肺高血圧症に関連するBMPによる転写制御のChIP-seq解析

• 研究課題/領域番号: 22790750
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 呼吸器内科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鯉沼 代造 東京大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (80375071)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: シグナル伝達 / ゲノム / 内科 / 病理学 / 循環器・高血圧

研究概要

特発性肺高血圧症との関係が深い骨形成因子(BMP)シグナルについて、肺動脈平滑筋細胞および血管内皮細胞を用いて、次世代シーケンサーを用いたクロマチン免疫沈降-シーケンシング法(ChIP-seq)による下流の転写因子Smad1/Smad5の網羅的結合部位同定を行った。その結果肺動脈平滑筋細胞特異的な新規標的遺伝子を同定し、siRNAや阻害剤を用いた検討によりその病態との関与を示唆する役割を見出した。

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide mechanisms of Smad binding (2013)
  • 著者名/発表者名: Morikawa M
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 32 号: 13 ページ: 1609-1615
  • DOI: 10.1038/onc.2012.191
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tumor-promoting functions of transforming growth factor-βin progression of cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyazono K, Ehata S, Koinuma D
  • 雑誌名: Ups J Med Sci 巻: 117(2) ページ: 143-152
  • 査読あり
• [雑誌論文] TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition of A549 lung adenocarcinoma cells is enhanced by pro-inflammatory cytokines derived from RAW 264. 7 macrophage cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Kawata M, Koinuma D, Ogami T, Umezawa K, Iwata C, Watabe T, and Miyazono K.
  • 雑誌名: J Biochem 巻: 151(2) ページ: 205-216
  • 査読あり
• [雑誌論文] TGF-β derives epithelial-mesenchymal transition through δEF1-mediated downregulation of ESRP (2011)
  • 著者名/発表者名: 堀口華奈
  • 雑誌名: Oncogene 巻: (掲載確定)(印刷中) 号: 26 ページ: 3190-3201
  • DOI: 10.1038/onc.2011.493
  • 査読あり
• [雑誌論文] RB1CC1 protein positivelyregulates transforming growth factor-beta signaling through the modulation of Arkadia E3 ubiquitin ligase activity (2011)
  • 著者名/発表者名: Koinuma D, Shinozaki M, Nagano Y, Ikushima H, Horiguchi K, Goto K, Chano T, Saitoh M, Imamura T, Miyazono K, and Miyazawa K.
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286(37) ページ: 32502-32512
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChIP-seq reveals cell type-specific binding patterns of BMP-specific Smads and a novel binding motif (2011)
  • 著者名/発表者名: Morikawa M, Koinuma D, Tsutsumi S, Vasilaki E, Kanki Y, Heldin CH, Aburatani H, Miyazono K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39(20) ページ: 8712-8727
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell type-specific target selection by combinatorial binding of Smad2/3 proteins and hepatocyte nuclear factor 4 alpha in HepG2 cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Mizutani A, Koinuma D, Tsutsumi S, Kamimura N, Morikawa M, Suzuki HI, Imamura T, Miyazono K, Aburatani H.
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286(34) ページ: 29848-29860
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChIP-seq reveals cell type-specific binding patterns of BMP-specific Smads and a novel binding motif (2011)
  • 著者名/発表者名: Morikawa M, Koinuma D, Tsutsumi S,Vasilaki E, Kanki Y, Heldin CH, Aburatani H, Miyazono K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39(20) 号: 20 ページ: 8712-27
  • DOI: 10.1093/nar/gkr572
  • 査読あり
• [雑誌論文] TGF-βによる転写制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鯉沼代造
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 234 ページ: 900-905
• [学会発表] 次世代シーケンサーが明らかにするTGF-βファミリーシグナルの転写制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 鯉沼代造
  • 学会等名: 第27回つくば分子病理学セミナー
  • 発表場所: 筑波大学(茨城県)(招待講演)
  • 年月日: 2012-02-08
• [学会発表] Change in alternative splicing of FGFR during TGF-β-induced EMT. The 1st International Symposium by JSPS Core-to-Core Program (2012)
  • 著者名/発表者名: Horiguchi K, Koinuma D, Semba K, Miyazawa K, Miyazono K, Saitoh M.
  • 学会等名: Cooperative International Framework in TGF-βFamily Signaling
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール(東京都)
  • 年月日: 2012-01-23
• [学会発表] Inhibitory mechanism of Thyroid transcription factor-1 on TGF-βsignaling in lung cancer cells. The 1st International Symposium by JSPS Core-to-Core Program (2012)
  • 著者名/発表者名: Isogaya K, Koinuma D, Tsutsumi S, Saito RA, Miyazawa K, Aburatani H, Miyazono K.
  • 学会等名: Cooperative International Framework in TGF-βFamily Signaling
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール(東京都)
• [学会発表] Mechanism of Smad Signaling Modification by TTF1 in lung Cancer Cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Isogaya K, Koinuma D, Tsutsumi S, Saito RA, Aburatani H, Miyazono K
  • 学会等名: UCSF, 36th Annual Tetrad Research Conference
  • 発表場所: Lake Tahoe, U. S. A.
• [学会発表] ChIP-seq reveals cell-type specific binding patterns of BMP-specific Smads and a novel binding motif (2011)
  • 著者名/発表者名: Morikawa M, Koinuma D, Tsutsumi S, Vasilaki E, Kanki Y, Heldin CH, Aburatani H, Miyazono K.
  • 学会等名: FASEB Summer Research Conferences on the TGF-βSuperfamily
  • 発表場所: Lucca, Italy
• [学会発表] "Cistrome" of the TGF-β-Smad signaling pathway (2010)
  • 著者名/発表者名: 鯉沼代造
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: ポートピアホテル(兵庫県 神戸市)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Characterization of Smad2 and Smad3 binding sites by genome-wide ChIP-chip/ChIP-sequencing analysis (2010)
  • 著者名/発表者名: 鯉沼代造
  • 学会等名: 藤原セミナー
  • 発表場所: グランドホテルニュー王子(北海道 苫小牧市)
  • 年月日: 2010-07-16