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パレオゲノミクスによるマヤ文明コパン王朝のダイナミクス解明

研究課題

研究課題/領域番号 22H04928
研究種目

基盤研究(S)

配分区分補助金
審査区分 大区分A
研究機関公立小松大学 (2023-2025)
金沢大学 (2022)

研究代表者

中村 誠一  公立小松大学, サステイナブルシステム科学研究科, 特別招聘教授 (10261249)

研究分担者 伊藤 伸幸  名古屋大学, 人文学研究科, 助教 (40273205)
中込 滋樹  金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 客員准教授 (40625208)
市川 彰  金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 准教授 (90721564)
研究期間 (年度) 2022-04-27 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
196,300千円 (直接経費: 151,000千円、間接経費: 45,300千円)
2025年度: 29,900千円 (直接経費: 23,000千円、間接経費: 6,900千円)
2024年度: 37,180千円 (直接経費: 28,600千円、間接経費: 8,580千円)
2023年度: 34,450千円 (直接経費: 26,500千円、間接経費: 7,950千円)
2022年度: 79,690千円 (直接経費: 61,300千円、間接経費: 18,390千円)
キーワードコパンのマヤ遺跡 / マヤ文明 / パレオゲノミクス / コパン王朝 / ティカル国立公園 / コパン王朝史 / ティカル遺跡
研究開始時の研究の概要

パレオゲノミクスは、遺跡に埋まっている古人骨から大量のゲノム情報を抽出して、従来型の考古学研究では明確に可視化できなかった血縁関係、婚姻システム、社会構造、他地域社会との混血といった諸相を科学的に解明しようとする分野である。本研究では、パレオゲノミクスをアメリカ大陸の古代マヤ文明の本格的な研究に世界で初めて適用する。その舞台は、ホンジュラスの世界遺産「コパンのマヤ遺跡」である。王墓出土の古人骨を含む数百点の人骨から、大量のゲノム情報を抽出・解析し、王朝の起源、他のマヤ王家との婚姻関係、王国崩壊の要因など、従来の研究では仮説にとどまっていた諸相に切り込み、コパン王朝のダイナミクスを解明する。

研究実績の概要

今年(2024年)度は、本研究の最初のスクリーニングにおいてヒト由来の内在DNA率の高かった古典期コパンの7個体のゲノム解析が行われ、現代集団のみならず先行研究で発表されている約700個体に及ぶアメリカ大陸のパレオゲノムデータと比較・統合することで、古典期コパンの遺伝的祖先の起源を明らかにすることを目指した。その結果、古典期コパンの個体は、現代マヤ集団だけでなく、古期後期(Late Archaic)や古典期終末期(Terminal Classic)のマヤ集団、さらには植民地期のマヤ集団とも遺伝的に近いことが判明した。つまり、古期後期から現代に至るまで、マヤ地域においては一定の遺伝的連続性があったことが示唆されている。一方で、古期後期と古典期のマヤ集団を比較すると、古典期の集団にはメキシコ南部の高地に由来する集団との遺伝的親和性が認められた。これにより、古典期マヤ文明の成立に伴ってマヤ地域への遺伝子流動が起こった可能性が考えられる。さらに、マヤ地域における集団サイズの変動を調べたところ、トウモロコシの栽培が活発になり始めた古期後期から古典期にかけて集団が拡大した一方で、古典期の終わりから植民地期にかけては集団の減少が確認された。これは、古典期マヤ文明の崩壊に伴い、人口が急減したことを示唆している。
一方、研究代表者は、コパン遺跡の7号神殿、8号神殿において発掘調査を継続し、10数体の新たな埋葬資料を確保した。また、2023年度末に発見された石碑64の碑文情報からコパン王家の起源地の可能性があるリオ・アスール遺跡出土の王を含む人骨を本研究に加えるため、グアテマラ政府機関と交渉し分析許可を取得した。現在、1987年にリオ・アスール遺跡で発掘された埋葬資料からパレオゲノミクス用の資料を採取し日本のラボへの輸出手続きをはじめているところである。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度(2024年度)、パレオゲノム解析を担当する研究分担者と研究協力者のチームは共同で、古典期コパンに由来する7個体のゲノム解析を進めるとともに、さらなるゲノムデータ生成に向けて、古典期のコパン遺跡やティカル遺跡出土の古人骨試料のスクリーニングを実施した。その結果、100サンプル以上の古人骨試料のスクリーニングが行われ、これまで日本の金沢大学のラボへ移送された古典期のコパン遺跡とその関連諸遺跡から出土した古人骨試料250点以上のすべてに関して、昨年度の末までに、ヒト由来のDNAの有無の確認や、DNAが残存する場合の内在率を知るためのスクリーニング調査が完了した。
一方で、研究代表者のグループは、コパン遺跡で発掘調査を続け当初計画には含まれていなかった新たな埋葬を発見・登録するとともに、金沢大学ラボでのゲノム採取と解析結果を独立に検証するため、アイルランドのダブリン大学のラボにその一部を、無事、送付することができた。また、昨年度発見された石碑64の碑文によれば、コパン王朝の起源とそのダイナミクスを解明するうえで決定的に重要なリオ・アスールの古人骨サンプルの一部もグアテマラの研究所倉庫で確認できた。
つまり、基盤研究(S)で当初予定されていた研究代表者の資料250体以上のすべてのスクリーニング調査が3年度目までに終わったことに加え、研究目的を達成するうえで、当初計画にはなかった新たな補完資料も蓄積されてきたため、基盤研究(S)は順調に進展していると判断している。

