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縮合剤を用いないアミド化反応の開発とそのペプチド合成への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22K05112
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分33020:有機合成化学関連
研究機関京都大学

研究代表者

倉永 健史  京都大学, 薬学研究科, 助教 (70625201)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード有機合成化学 / ペプチド / 天然物化学 / グリーンケミストリー / サステナブルケミストリー / 生合成
研究開始時の研究の概要

小分子と抗体の中間的性質を持つペプチド中分子は、双方の利点を併せ持ち、また欠点を克服しうる次世代の創薬シーズとして非常に大きな注目を集めている。
ペプチド化学合成では様々な縮合剤が用いられるが、異性化ペプチドの生成など種々の問題が発生する。なるべく高性能な縮合剤を用い、さらに生合成と逆向きの「ペプチドC末端→N末端」の順でアミノ酸を連結することで問題を「回避」することが当然となっている現在のペプチド化学合成に対し、本研究では高性能な縮合剤の開発を目的としてきた従来のアプローチとは大きく異なる、研究代表者独自のアミド化により問題を「解決」することを目的とする。

研究実績の概要

アミド結合生成反応は医薬品・化成品合成だけでなく、タンパク質を合成する反応であるなど人類にとって最重要反応の1つである。縮合剤を用いるアミド化では異性化ペプチドの生成など種々の問題が発生するため、現在のペプチド化学合成ではなるべく高性能な縮合剤を用い、さらに生合成と逆向きの「ペプチドC末端→N末端」の順でアミノ酸を連結することで問題を回避することが一般的となっている。本研究では高性能な縮合剤の開発を目的としてきた従来のアプローチとは大きく異なる、研究代表者独自のアミド化により問題を解決することを目的とし、研究を行っている。
前年度は塗料の安定化剤等として工業的にも広く利用されているトシルイソシアネートと、活性化剤としてペンタフルオロベンジルブロミドを用いるアミド化反応の開発に取り組み、多数の基質で本反応によるアミド化が可能であることを確認していた。2023年度はその基質適用性の広さの実証実験として、様々な中分子環状ペプチド化合物の合成に取り組んだ。大環状ペプチド天然物チロシジンAやアシルスルガミドAの全合成、人工大環状ペプチドの合成などいずれも効率的な環化が確認され、本反応の有用性が示された(エピメリ化を抑制するペプチドC末端修飾法と中分子環状ペプチド合成への応用. 第65回天然有機化合物討論会など)。さらに、アミド化反応時の活性化剤としてペンタフルオロベンジルブロミドの代わりに、より安価なブロモ酢酸エステルを用いたアミド化でも同等の反応性および異性化抑制能が確認され、論文投稿に先立ち低コストアミド化反応として特許出願(特願2023-147238)を行なった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

縮合剤を用いないアミド化反応への挑戦として、前年度は塗料の安定化剤等として工業的にも広く利用され安価なトシルイソシアネートを用いるペプチド鎖C末端の修飾、生成するアシル化スルホンアミドのペンタフルオロベンジルブロミドを用いた活性化、得られた活性化体とアミンとの反応によるアミド化反応の開発に取り組んだ。
2023年度はまずペンタフルオロベンジルブロミドを用いたアミド化の有用性の実証実験として様々な中分子環状ペプチド化合物の合成に取り組んだ。大環状ペプチド天然物チロシジンAやアシルスルガミドAの全合成、人工大環状ペプチドの合成などいずれも効率的な環化が確認され、天然物化学・生物有機化学分野における最高峰の国内学会 (エピメリ化を抑制するペプチドC末端修飾法と中分子環状ペプチド合成への応用. 第65回天然有機化合物討論会)や、ペプチド関連分野の国際学会(Acyl sulfonamide-mediated amidation and its application to the synthesis of middle molecular natural peptidic molecules. The 60th Japanese Peptide Symposium)で発表を行なった。
さらに、2023年度は開発したアミド化反応の低コスト化、廃棄物の削減研究にも取り組み、アミド化反応時の活性化剤として比較的高価なペンタフルオロベンジルブロミドの代わりに、より安価なブロモ酢酸エステルを用いたアミド化でも同等の反応性および異性化抑制能が確認された。本成果は現在広く用いられる縮合剤を用いたアミド化のコストや廃棄物の問題を解決しうる手法となることが期待されるものであり、論文投稿に先立ち低コストアミド化反応として特許出願(特願2023-147238)を行なった。

