誌名: Experimental Cell Research 巻: 316 ページ: 2301-2312
  • 査読あり
• [学会発表] 定量的リン酸化プロテオミクスとバイオインフォマティクスを用いた大腸がんリン酸化シグナル伝達機構の包括的理解 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿,足立淳,白水崇,村上達夫,松原久裕,松本雅記,中山敬一,福岡順也,朝長毅
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 大腸癌の定量的リン酸化プロテオーム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿,足立淳,白水崇,松原久裕,中山敬一,小寺義男,朝長毅
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 大腸がん手術組織標本の定量的リン酸化プロテオーム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿,鳴海良平,村上達夫,足立淳,白水崇,小寺義男,松原久裕,松本雅記,中山敬一,朝長毅
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] 大規模リン酸化プロテオーム解析による癌転移に関わる新規リン酸化シグナルの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇,鳴海良平,久家貴寿,足立淳,松原久裕,松本雅紀,中山敬一,朝長毅
  • 学会等名: 第63回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 北海道
• [学会発表] ヒト大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析による新規転移因子の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇,鳴海良平,久家貴寿,足立淳,松原久裕,松本雅紀,中山敬一,朝長毅
  • 学会等名: 第9回日本プロテオーム学会
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of human colorectal cancer tissues for exploring a novel cancer metastatic biomarker (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇,鳴海良平,久家貴寿,足立淳,松原久裕,松本雅紀,中山敬一,朝長毅
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 愛知
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen ; Exploring a novel factor of cancer metastasis (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Shiromizu, R. Narumi, T. Kuga, J. Adachi, H. Matsubara, M. Matsumoto, K. Nakayama, T. Tomonaga
  • 学会等名: HUPO 2011
  • 発表場所: Geneva, Swiss
• [学会発表] DNA損傷応答におけるリン酸化・ユビキチン化プロテオーム定量解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 足立淳、鳴海良平、佐野聖三、久家貴寿、白水崇、松本雅記、中山敬一、井倉正枝、井倉毅、高田穣、朝長毅
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Global phosphorylation and ubiquitination dynamics in DNA-damage response network (2011)
  • 著者名/発表者名: 足立淳、久家貴寿、白水崇、中山敬一、井倉毅、高田穣、朝長毅
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 足立淳、鳴海良平、佐野聖三、久家貴寿、白水崇、松本雅記、中山敬一、井倉正枝、井倉毅、高田穣、朝長毅
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Global phosphorylation and ubiquitination dynamics in DNA-damage response network (2011)
  • 著者名/発表者名: J. Adachi, R. Narumi, S. Sano, T. Kuga, T. Shiromizu, M. Matsumoto, K. Nakayama, M. Ikura, T. Ikura, M. Takata, T. Tomonaga
  • 学会等名: HUPO2011
  • 発表場所: Geneva, Switzerland
• [学会発表] SRM/MRM法を用いたリン酸化ペプチドの定量法の確立 (2011)
  • 著者名/発表者名: 村上達夫、鳴海良平、久家貴寿、石飛真人、稲治英生、宮本泰豪、加藤菊也、小寺義男、朝長毅
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Global phosphorylation and ubiquitination dynamics in DNA-damage response network (2011)
  • 著者名/発表者名: Jun Adachi
  • 学会等名: HUPO2011
  • 発表場所: Geneva
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of human colorectal cancer tissues for exploring a novel cancer metastatic biomarker (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] ヒト大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析による新規転移因子の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen ; Exploring a novel factor of cancer metastasis (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 学会等名: HUPO2011
  • 発表場所: Geneva
• [学会発表] 大規模リン酸化プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカー探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌組織の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鳴海良平
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 大腸癌細胞の細胞核のプロテオーム解析による染色体不安定性に関連するタンパク質の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 越中屋里香
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] DNA損傷応答ネットワークにおけるリン酸化・ユビキチン化修飾ダイナミクスのプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 足立淳
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(神戸)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] リン酸化プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカー探索と検証 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿
  • 学会等名: 第7回千葉疾患プロテオミクス研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-11-13
• [学会発表] リン酸化プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカー探索と検証 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿
  • 学会等名: 第7回千葉疾患プロテオミクス研究会
  • 発表場所: 日東紡績八重洲ビル(東京)
  • 年月日: 2010-11-13
• [学会発表] 大腸癌の大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪国際会議場(大阪)
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 大腸癌臨床検体を用いた定量的大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 東京ベイホテル東急(千葉)
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鳴海良平
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 東京ベイホテル東急(千葉)
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] 細胞核のプロテオーム解析による染色体不安定性関連タンパク質の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 越中屋里香
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 東京ベイホテル東急(千葉)
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] 大腸癌臨床検体を用いた定量的大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿、鳴海良平、松本雅記、中山敬一、松原久裕、松下一之、野村文夫、朝長毅
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 千葉
• [学会発表] 大腸癌の大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿、松下一之、野村文夫、松原久裕、中山敬一、朝長毅
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 大規模リン酸化プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカー探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久家貴寿、鳴海良平、村岡賢、足立淳、松本雅記、中山敬一、松原久裕、松下一之、野村文夫、長野一也、角田慎一、朝長毅
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌組織の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鳴海良平、久家貴寿、松本雅記、中山敬一、石飛真人、稲治英生、宮本泰豪、加藤菊也、朝長毅
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鳴海良平、久家貴寿、松本雅記、中山敬一、石飛真人、稲治英生、宮本泰豪、加藤菊也、朝長毅
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 千葉
• [学会発表] 細胞核のプロテオーム解析による染色体不安定性関連タンパク質の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 越中屋里香、久家貴寿、久米秀明、鳴海良平、足立淳、朝長毅
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会
  • 発表場所: 千葉
• [学会発表] 大腸癌細胞の細胞核のプロテオーム解析による染色体不安定性に関連するタンパク質の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 越中屋里香、久家貴寿、久米秀明、鳴海良平、足立淳、朝長毅
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] DNA損傷応答ネットワークにおけるリン酸化・ユビキチン化修飾ダイナミクスのプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 足立淳、鳴海良平、佐野聖三、久家貴寿、白水崇、松本雅記、中山敬一、茂木章、井倉毅、高田穣、朝長毅
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
• [備考]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html