研究課題/領域番号 |
22H03689
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
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研究機関 | 東京電機大学 |
研究代表者 |
佐藤 健吾 東京電機大学, システム デザイン 工学部, 教授 (20365472)
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研究分担者 |
加藤 有己 大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (10511280)
河原 行郎 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (80542563)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
13,780千円 (直接経費: 10,600千円、間接経費: 3,180千円)
2023年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2022年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
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キーワード | RNA二次構造 / RNA修飾 / 深層学習 / バイオインフォマティクス / ナノポアシークエンサー |
研究開始時の研究の概要 |
近年の研究から,RNA修飾を介した遺伝子発現制御に関する画期的な発見が続いており,RNAの機能と二次構造の相関が注目されている.本研究では,RNAの機能と構造の網羅的な相関解析へ向けて,その基盤となるRNA二次構造決定のための新しい技術を開発する.具体的には,本研究代表者が開発したMXfold2をベースにして,RNA修飾を考慮した二次構造予測を実現する.ナノポアシークエンサーで修飾塩基と二次構造プロファイルを同時計測する手法を確立し,それを弱教師データとして利用することによって,RNA修飾を考慮しつつ二次構造を高精度に予測するモデルを獲得する.
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