今後の研究の推進方策

2025年度は、これまで実施したスクリーニング結果をもとに、ヒトの内在DNAが高い試料を優先的に選定し、全ゲノムデータの生成を進め、個人間の親族関係の同定などパーソナル・ゲノミクスの研究に入っていく予定である。一方、研究代表者の考古学チームは、コパン遺跡の7号神殿、8号神殿において発掘調査を継続し、新たな埋葬資料を確保するとともに、テキサス大学の研究者と共同して、同大学のラボに1980年代に移送されて形質人類学的な研究に付され、そこに保管されたままになっているリオ・アスール遺跡出土の王墓人骨を同定し、グアテマラ人類学歴史学研究所(IDAEH)の許可を取って日本へ移送し解析にかけることを目指したい。また、上記のプロセスとともに、ダブリン大学へ自己資料の歯のサンプルを移送し、金沢大学での分析結果を検証するとともに、研究分担者のチームがパレオゲノミクスにおける新たな解析方法を開発する手助けを進める。こういった進展により、研究代表者のプロジェクト資料ではない新たな資料の分析や、ホンジュラス国内で獲得された新たな追加資料の側頭骨から、ドリルによって骨粉をサンプリングするラボ助手1名を雇用する。
研究チームが追い求める一親等から五親等までの幅広い血縁関係を復元するためには、王家の人間から農民まで、複数階層からの時代ごとの埋葬サンプルが必要であり、令和7(2025)年度には、コパンにおける発掘調査も継続し新たな自己資料の獲得を進めていく計画であるが、これまでの本研究の成果により、ホンジュラス政府から新たに委託された人骨資料の収集、サンプリングにも注力する。またこれまでの研究成果を、11月にアメリカで実施されるアメリカ人類学会で発表するとともに、よりインパクトファクターの高い雑誌への新たな研究成果の投稿・出版を目指す。

評価結果
中間評価

A: 順調に研究が進展しており、期待どおりの成果が見込まれる

報告書

(6件)
  • 2024 実績報告書   中間評価(所見) ( PDF )
  • 2023 実績報告書
  • 2022 研究概要(採択時) ( PDF )   審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (52件)

