心筋細胞分化の段階的DNAメチル化プロファイリングと幹細胞分化能評価ツールの開発

• 研究課題/領域番号: 22790730
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 循環器内科学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 小田 真由美 慶應義塾大学, 医学部, 助教 (80567511)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: DNAメチル化 / エピゲノム / 細胞特異的遺伝子発現 / 心筋細胞 / 転写調節 / 細胞種特異的遺伝子発現 / エピジェネティクス / 細胞分化 / ゲノムワイド / 次世代シークエンサー / 幹細胞 / バイオインフォマティクス

研究概要

エピゲノム情報はその分化可能性を評価する指標となることが考えられるが、どのような領域のエピジェネティック状態が細胞の性質に影響しうるかは明らかでない。本研究では、細胞種に特徴的な未知のエピゲノム変化を探索し、幹細胞の分化可能性評価のためのエピゲノム情報基盤を整備することが目的である。本研究計画内において、申請者らは心筋細胞特異的なgene body領域の低メチル化状態を見出した。広範囲に渡る低メチル化状態は、転写およびエピジェネティック因子の蓄積を伴っており、細胞の特性に密接に関わるエピゲノムを形成する一因となる。本研究計画では、エピゲノム情報による幹細胞評価系の整備に重要な細胞特異的エピジェネティック状態を見出した。

研究成果

• [雑誌論文] Genetic analysis of essential cardiac transcription factors in 256 patients with non-syndromic congenital heart defects. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kodo K, Nishizawa T, Furutani M, Arai S, Ishihara K, Oda M, Makino S, Fukuda K, Takahashi T, Matsuoka R, Nakanishi T, Yamagishi H.
  • 雑誌名: Circulation Journal 巻: 76 ページ: 1703-1711
  • NAID: 10030503588
  • 査読あり
• [雑誌論文] Late-replicating heterochromatin is characterized by decreased cytosine methylation in the human genome. (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki M, Oda M, Ramos MP, Pascual M, Lau K, Stasiek E, Agyiri F, Thompson RF, Glass JL, Jing Q, Sandstrom R, Fazzari MJ, Hansen RS, Stamatoyannopoulos JA, McLellan AS, Greally JM
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 21 ページ: 1833-1840
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic analysis of essential cardiac transcription factors in 256 patients with non-syndromic congenital heart defects. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kodo K, Nishizawa T, Furutani M, Arai S, Ishihara K, Oda M, Makino S, Fukuda K, Takahashi T, Matsuoka R, Nakanishi T, Yamagishi H
  • 雑誌名: Circulation Journal 巻: 76 ページ: 1703-1711
  • NAID: 10030503588
  • 査読あり
• [学会発表] Cell Type-specific Gene Body DNA Hypomethylationin Contributes to Transcriptional Efficiency in Cardiomyocyte Maturation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: 日本エピジ ェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 一橋学術総合センター(東京)
• [学会発表] Escape of Gene Body DNA Methylation in Cardiac Genes is Cooperative with the Cell Type-specific Expression Patterns. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: Weinstein meeting 2012
  • 発表場所: シカゴ(アメリ カ)
• [学会発表] Cell Type-specific Gene Body DNA Hypomethylationin Cardiac Genes Contributes to Transcriptional Efficiency in CardiomyocyteMaturation (2012)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa, and Keiichi Fukuda.
  • 学会等名: 日本循環器学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡）
• [学会発表] Escape of Gene Body DNA Methylation in Cardiac Genes is Cooperative with the Cell Type-specific Expression Patterns (2012)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa and Keiichi Fukuda.
  • 学会等名: Weinstein meeting 2012
  • 発表場所: シカゴ（アメリカ）
• [学会発表] Cell Type-specific Gene Body DNA Hypomethylationin Contributes to Transcriptional Efficiency in Cardiomyocyte Maturation (2012)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa and Keiichi Fukuda.
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 一橋学術総合センター（東京）
• [学会発表] Cell Type-specific Gene Body DNA Hypomethylationin Cardiac Genes Contributes to Transcriptional Efficiency in Cardiomyocyte Maturation. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Hirokazu Enomoto, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Shinsuke Yuasa, and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: 日本循環器学会年会
  • 発表場所: 福岡国際 会議場(福岡)
• [学会発表] DNA Methylation Changes in The b-MHC Locus Mediate Gene Regulation by Antisense RNA in Postnatal Cardiomyocyte Development. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Shinsuke Yuasa, Sung Han Yoon, Yuta Higashikuse, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Mitsushige Murata, Motoaki Sano, John M. Greally and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: American Heart Association, Scientific Sessions
  • 発表場所: オーランド(アメリカ)
• [学会発表] Gene Body DNA Methylation Level in Cardiac Myosin Heavy Chain (MHC) Gene Locus is Cell Type- and Locus- Specifically Suppressed and Contributes to the Transcriptional Efficacy at Postnatal Development of Mouse Cardiomyocytes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Shinsuke Yuasa, Ruri Kaneda, Masako Suzuki, John M. Greally and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: Weinstein meeting 2011
  • 発表場所: シンシナティ(アメリ カ)
• [学会発表] Gene Body DNA Methylation Level in Cardiac Myosin Heavy Chain (MHC) Gene Locus is Cell Type- and Locus- Specifically Suppressed and Contributes to the Transcriptional Efficacy at Postnatal Development of Mouse Cardiomyocytes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Shinsuke Yuasa, Ruri Kaneda, Masako Suzuki, John M. Greally and Keiichi Fukuda.
  • 学会等名: Weinstein meeting 2011
  • 発表場所: シンシナティ（アメリカ）
• [学会発表] DNA Methylation Changes in The b-MHC Locus Mediate Gene Regulation by Antisense RNA in Postnatal Cardiomyocyte Development (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda, Shinji Makino, Shinsuke Yuasa, Sung Han Yoon, Yuta Higashikuse, Kojiro Yae, Ruri Kaneda, Mitsushige Murata, Motoaki Sano, John M. Greally and Keiichi Fukuda
  • 学会等名: American Heart Association, Scientific Sessions
  • 発表場所: オーランド（アメリカ）
• [学会発表] Cell Type-specific Gene Body DNA Hypomethylation in Cardiac Myosin Heavy Chain (MHC) Gene Locus Contributes to Efficient Transcription at Postnatal Development of Mouse Cardiomyocytes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda
  • 学会等名: CDB Symposium 2011 "Epigenetic Landscape in Development and Disease"
  • 発表場所: RIKEN CDB, Kobe, Hyogo JAPAN.
• [学会発表] DNA Methylation Changes in the b-MHC Locus Mediate Gene Regulation by Antisense RNA in Mouse Postnatal Cardiomyocyte Development (2010)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Oda
  • 学会等名: American Heart Association Scientific Session 2010
  • 発表場所: McCormick Place, Chicago, IL, USA.
  • 年月日: 2010-11-17
• [備考] Research map
  • URL: http://researchmap.jp/odamame/
• [備考] 坂口光洋記念講座ホームページ:小田真由美
  • URL: http://www.careerpath-prj.keio.ac.jp/sakaguchi/scholar/m_oda/
• [備考] Research map
  • URL: http://researchmap.jp/odamame/
• [備考] 坂口光洋記念講座ホームページ：小田真由美
  • URL: http://www.careerpath-prj.keio.ac.jp/sakaguchi/scholar/m_oda/
• [備考]
  • URL: http://researchmap.jp/odamame/