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蛍光性核酸結合リガンド群を用いたマルチカラー蛍光アッセイ法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22850001
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 分析化学
研究機関東北大学

研究代表者

佐藤 雄介  東北大学, 大学院・理学研究科, 助教 (90583039)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2011年度: 1,495千円 (直接経費: 1,150千円、間接経費: 345千円)
2010年度: 1,625千円 (直接経費: 1,250千円、間接経費: 375千円)
キーワードAP site / 蛍光性リガンド / シアニン誘導体 / マルチカラー蛍光解析 / 遺伝子解析 / 化学センサー / バイオセンサー / 蛍光リガンド / 核酸 / マルチカラー
研究概要

脱塩基部位結合リガンドと蛍光応答性インターカレーターとを連結した一連のコンジュゲートを設計・合成し、これら新規コンジュゲートを用いて遺伝子解析(一塩基多型検出)へと適用した。ここでは、多彩な蛍光波長を示すシアニン色素を当該設計におけるインターカレーターとして用いることに着目し、脱塩基部位対面ピリミジン塩基選択性を有する青・緑・赤色蛍光応答型コンジュゲートを開発することに成功した。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] Base-Pairing at the AbasicSite in DNA Duplexes and Its Application for Adenosine Aptasensors2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Pang, Z. Xu, Y. Sato, S. Nishizawa and N. Teramae
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 13 号: 3 ページ: 436-442

    • DOI

      10.1002/cbic.201100666

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Label-free molecular beacon system based on DNAs containing abasic site and fluorescent ligands that bind abasic sites2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Sato, S. Nishizawa, N. Teramae
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 17 号: 41 ページ: 11650-11656

    • DOI

      10.1002/chem.201100384

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluorescent trimethyl-substituted naphthyridine as a ligand for C-C mismatch detection in CCG trinucleotide repeats2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Sato, A. Honjo, D. Ishikawa, S. Nishizawa and N. Teramae
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 47 号: 20 ページ: 5885-5887

    • DOI

      10.1039/c1cc11370d

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluorescence detection of small molecules based on adaptive transitions of abasic site-containing aptamers in combination with abasic site-binding ligands2011

    • 著者名/発表者名
      Z. Xu, Y. Sato, S. Nishizawa, and N. Teramae
    • 雑誌名

      Biosens. Bioelectron.

      巻: 26 号: 12 ページ: 4733-4738

    • DOI

      10.1016/j.bios.2011.05.051

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of substituents of alloxazine derivatives on the selectivity and affinity foradenine in AP site-containing DNA duplexes2010

    • 著者名/発表者名
      Burki Rajendar, Arivazhagan Rajendran, Zhiqiang Ye, Eriko Kanai, Yusuke Sato, Seiichi Nishizawa, Marek Sikorski, Norio Teramae
    • 雑誌名

      Org.Biomol.Chem.

      巻: 8 ページ: 4849-4859

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancement in fluorescence response by a quencher for amiloride upon binding to thymine opposite an abasic site in a DNA duplex2010

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Sato, Jing Tian, Toshiki Ichihashi, Yuka CHinda, Zhiai Xu, Yuanfeng Pang, Seiichi Nishizawa, Norio Teramae
    • 雑誌名

      Anal.Chim.Acta

      巻: 675 ページ: 49-52

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Abasic site-based DNA aptamers for analytical applications2010

    • 著者名/発表者名
      Seiichi Nishizawa, Yusuke Sato, Zhiai Xu, Kotaro Morita, Minjie Li, Norio Teramae
    • 雑誌名

      Supramol.Chem.

      巻: 22 ページ: 467-476

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of the bases flanking an abasic sie on the recognition of nucleobase by amloride2010

    • 著者名/発表者名
      Arivazhagan Rajendra, Chunxia Zhao, Burki Rajendar, Viruthachalam Thiagarajan, Yusuke Sato, Seiichi Nishizawa, Norio Teramae
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta

      巻: 1800 ページ: 599-610

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マルチカラー蛍光アッセイを指向した脱塩基部位結合リガンド群の開発2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、工藤恵、王春霞、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      日本化学会第92春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] マルチカラー蛍光アッセイを指向した脱塩基部位結合リガンド群の開発2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、工藤恵、王春霞、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      日本化学第92春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Ratiometric fluorescence signaling of naphthyridine-DBD conjugate for the analysis of thymine-related single-base mutation2011

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Sato, Chunxia Wang, Seiichi Nishizawa, Norio Teramae
    • 学会等名
      3rd Asian Spectroscopy Conference
    • 発表場所
      Xiamen University China
    • 年月日
      2011-11-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ナフチリジン-シアニン誘導体コンジュゲートの合成と遺伝子解析への応用2011

    • 著者名/発表者名
      工藤恵、佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      みちのく分析科学シンポジウム2011
    • 発表場所
      山形大学
    • 年月日
      2011-07-23
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA脱塩基部位結合能を有するレシオ蛍光応答型リガンドの開発2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、王春霞、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      生体機能関連化学部会若手の会第23回サマースクール
    • 発表場所
      宮島グランドホテル有もと
    • 年月日
      2011-07-22
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Highly Strong Binding of Small Lignd to an Abasic Site in a RNA Duplex and Its Application to MicroRNA Detection2011

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Sato, Seiichi Nishizawa, Norio Teramae
    • 学会等名
      IUPAC International Congress on Analytical Sciences 2011 (ICAS 2011)
    • 発表場所
      国立京都図書会館
    • 年月日
      2011-05-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光性DNA結合小分子を核酸へのラベル化試薬として利用する2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      第13回フロンティア生命化学研究会シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学片平キャンパス
    • 年月日
      2011-01-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Light-up response to pyrimidine nucleobase opposite an abasic site in DNA duplexes by naphthyridine-cyanine conjugates2011

    • 著者名/発表者名
      Megumi Kudo, Yusuke Sato, Seiichi Nishizawa, and Norio Teramae
    • 学会等名
      3rd Asian Spectroscopy Conference
    • 発表場所
      Xiamen University, China
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 脱塩基部位を標的とする核酸結合リガンドの開発と遺伝子解析への応用2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      日本分析化学会第60年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] ナフチリジン-シアニン誘導体コンジュゲートを用いた核酸発蛍光検出2011

    • 著者名/発表者名
      工藤恵、佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      日本分析化学会第60年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Design of label-free moleculaz beacons based on an abasic site-binding fluorescent molecule2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      2010環太平洋国際会議PACIFICHEM 2010
    • 発表場所
      ハワイコンベンションセンター, 米国
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光性ピラジン誘導体を用いたmicroRNA検出:蛍光特性の改良2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、市橋俊希、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光性ピラジン誘導体を用いたmicroRNA検出2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、市橋俊希、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      日本分析化学会第59年会
    • 発表場所
      東北大学川内キャンパス
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光性小分子を用いた核酸非共有結合ラベル化法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介、西澤精一、寺前紀夫
    • 学会等名
      東京カンファレンス2010
    • 発表場所
      幕張メッセ国際会議場
    • 年月日
      2010-09-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 脱塩基部位含有DNA二重鎖 を用いた生体関連基質検出2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤雄介
    • 学会等名
      平成22年度日本分析化学東北支部若手交流会
    • 発表場所
      秋田大学ベンチャーラボラトリー(依頼公演)
    • 年月日
      2010-07-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-27   更新日: 2016-04-21  

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