今後の研究の推進方策

縮合剤を用いるアミド化ではまずカルボン酸が縮合剤により活性化合物となり、次にその活性化体に対してアミンが反応することで、アミドが縮合剤由来の共生成物とともに得られる。しかし活性化体の不安定性により様々な副反応を生じるため、それを抑制するための添加剤も同時に加えることが一般的となっている。アミンに対し過剰量の高性能な縮合剤・添加剤を過剰のカルボン酸とともに用いるほどアミド化反応の収率は高くなるものの、試薬自体のコストのみならず精製や廃棄物の処理も含め生産コストがより高くなることがアミド化合物合成の工業化の際に問題となる。医薬品や化成品等の有用アミド化合物の大量供給のためにはカルボン酸の異性化等の副反応を抑制可能で、かつ精製や廃棄物の処理コストも低減したアミド化反応の開発が大きな課題となっている。2022年度に見出した、カルボン酸の活性化に用いるトシルイソシアネートは塗料の安定化剤等として工業的に広く利用されている化合物であり、2023年度に見出したハロゲン化酢酸エステルも様々な有機化合物や有機合成用試薬の原料として利用される単純低分子化合物であり、ともに非常に安価である。2024年度は本研究で見出した低コストアミド化反応のより多様な基質を用いた一般性の確認を行い、さらにアミド化反応時のコストのみならず、廃棄物低減や簡便な精製方法の確立など、反応後の処理・精製の低コスト化研究にも取り組む。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (21件) (うち国際学会 4件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Separation and Identification of Isoleucine Enantiomers and Diastereomers Using an Original Chiral Resolution Labeling Reagent2023

    • 著者名/発表者名
      Ozaki Makoto、Shimotsuma Motoshi、Kuranaga Takefumi、Kakeya Hideaki、Hirose Tsunehisa
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 71 号: 11 ページ: 824-831

    • DOI

      10.1248/cpb.c23-00439

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2023-11-01
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous separation and identification of all structural isomers and enantiomers of aminobutyric acid using a highly sensitive chiral resolution labeling reagent2023

    • 著者名/発表者名
      Ozaki Makoto、Shimotsuma Motoshi、Kuranaga Takefumi、Kakeya Hideaki、Hirose Tsunehisa
    • 雑誌名

      Analytical Methods

      巻: 15 号: 48 ページ: 6648-6655

    • DOI

      10.1039/d3ay01665j

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Amoxetamide A, a new anoikis inducer, produced by combined-culture of Amycolatopsis sp. and Tsukamurella pulmonis2023

    • 著者名/発表者名
      Pan Chengqian、Ikeda Hiroaki、Minote Mayuri、Tokuda Tensei、Kuranaga Takefumi、Taniguchi Tohru、Shinzato Naoya、Onaka Hiroyasu、Kakeya Hideaki
    • 雑誌名

      The Journal of Antibiotics

      巻: 77 号: 1 ページ: 66-70

    • DOI

      10.1038/s41429-023-00668-1

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Separation of amyloid β fragment peptides with racemised and isomerised aspartic acid residues using an original chiral resolution labeling reagent2023

    • 著者名/発表者名
      Ozaki Makoto、Shimotsuma Motoshi、Kuranaga Takefumi、Kakeya Hideaki、Hirose Tsunehisa
    • 雑誌名

      The Analyst

      巻: 148 号: 6 ページ: 1209-1213

    • DOI

      10.1039/d2an01885c

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solid-phase total synthesis and structural confirmation of antimicrobial longicatenamide A2022

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Takumi、Kuranaga Takefumi、Taniguchi Yuto、Wang Weicheng、Kakeya Hideaki
    • 雑誌名

      Beilstein Journal of Organic Chemistry

      巻: 18 ページ: 1560-1566

    • DOI

      10.3762/bjoc.18.166

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Separation and identification of the dl-forms of short-chain peptides using a new chiral resolution labeling reagent2022

    • 著者名/発表者名
      Ozaki Makoto、Kuwayama Tomomi、Hirose Tsunehisa、Shimotsuma Motoshi、Hashimoto Akira、Kuranaga Takefumi、Kakeya Hideaki
    • 雑誌名

      Analytical and Bioanalytical Chemistry

      巻: 414 号: 14 ページ: 4039-4046

    • DOI

      10.1007/s00216-022-04048-w

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total syntheses of surugamides and thioamycolamides toward understanding their biosynthesis2022

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga Takefumi
    • 雑誌名

      Journal of Natural Medicines

      巻: 77 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1007/s11418-022-01662-x

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 新規がん幹細胞スフェア形成阻害剤ストレプトスフェリンAの全合成研究2024

    • 著者名/発表者名
      周防大樹, 倉永健史, 吉田沙綾, 小山愛, 池田拓慧, 柴崎守弘, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規アノイキス誘導剤アモキセタミドAの完全構造決定及び全合成研究2024

    • 著者名/発表者名
      徳田天成, 倉永健史, 箕手万由里, 池田拓慧, 潘承謙, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規抗真菌剤アムフィオールの全合成研究2024

    • 著者名/発表者名
      説田武尚, 倉永健史, 堤凌太郎, 掛谷秀昭. 新規抗真菌剤アムフィオールの全合成研究
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規がん幹細胞スフェア形成阻害剤ストレプトスフェリンAの単離・構造解析2024

    • 著者名/発表者名
      池田拓慧, 柴崎守弘, 巻田彩季, 船山佳代, 周防大樹, 吉田沙綾, 倉永健史, 新藤一敏, 降旗一夫, 井本正哉, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 高感度光学分割ラベル化剤L-FDVDAを用いた生体試料・食品からのアミノ酪酸の高感度分析法の確立2024

