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DNA情報に基づく水生昆虫の流域内多様性評価手法の構築と流域管理への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22K04374
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分22060:土木環境システム関連
研究機関山梨大学

研究代表者

八重樫 咲子  山梨大学, 大学院総合研究部, 准教授 (30756648)

研究分担者 大槻 順朗  山梨大学, 大学院総合研究部, 准教授 (10618507)
渡辺 幸三  愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 教授 (80634435)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード水生昆虫 / DNAバーコーデイング / 環境DNA / 流域管理 / DNAバーコーディング / 底生動物 / DNAメタバーコーディング
研究開始時の研究の概要

本研究では山間部を流下する河川の生物多様性保全を目的とした水生昆虫多様性評価手法の構築と,構築された手法を利用した流域生態系保全方法の検討を行う.一般的な水生昆虫多様性調査は種の同定手法の複雑さとその労力のために,大量かつ正確に実施するのが難しい.そこでDNAデータベースの拡充と,解析手法を検討することでDNA情報に基づく水生昆虫多様性調査手法を構築する.そして,流域の環境の変動が山間部を流下する富士川水系の水生昆虫の種多様性および遺伝的多様性に与える影響を明らかにする.

研究成果の概要

河川生態系の保全を目的として河川水辺の国勢調査など各地で水生生物の調査が行われているが,種の同定には専門的な知識と労力が必要となる.そこで本研究では,DNAメタバーコーディングを用いた水生昆虫多様性調査を検討した.まず,NGSを利用したDNAデータベースの構築方法を検討し,流域内の水生昆虫DNA情報を収集してバーコーディングに利用をすることで,検出力が高まることを明らかにした.また,DNAバーコーディングを行うことで,幼虫では同定することが難しい分類群であっても種名を得ることができ,特有の環境に生息すると考えられる種が存在する可能性を示した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

底生動物は環境評価のための情報量が多く,生物採集と形態同定に基づく分析を行うことで生息種リストを作成するのが一般的である.しかしこの方法には,分析が困難である個体や種の存在,大量の標本を分析する労力といった問題点がある.そこで本研究ではDNA情報を活用した種の同定を行うことで,より簡易な底生動物を用いた環境評価を実現することを目的とした.その結果,流域内の水生昆虫DNAデータベースを構築することで,効果的な種多様性評価が実現する可能性を示した.また,本手法では形態では分類できない個体であっても種まで分類できる場合があり,より高解像度の環境分析が可能となることが示された.

報告書

(4件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2025 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (24件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] 扇状地氾濫原水域における水温変動特性と魚類の生息分布特性2025

    • 著者名/発表者名
      大槻 順朗, 江口 陽太朗, 八重樫 咲子, 田和 康太
    • 雑誌名

      土木学会論文集

      巻: 81 号: 16 ページ: n/a

    • DOI

      10.2208/jscejj.24-16208

    • ISSN
      2436-6021
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 鬢櫛川におけるアユおよびヒゲナガカワトビケラの環境DNA濃度の日周変動2024

    • 著者名/発表者名
      許 玉銓, Niva Sthapit, 原本 英司, 八重樫 咲子
    • 雑誌名

      土木学会論文集

      巻: 80 号: 25 ページ: n/a

    • DOI

      10.2208/jscejj.24-25021

    • ISSN
      2436-6021
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparison of eDNA, bulk-sample metabarcoding, and morphological approaches: A case study of riverine benthic macroinvertebrate communities2023

    • 著者名/発表者名
      Doloiras-Larano Arnelyn D.、Yaegashi Sakiko、Serrana Joeselle M.、Ishitani Naoto、Watanabe Kozo
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Investigation of a method for surveying aquatic insects using DNA barcoding of environmental DNA2023

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI
    • 雑誌名

      14th International symposium on Ecohydraulics

      巻: 14

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 八ヶ岳周辺の遺跡と水資源の関係性に関する研究2025

    • 著者名/発表者名
      村岡宏晃,中村高志,八重樫咲子
    • 学会等名
      第52回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] DNA分析に基づく甲府盆地内のユスリカの多様性解析2025

    • 著者名/発表者名
      渡邉響,八重樫咲子
    • 学会等名
      第52回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] ホルマリン標本を用いたDNAデータベース作製のためのDNA抽出方法の検討2025

    • 著者名/発表者名
      藤原陸,髙木滉之佑,八重樫咲子
    • 学会等名
      第52回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] Biomonitoring of Riverine Species in Yamanashi Prefecture Using Environmental DNA Method2025