すべて 2025 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (9件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (24件) (うち国際学会 9件、 招待講演 2件) 図書 (6件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] 国立人類学歴史学研究所(ホンジュラス)

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [国際共同研究] 人類学歴史学研究所(グアテマラ)

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [国際共同研究] 文化遺産局(エルサルバドル)

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [国際共同研究] ホンジュラス国立人類学歴史学研究所(ホンジュラス)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] グアテマラ文化自然遺産副省ティカル国立公園(グアテマラ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] ダブリン大学(アイルランド)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] ホンジュラス国立人類学歴史学研究所(ホンジュラス)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] 文化自然遺産副省文化自然遺産局ティカル国立公園(グアテマラ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] ダブリン大学(アイルランド)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Ancient genomes reveal demographic trajectories during the Classic Maya period2025

    • 著者名/発表者名
      M.Murray, Seiichi Nakamura, Shigeki Nakagome et al.
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 35 号: 11 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1016/j.cub.2025.05.002

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Medieval genomes from eastern Mongolia share a stable genetic profile over a millennium2024

    • 著者名/発表者名
      Lee Juhyeon、Sato Takehiro、Tajima Atsushi、Amgalantugs Tsend、Tsogtbaatar Batmunkh、Nakagome Shigeki、Miyake Toshihiko、Shiraishi Noriyuki、Jeong Choongwon、Gakuhari Takashi
    • 雑誌名

      Human Population Genetics and Genomics

      巻: 4 ページ: 1-11

    • DOI

      10.47248/hpgg2404010004

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 横位に出土した素面”石碑”に関する一考察2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤伸幸
    • 雑誌名

      名古屋大学人文学研究論集

      巻: 7 ページ: 389-408

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] チャルチュアパ遺跡における素面石碑2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤伸幸
    • 雑誌名

      名古屋大学人文学研究論集

      巻: 6 ページ: 341-368

    • DOI

      10.18999/jouhunu.6.341

    • ISSN
      2433-233X
    • URL

      https://nagoya.repo.nii.ac.jp/records/2005442

    • 年月日
      2023-03-31
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ホンジュラス共和国 コパン(Copan)遺跡2023

    • 著者名/発表者名
      中村誠一
    • 雑誌名

      考古学研究

      巻: 70 ページ: 112-114

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 火山灰が創る景観2023

    • 著者名/発表者名
      市川彰
    • 雑誌名

      景観で考える-人類学と考古学からのアプローチ

      巻: 1 ページ: 125-143

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Los monumentos lisos en Mesoamerica2023

    • 著者名/発表者名
      Ito Nobuyuki
    • 雑誌名

      XXXVI Simposio de Investigaciones Arqueologicas en Guatemala

      巻: XXXVI ページ: 1-10

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Becoming Mesoamerican Archaeologists and recognized world-wide: A text mining analysis of Japaneses scholarship2023

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa Akira and Fukaya Misaki
    • 雑誌名

      Studies in Ancient Civilizations

      巻: 1 ページ: 157-176

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Becoming Mesoamerican archaeologists and recognized worldwide: A text mining analysis of Japanese scholarship2023

    • 著者名/発表者名
      Akira Ichikawa and Misaki Fukaya
    • 雑誌名

      Japanese Contributions to the Studies of Mesoamerican Civilizations: the 40th Anniversary of La Entrada Archaeological Project (Studies in Ancient Civilizations 1)

      巻: 1 ページ: 157-176

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Resena del Proyecto Arqueologico La Entrada (Primera Fase 1984-1989, Segunda Fase 1990-1994)2023

    • 著者名/発表者名
      Seiichi Nakamura
    • 雑誌名

      Japanese Contributions to the Studies of Mesoamerican Civilizations: the 40th Anniversary of La Entrada Archaeological Project (Studies in Ancient Civilizations 1)

      巻: 1 ページ: 1-7

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Las figurillas encontradas en El Trapiche, Chalchuapa2022

