| 研究課題/領域番号 |
22K05833
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分40040:水圏生命科学関連
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| 研究機関 | 長崎大学 |
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研究代表者 |
小山 喬 長崎大学, 総合生産科学研究科(水産学系), 准教授 (40749701)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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| キーワード | トラフグやせ病 / 超早期診断 / 多検体3'mRNA-seq / 体液由来小分子RNA / 多検体mRNA-seq / 統合トランスクリプトーム / やせ病 / 小分子RNA / トラフグ |
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| 研究開始時の研究の概要 |
近年の魚病研究はワクチン開発や耐病性育種が主になっている。しかし、これらの研究は成果が得られるまでに時間がかかるうえ、ワクチンに関しては認可のハードルも超えなければならない。水産養殖産業における魚病対策は喫緊の課題であり、上記の方法とは別の短期的に確立可能な魚病対策も考えなければならない。
そこで本研究では新たな魚病対策として、魚病発生を超早期に診断し、魚病被害を局所的かつ限定的なものにすることを目指す。そのために本申請では、魚類感染症の感染初期に宿主体液中に現れる小分子RNAを同定し、当該小分子RNAを非侵襲的に検出する方法を開発する。
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| 研究成果の概要 |
本研究ではトラフグやせ病をモデルとして、魚病感染初期に宿主体液中に出現する小分子RNAを同定することを目指した。これを実現するためには、まず「感染初期」を定義する必要がある。そこで、複数回の感染試験と標的組織（腸管）の経時サンプリング、多検体3’mRNA-seqとクラスタリング、および複数データセットの統合解析を実施した。その結果、やせ病感染段階を複数に分類できること、バッチ補正により複数データセットの統合解析が可能なことが示唆された。また、トラフグ血漿と糞便由来小分子RNA解析法を確立した。
これらの成果により、トラフグ体液を用いたやせ病感染初期診断法の技術的素地を構築できた。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
これまでの魚病研究では、「少数検体のトランスクリプトーム解析」か「多検体の少数遺伝子発現解析」のどちらか一方しか実施してこなかった。これらの方法は厳密に管理された環境で、遺伝的に均一な集団に対して実施する場合は一定の有効性が期待できる。しかし水産養殖のように、自然環境に近い条件で飼育されている遺伝的に多様な集団では、個体間・バッチ間のばらつきが大きくなり期待した結果が得られないと予想される。本研究は多検体3’mRNA-seq解析とバッチ補正により、そのような困難が解決でき、魚病発生初期に利用可能なバイオマーカーが同定できる可能性を示した点で学術的・社会的意義があると考える。
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