    • 著者名/発表者名
      Norhayati Binti Mohd Nazar, Niva Sthapit, Sakiko Yaegashi
    • 学会等名
      第52回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 扇状地河川におけるマイクロハビタットの流呈及び流域分布と礫列による多様性の増加2025

    • 著者名/発表者名
      唐沢和輝,大槻順朗,八重樫咲子
    • 学会等名
      第52回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 鬢櫛川における環境DNA濃度の時間変動2024

    • 著者名/発表者名
      許玉銓,Niva Sthapit, 原本英司,八重樫咲子
    • 学会等名
      第8回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAから得られる水生生物情報の時間変動2024

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,許玉銓,Niva Sthapit, 原本英司
    • 学会等名
      第8回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] Diurnal dynamics of environmental DNA from fish and macroinvertebrate2024

    • 著者名/発表者名
      YuQuan Xu, Niva Sthapit, Eiji Haramoto, Sakiko Yaegashi
    • 学会等名
      The 14th Conference of International Consortium of Landscape and Ecological Engineering
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Temporal Analysis of Microbial Source Tracking Markers in Environmental DNA Using Multiplex Digital PCR2024

    • 著者名/発表者名
      Niva Sthapit, Norhayati Binti Mohd Nazar, Eiji Haramoto, Sakiko Yaegashi
    • 学会等名
      The 14th Conference of International Consortium of Landscape and Ecological Engineering
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 鬢櫛川におけるアユおよびヒゲナガカワトビケラの環境DNA 濃度の日周変動2024

    • 著者名/発表者名
      許玉銓・Niva Sthapit・原本英司・八重樫咲子
    • 学会等名
      第61回環境工学研究フォーラム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 扇状地氾濫原水域における水温変動特性と魚類の生息分布特性2024

    • 著者名/発表者名
      大槻順朗,江口陽太朗,八重樫咲子,田和 康太
    • 学会等名
      第69回水工学講演会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 山梨県内の河川における付着藻類量の調査2024

    • 著者名/発表者名
      張一歌,八重樫咲子
    • 学会等名
      第51回土木学会関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 水生生物の活動の日周性に伴う環境DNA検出状況の変動2024

    • 著者名/発表者名
      許玉銓,Niva Sthapit,八重樫咲子
    • 学会等名
      第51回土木学会関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ホルマリン標本を用いたDNAデータベース作成のためのDNA分析方法の検討2024

    • 著者名/発表者名
      髙木滉之佑,八重樫咲子
    • 学会等名
      第51回土木学会関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Development and availability of a local DNA database for DNA meta-barcoding of aquatic insects2023

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Aoi HAMAMOTO, Yuto SASAKI, Yuta HASEBE
    • 学会等名
      The eDNA Society International Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 環境DNAを用いたユスリカの流域内種多様性の解析2023

    • 著者名/発表者名
      野村虹之介,藤原正季,金子栄廣,八重樫咲子
    • 学会等名
      第50回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] シカの糞を対象としたDNAメタバーコーディングによる食性解析2023

    • 著者名/発表者名
      宗形亮,原本英司,金子栄廣,八重樫咲子
    • 学会等名
      第50回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 水生昆虫のメタバーコーディングのためのDNAデータベースの拡充2023

    • 著者名/発表者名
      濱本碧海,金子栄廣,八重樫咲子
    • 学会等名
      第50回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 環境DNA 解析を利用したヌタ場利用哺乳類の調査2023

    • 著者名/発表者名
      佐々木優人,原本英司,八重樫咲子
    • 学会等名
      第50回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 釜無川および塩川流域の水生昆虫を対象とした環境DNA メタバーコーディング2022

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,佐々木勇人,野村虹之介,金子栄廣
    • 学会等名
      ELR2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Investigation of a method for surveying aquatic insects using DNA barcoding of environmental DNA2022

    • 著者名/発表者名
      S. Yaegashi
    • 学会等名
      14th International symposium on Ecohydraulics
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 環境DNAメタバーコーディングに基づく富士川水系の水生昆虫多様性の評価2022

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,佐々木勇人,濱本碧海,金子栄廣
    • 学会等名
      第59回環境工学研究フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA情報に基づく水生昆虫多様性の調査へ向けて2022

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子
    • 学会等名
      第59回環境工学研究フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 八ヶ岳周辺における縄文時代の集落立地と水資源環境の関連性2022

    • 著者名/発表者名
      髙橋凜,中村高志,金子栄廣,八重樫咲子
    • 学会等名
      第50回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2026-01-16  

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