| 研究課題/領域番号 |
22K05704
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分39060:生物資源保全学関連
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| 研究機関 | 大阪市立環境科学研究センター |
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研究代表者 |
秋田 耕佑 大阪市立環境科学研究センター, その他部局等, 研究員 (00828949)
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| 研究分担者 |
戸金 大 慶應義塾大学, 経済学部(日吉), 准教授 (40445854)
小巻 翔平 岩手医科大学, 医歯薬総合研究所, 講師 (90789629)
上田 昇平 大阪公立大学, 大学院農学研究科, 准教授 (30553028)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | トノサマガエル / 国内移入 / ミトコンドリアDNA / 遺伝的撹乱 / テレメトリー調査 / 国内移入種 / シトクロームb遺伝子 / 個体追跡調査 / MIG-seq解析 / ニッチモデリング |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では，国内移入種による遺伝子汚染の実態と拡大プロセスを明らかにするために，国内移入集団による遺伝的攪乱が確認されているトノサマガエルをモデルにゲノムワイド解析を行い，遺伝子汚染の進行状況を把握する．さらに，標識再捕獲調査と個体追跡調査により本種の移動分散能力を評価するとともに，ニッチモデリングによる生息適地推定を行うことにより，国内移入集団の分布拡大プロセスの解明と将来的に遺伝的攪乱の影響が及び得る地理的範囲の予測を試みる．
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| 研究実績の概要 |
本研究では、大阪府内で確認されているトノサマガエルの国内移入集団をモデルにゲノムワイド関連解析を行い、遺伝的攪乱の進行状況を把握する。さらに、個体追跡調査による移動分散能力の評価とニッチモデリングによる生息適地推定を行うことにより、将来的に遺伝的攪乱の影響が及び得る地理的範囲の予測を試みる。
2024年度は、2023年度以前に採集した148地点に加え、新たに32地点でトノサマガエルの組織サンプルを採集した。これまでに計180地点から994個体分のサンプルが得られ、このうち302個体についてミトコンドリアDNAシトクロームb遺伝子（1,143bp）の塩基配列を決定し、各地域の遺伝子型を比較した。その結果、中国地方でのみ確認されているハプロタイプを持つ個体が大阪府内で継続して確認されるとともに、府内の中山間部でのみ確認されているハプロタイプをもつ個体が都市部に造成された緑地で新たに確認された。中山間部の生息地と緑地とは地理的に40km以上離れており、複数の大規模河川により分断されていること、緑地が造成されて間もないことなどから、中山間部の遺伝子型をもつ個体は人為的に持ち込まれた個体に由来すると考えられる。
個体追跡調査では、国内移入と考えられる遺伝子型をもつ個体が生息する大阪府内の都市公園において調査を実施するために必要な許可申請手続きを行い、2025年度から調査を開始する準備を整えた。2025年４月からすでに調査を開始しており、産卵を終えたトノサマガエルのメス個体に発信機を装着し、現在、移動履歴を追跡中である。
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| 現在までの達成度 |
現在までの達成度
4: 遅れている
理由
遺伝子解析に用いる研究サンプルは当初想定していたよりも広範囲から収集することができ、国内移入の新たな事例を確認するなど一定の成果を挙げることができた。しかしながら、研究代表者が介護休暇を取得する必要性が生じたため、予定していた遺伝子解析や個体追跡調査、ニッチモデリングによる生息適地推定を実施するに至らなかった。
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| 今後の研究の推進方策 |
2025年度は、大阪府内への移入が確認されている中国地方と、未だサンプル数が不足している地域（東北、北陸地方）において、遺伝子解析用の組織サンプルの収集を進める。ミトコンドリアDNAの解析を継続して行い、その配列情報に基づき構築した分子系統樹の結果を踏まえゲノム縮約解析に供する個体を選定し、MIG-seq法により一塩基多型情報を収集する。これにより得られる結果から、大阪府及びその周辺地域における国内移入集団の分布状況と在来系統との交雑状況を可視化し、遺伝的撹乱が生じている地理的範囲を把握する。遺伝子解析と並行して、個体追跡調査により本種の移動距離や頻度、方向性を評価するとともに、これまでの現地調査で得られた本種の生息情報に基づきニッチモデリングによる生息適地の推定を行う。これらの解析から得られた結果を踏まえ、今後、遺伝的撹乱が生じうる地理的な範囲を予測し、国内移入集団が分布域を拡大しうる速度や方向性、遺伝的撹乱が生じやすい環境条件など、将来的に在来系統の保全に資する知見の集積を図る。
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