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光合成超分子複合体における光エネルギー伝達ダイナミクスの理論的解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K05022
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分32010:基礎物理化学関連
研究機関名古屋大学 (2023)
京都大学 (2022)

研究代表者

東 雅大  名古屋大学, 情報学研究科, 教授 (20611479)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2025年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2024年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード光捕集アンテナ / 光エネルギー伝達 / 分子シミュレーション / 理論計算 / 超分子複合体 / 光合成超分子複合体 / 光エネルギー伝達機構 / 反応中心
研究開始時の研究の概要

光合成系における最初のステップは、光捕集アンテナと呼ばれるタンパク質による光エネルギーの吸収および反応中心への伝達である。光捕集アンテナは、内部に含まれる色素の励起エネルギーの大きさと揺らぎを適切に制御することで、高効率なエネルギー移動を達成しているが、その詳細はよく分かっていない。これまで我々は独自の高精度理論解析手法を用いて、光捕集アンテナ内のエネルギー移動の解析を行ってきた。本研究課題では、その研究を発展させ、光捕集アンテナから反応中心への高効率な光エネルギー伝達機構を分子論的に明らかにする。

研究実績の概要

光合成系における最初のステップは、光捕集アンテナと呼ばれるタンパク質による光エネルギーの吸収および反応中心への伝達である。光捕集アンテナは、内部に含まれる色素の励起エネルギーの大きさと揺らぎを適切に制御することで、高効率なエネルギー移動を達成しているが、その詳細はよく分かっていない。本研究課題では、光捕集アンテナから反応中心への高効率な光エネルギー伝達機構を分子論的に明らかにすることを目的とする。本年度は、昨年度に引き続き、主に紅色細菌の光捕集アンテナLH2の吸収スペクトルの解析を行った。LH2はB800とB850と呼ばれる吸収エネルギーの異なる2つの色素リングを内包するが、色素が重なったB850の吸収エネルギーを分子シミュレーションにより再現するのは困難だった。本年度は分子シミュレーションの結果を丁寧に解析し、色素バクテリオクロロフィルのアセチル基のねじれ角の制御が重要であり、タンパク質環境を適切に再現することが重要であることが明らかになった。現在、テスト計算では良好な結果を得ており、引き続き解析を進める予定である。また、LH2の集合体を解析するための粗視化モデルの開発も進めている。さらに、これまで研究を進めてきた色素バクテリオクロロフィルのS2状態からS1状態への超高速緩和ダイナミクスの解析も論文としてまとめた。分子軌道の解析や非断熱分子動力学シミュレーションにより配位子が緩和ダイナミクスを高速化することを明らかにした。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は光捕集アンテナLH2の吸収スペクトルの解析を進め、また色素の励起状態緩和ダイナミクスの解析も進めた。研究はおおむね順調に進行していると考えている。

今後の研究の推進方策

今後も引き続き、光捕集アンテナの吸収スペクトルの解析を進める。その後、光エネルギー伝達の機構解析に進み、光捕集アンテナ集合体の解析にも展開する予定である。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Theoretical analysis of the coordination-state dependency of the excited-state properties and ultrafast relaxation dynamics of bacteriochlorophyll a2023

    • 著者名/発表者名
      Takabayashi Yuji、Sato Hirofumi、Higashi Masahiro
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 826 ページ: 140669-140669

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2023.140669

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 凝縮系の化学反応ポテンシャル関数の開発と応用2022

    • 著者名/発表者名
      東 雅大
    • 雑誌名

      アンサンブル

      巻: 24 号: 1 ページ: 32-38

    • DOI

      10.11436/mssj.24.32

    • NAID

      40022823115

    • ISSN
      1884-5088, 1884-6750
    • 年月日
      2022-01-31
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Theoretical study on the environmental effects on photoexcited properties of donor-acceptor-linked molecules2023

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      243rd ECS Meeting
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる紅色細菌の光捕集アンテナLH2の吸収スペクトルの解析2023

    • 著者名/発表者名
      薮 俊祐,佐藤 啓文,東 雅大
    • 学会等名
      第2回 量子地球生命科学研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 熱揺らぎと電荷移動を考慮したモデルによる光捕集複合体LH2の励起状態の理論解析2023

    • 著者名/発表者名
      薮 俊佑,佐藤 啓文,東 雅大
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学2023」
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 紅色細菌の反応中心色素の励起状態の分子動力学シミュレーションによる解析2023

    • 著者名/発表者名
      飯田 凌生,佐藤 啓文,東 雅大
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Theoretical analysis of the excited states of donor-acceptor-linked molecules in condensed phases2022

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      12th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 量子化学計算と分子動力学シミュレーションによる光捕集複合体の理論解析2022

    • 著者名/発表者名
      東 雅大
    • 学会等名
      量子生命科学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 凝縮系の励起状態反応ダイナミクスの理論解析2022

    • 著者名/発表者名
      東 雅大
    • 学会等名
      第6回分子集合系計算科学セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] QM/MMレベルのMDシミュレーションによる光捕集複合体LH2の吸収スペクトルの解析2022

    • 著者名/発表者名
      薮 俊佑,佐藤 啓文,東 雅大
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる紅色細菌の光捕集アンテナ LH2 の吸収スペクトルの解析2022

    • 著者名/発表者名
      薮 俊佑,佐藤 啓文,東 雅大
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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