    • 著者名/発表者名
      尾崎 誠, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭, 廣瀬恒久
    • 学会等名
      第15回Japan Bioanalysis Forum (JBF) シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 高感度光学分割ラベル化剤D-FDLDAを用いた発酵食品中のDL-アミノ酸分析2023

    • 著者名/発表者名
      廣瀬恒久, 尾崎 誠, 中出友美, 下間志士, 池田明夏里, 倉永健史, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      第13回新アミノ酸分析研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 高感度光学分割ラベル化剤L-FDVDAを用いたアミノ酪酸の構造異性体と光学異性体の一斉分析. 一斉分析法の確立2023

    • 著者名/発表者名
      尾崎 誠, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭, 廣瀬恒久
    • 学会等名
      第13回新アミノ酸分析研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Acyl sulfonamide-mediated amidation and its application to the synthesis of middle molecular natural peptidic molecules2023

    • 著者名/発表者名
      Koyama, A., Kuranaga, T., Morimoto, R., Matsumoto, T., Kakeya, H.
    • 学会等名
      The 60th Japanese Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Design, synthesis, and application of highly sensitive labeling reagent for amino acids2023

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga, T., Morimoto, R., Pan, C., Ogawa, H., Kakeya, H.
    • 学会等名
      The 60th Japanese Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of DL-amino acids containing threonine and isoleucine stereoisomers in peptides using an original chiral resolution labeling reagent2023

    • 著者名/発表者名
      Ozaki, M., Shimotsuma, M., Kuranaga, T., Kakeya, H., Hirose, T.
    • 学会等名
      The 60th Japanese Peptide Symposium
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 高感度光学分割ラベル化剤D-FDLDAを用いた食品中のDL-アミノ酸分析2023

    • 著者名/発表者名
      廣瀬恒久, 尾崎 誠, 中出友美, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本アミノ酸学会第17回学術大会 (JSAA2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 高感度光学分割ラベル化剤L-FDVDAを用いた全アミノ酪酸一斉分析法の確立2023

    • 著者名/発表者名
      尾崎 誠, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭, 廣瀬恒久
    • 学会等名
      日本アミノ酸学会第17回学術大会 (JSAA2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光学分割ラベル化剤L-FDVDAを用いたペプチド中のThrとIleの立体異性体の同定2023

    • 著者名/発表者名
      中出友美, 尾崎 誠, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭, 廣瀬恒久
    • 学会等名
      日本アミノ酸学会第17回学術大会 (JSAA2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] エピメリ化を抑制するペプチドC末端修飾法と中分子環状ペプチド合成への応用2023

    • 著者名/発表者名
      小山 愛, 倉永健史, 森本涼太, 松元拓海, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      第65回天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 中分子ペプチド創薬を志向した新規ペプチド合成法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      小山 愛, 倉永健史, 森本涼太, 松元拓海, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      第33回新薬創製談話会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Acyl sulfamide-mediated amidation for biomimetic peptide synthesis.2023

    • 著者名/発表者名
      Koyama, A., Kuranaga, T., Morimoto, R., Kakeya, H.
    • 学会等名
      Future Drug Discovery Empowered by Chemical Biology, Nara,
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規誘導体化試薬を用いたD,L-アミノ酸の高感度分析法開発.2023

    • 著者名/発表者名
      安田 穣, 竹澤正明, 倉永健史, 掛谷秀昭.
    • 学会等名
      第28回LC&MSテクノプラザ
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 光学分割ラベル化剤D-FDLDAを用いたアミロイドβ中のアスパラギン酸残基のラセミ化・異性化の同定.2022

    • 著者名/発表者名
      尾崎 誠, 下間志士, 倉永健史, 掛谷秀昭, 廣瀬恒久.
    • 学会等名
      新アミノ酸分析研究会第12回学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規誘導体化試薬を用いた生体試料中及び細胞培養上清中D,L-アミノ酸の高感度分析.2022

    • 著者名/発表者名
      安田 穣, 竹澤正明, 倉永健史, 掛谷秀昭.
    • 学会等名
      新アミノ酸分析研究会第12回学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Highly sensitiveanalysis of D-and L-amino acids in biological samples using new derivatization reagents.2022

    • 著者名/発表者名
      Yasuda, Y., Takezawa, M., Kuranaga, T., Kakeya, H.
    • 学会等名
      The 37th Annual Meeting of the Japanese Society for the study of Xenobiotics,
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification of DL-and DL-iso-form of aspartic acid residues in amyloid b peptide using a chiral resolution labeling reagent.2022

    • 著者名/発表者名
      Ozaki, M., Shimotsuma, M., Kuranaga, T., Kakeya, H., Hirose, T.
    • 学会等名
      The 59th Japanese Peptide Symposium, Miyagi
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [産業財産権] 新規アミド化反応2023

    • 発明者名
      掛谷秀昭、倉永健史、小山愛
    • 権利者名
      掛谷秀昭、倉永健史、小山愛
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-147238
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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