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線状高分子結晶の電子密度分布と分子鎖間水素結合の可視化

研究課題

研究課題/領域番号 22K05217
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分35010:高分子化学関連
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

佐々木 園  京都工芸繊維大学, 繊維学系, 教授 (40304745)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2024年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2023年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワードポリマー結晶 / 電子密度分布マップ / 最大エントロピー法(MEM) / 放射光粉末X線回折データ / 水素結合 / 高分子結晶 / パラクリスタル格子乱れ / 線状高分子 / 結晶構造 / 電子密度分布 / 分子間水素結合
研究開始時の研究の概要

本研究は、大型放射光施設SPrig-8の高輝度X線を利用して収集した高SN比の粉末X線回折データと情報理論に基づく期待値の推定法であるマキシマムエントロピー法(MEM)を応用して、高分子(ポリマー)結晶の電子密度分布を3次元で可視化し、通常の結晶構造解析では不明瞭な結晶構造の乱れと非共有結合性分子鎖間相互作用(分子鎖間水素結合)を可視化可能な精密構造解析法を新たに確立することを目的とする。これまで議論が難しかった高分子結晶が本質的に有する構造の乱れ(パラクリスタル格子乱れ)や弱い分子鎖間相互作用について、結晶状態の高分子鎖の電子密度の空間的な広がりや偏りを可視化することで検討する。

研究実績の概要

本研究は、大型放射光施設SPrig-8の高輝度X線を利用して収集した高SN比の粉末X線回折データと情報理論に基づく期待値の推定法であるマキシマムエントロピー法(MEM)を応用して、高分子(ポリマー)結晶の電子密度分布を3次元で可視化し、通常の結晶構造解析では不明瞭な結晶構造の乱れと非共有結合性分子鎖間相互作用(分子鎖間水素結合)を可視化可能な精密構造解析法を新たに確立することを目的とする。

2023年度は、線状高分子の一つであるナイロン6の粉末回折データを用いてMEMによる構造解析を再検討した。冷凍粉砕機で粉末状にした試料を融点以下で熱処理して測定に用いた。ナイロン6の粉末回折プロファイルは、SPring-8の理研ビームラインで計測した。計測回折強度プロファイルについて、バックグラウンド補正を行い結晶と非晶成分にピーク分離した。結晶由来のBragg反射についてナイロン6のα型とγ型の結晶構造に基づき指数付けを行なった。α型結晶のhkl反射ピーク位置からd-spacingを求め、格子定数a,b,cを計算した。hkl反射の観測強度Iobs(hkl)と上記の格子定数を用いて、既知のα型結晶構造モデルを初期構造としてSHELEXで結晶構造を精密化した。精密化後の結晶構造因子Fcal(hkl)の位相角Φcal(hkl)を使って、Iobs(hkl)から求めた観測構造因子Fobs(hkl)の実数項と虚数項を計算した。一連の反射のFobs(hkl)を用いてMEM解析を行い、R-facor(MEM)が10.58%の3次元電子密度分布マップを最適解として得た。一方で、体積分率で約1パーセント含まれるγ型結晶由来の反射を分離せずにα型結晶由来の反射に含めて結晶構造の精密化とMEM解析を行った場合、最適解のR-facor(MEM)は15.76%であった。前者のR-facor(MEM)が10.58%の3次元電子密度分布マップでは、隣接分子鎖間でNH…OC水素結合の存在が示唆される電子密度の広がりが可視化された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

今年度病気治療を受けるため、研究活動の縮小を余儀なくされました。このことから、本研究の遂行にも多大なる影響があり、当初の予定より遅れている状況です。体調は回復段階にありますので、本研究への取り組みに於いて挽回したいと思います。

今後の研究の推進方策

2023年12月に開始した新薬での点滴治療に於いて2024年5月の段階で効果が認められており、体調も徐々に回復しつつある。今度は、当初の研究計画スケジュールに従って進めるように努めていきたい。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Comparison between Ultrathin Films and the Bulk of Microbial Poly(3-hydroxybutyrate-<i>co</i>-3-hydroxyhexanoate) with Regard to Their Melt-Isothermal Crystallization Kinetics2022

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Toan Van、Nagata Toshiteru、Noso Kosei、Kaji Kenshiro、Masunaga Hiroyasu、Hoshino Taiki、Sakurai Shinichi、Sasaki Sono
    • 雑誌名

      Macromolecules

      巻: 55 号: 14 ページ: 6076-6089

    • DOI

      10.1021/acs.macromol.2c00389

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Investigation of Electron Density Distribution Imaging of Paracrystal Structure of Polymers2022

    • 著者名/発表者名
      Sono SASAKI
    • 学会等名
      PacifiChem2021
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison between Ultrathin Films and the Bulk of Microbial Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) with Regard to Their Melt-Isothermal Crystallization Kinetics2022

    • 著者名/発表者名
      Toan Van Nguyen, Toshiteru Nagata, Kosei Noso, Kenshiro Kaji, Hiroyasu Masunaga, Taiki Hoshino, Shinichi Sakurai, Sono Sasaki
    • 学会等名
      The 71th Autumn Meeting of The Society of Polymer Science, Japan (SPSJ)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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