    • 著者名/発表者名
      Aiba, Nobuhiko y Nobuyuki Ito
    • 雑誌名

      XXXIV Simposio de Investigaciones Arqueologicas en Guatemala

      巻: 34 ページ: 861-871

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Nuevos datos e interpretaciones sobre la historia dinastica del periodo Clasico Temprano de Copan, Honduras.2024

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Seiichi
    • 学会等名
      37 Simposio de Investigaciones Arqueologicas de Guatemala
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] La importancia de los rescates arqueologicos en Honduras2024

    • 著者名/発表者名
      Fuentes, Melvin., S. Escobar, Seiichi Nakamura y M. Ogawa
    • 学会等名
      37 Simposio de Investigaciones Arqueologicas de Guatemala
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ホンジュラスの世界遺産「コパンのマヤ遺跡」最新発掘調査報告2024

    • 著者名/発表者名
      中村誠一
    • 学会等名
      岡山大学文明動態学研究所マンスリー研究セミナー
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] コパン研究とパレオゲノミクス2023

    • 著者名/発表者名
      中村誠一
    • 学会等名
      「パレオゲノミクスと次世代マヤ考古学」科研費基盤(S)研究の進捗状況報告シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 物質文化からみた非マヤ系民族とコパン王朝の交流:エルサルバドルの考古学調査から2023

    • 著者名/発表者名
      市川彰
    • 学会等名
      「パレオゲノミクスと次世代マヤ考古学」科研費基盤(S)研究の進捗状況報告シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 古人骨のゲノム解析から何が分かるのか?2023

    • 著者名/発表者名
      中込滋樹
    • 学会等名
      「パレオゲノミクスと次世代マヤ考古学」科研費基盤(S)研究の進捗状況報告シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 古人骨からゲノムを読む~コパン遺跡の現場から2023

    • 著者名/発表者名
      覚張隆史
    • 学会等名
      「パレオゲノミクスと次世代マヤ考古学」科研費基盤(S)研究の進捗状況報告シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] チャルチュアパ遺跡のフラスコ状ピット出土種子2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤伸幸
    • 学会等名
      古代アメリカ学会研究大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] More than a glimpse into the human past: genome-wide imputation of ancient genomes2022

    • 著者名/発表者名
      Madeline Murray, Niall Cooke, Lara Cassidy, Daniel Bradley, Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      Reconstructing the human past using ancient and modern genomics, Heidelberg, Germany (poster)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Tracing genetic origins and legacy of Japanese populations: insights from ancient genomics in insular East Asia2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      Seminar at University College London, London, UK (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Exploring the past to understand our health today: an ancient genomics study in insular East Asia2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      Seminar at Trinity Translational Research Institute, Dublin, Ireland (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Genomic insights into human past and health from a study of insular East Asia2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      TTMI Annual Conference, Dublin, Ireland (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Ancient human and pathogen genomics in the Japanese archipelago2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      Paleogenomics and Paleopathology - Future perspective -, Online (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] A paleogenomic time travel to pre- and proto-historic Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      TCD Asian Studies Lecture Series, Dublin, Ireland (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Paleogenomic analysis on human demography and adaptation in insular East Asia2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Nakagome
    • 学会等名
      ASHBi Seminar, Kyoto, Japan (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] パレオゲノミクスから探る現代日本人のルーツ2022

    • 著者名/発表者名
      中込滋樹
    • 学会等名
      第33回高遠・分子細胞生物学シンポジウム, オンライン (Talk)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Los monumentos lisos en el paisaje urbano de Chalchuapa2022

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Ito
    • 学会等名
      XXXV Simposio de Investigaciones Arqueologicas en Guatemala
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Intercambio cultural entre el Golfo de Mexico y Centroamerica2022

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Ito
    • 学会等名
      Cumbre Olmeca, Secretario de Turismo y Cultura del Estado de Veracruz, Coatzacoalcos, Mexico
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] チャルチュアパ遺跡エル・トラピチェ地区 2022 年夏の調査2022

    • 著者名/発表者名
      伊藤伸幸
    • 学会等名
      古代アメリカ学会第27回研究発表大会、名古屋大学
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 火山灰が創る世界/景観2022

    • 著者名/発表者名
      市川彰
    • 学会等名
      第三回景観考古学・人類学研究会。東京都立大学。
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Mesoamerican salt workshop buried by the TBJ Eruption: Archaeological Investigation at Nueva Esperanza Pacific Coast of El Salvador2022

    • 著者名/発表者名
      Akira Ichikawa and Rocio Herrera
    • 学会等名
      4th International Congress on the Anthropology of Salt. Louisiana State University, Barton Rouge.
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cooperacion internacional japonesa en arqueologia de Honduras; Resultados de 40 anos de historia y perspectiva en el future2022

    • 著者名/発表者名
      Seiichi Nakamura
    • 学会等名
      I Jornada de arqueologia en conmemoracion de 70 anos de fundacion de IHAH
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Exploracion no destructiva de cavidades desconocidas dentro del Templo 11 (Estructura 10L-11) mediante imagenes de rayos cosmicos2022

    • 著者名/発表者名
      Kunihiro Morishima, Nobuko Kitagawa, Seiichi Nakamura et al.
    • 学会等名
      I Jornada de arqueologia en conmemoracion de 70 anos de fundacion de IHAH
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マヤ文明コパン遺跡における先端技術を導入した調査研究プロジェクトと 文化庁「文化遺産国際協力拠点交流事業」の令和4年度実施報告2022

    • 著者名/発表者名
      中村誠一
    • 学会等名
      文化遺産国際協力コンソーシ アム第19回中南米分科会(オンライン開催)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] 博物館DXと次世代考古学2024

    • 著者名/発表者名
      中村誠一など。 野口淳、村野正景編。
    • 総ページ数
      188
    • 出版者
      雄山閣
    • ISBN
      9784639030003
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [図書] Investigaciones Arqueologicas en el Area de Tazumal de la Zona Arqueologica de Chalchuapa2024

    • 著者名/発表者名
      Ito Nobuyuki
    • 総ページ数
      120
    • 出版者
      Universidad Tecnologica de El Salvador
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [図書] Japanese Contributions to the Studies of Mesoamerican Civilizations2023

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Seiichi et al. eds
    • 総ページ数
      177
    • 出版者
      Kanazawa University
    • ISBN
      9784944014378
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [図書] Jpanese Contributions to the Studies of Mesoamerican Civilizations: the 40th Anniversary of La Entrada Archaeological Project (Studies in Ancient Civilizations 1)2023

    • 著者名/発表者名
      Seiichi Nakamura, Takuro Adachi, and Masahiro Ogawa eds.
    • 総ページ数
      177
    • 出版者
      Institute for the Study of Ancient Civilizations and Cultural Resources, Kanazawa University
    • ISBN
      9784944014378
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] ポストGWAS時代の遺伝統計学 オミクス解析と機械学習でヒト疾患を俯瞰する2023

    • 著者名/発表者名
      岡田随象(編)、中込滋樹 他
    • 総ページ数
      232
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758104104
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] Mesoamerica: El Estudio de sus Procesos de Transformacion Social desde una Perspectiva de Larga Duracion2022

    • 著者名/発表者名
      Rodrigo Liendo, Kazuo Aoyama, Nobuyuki Ito et al.
    • 総ページ数
      234
    • 出版者
      Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Instituto de Investigaciones Antropologicas
    • ISBN
      9786073067973
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] パレオゲノミクスによるマヤ文明コパン王朝のダイナミクス解明

    • URL

      https://maya-copan-tikal.jp/index.html

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  • [備考] パレオゲノミクスによるマヤ文明コパン王朝のダイナミクス解明

    • URL

      https://maya-copan-tikal.jp/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2026-01-26  

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