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ウシ脂肪交雑形成機構の解明に向けた候補遺伝子変異の網羅的検証

研究課題

研究課題/領域番号 22K05969
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42010:動物生産科学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

笹崎 晋史  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (50457115)

研究分担者 川口 芙岐  神戸大学, 農学研究科, 助教 (00879968)
万年 英之  神戸大学, 農学研究科, 教授 (20263395)
大山 憲二  神戸大学, 農学研究科, 教授 (70322203)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード黒毛和種 / 牛肉 / 脂肪交雑 / 遺伝子 / ウシ / 和牛
研究開始時の研究の概要

これまでに牛肉の脂肪交雑を支配するゲノム候補領域については多くの報告がなされているものの、主要な責任遺伝子変異は未だ解明されていない。申請者らは先行研究においてゲノムワイド関連解析を行い、責任変異の位置する有力な候補領域を同定した。さらに、全ゲノムリシーケンスを行い、候補領域内に存在する全てのDNA変異を網羅的に検出した。本研究では、一度に多くの遺伝子座を判定可能である集積流体回路を活用し、上記で検出した候補多型を検証することにより、脂肪交雑に関わる遺伝子と責任変異の同定を試み、脂肪交雑形成機構の解明に向けて新たな知見を得ることを目的とする。

研究成果の概要

先行研究により同定された脂肪交雑QTL候補領域(7番染色体10-30Mbp)内の全127,090個の多型から選出した96SNPについて遺伝子型判定を行い、LDブロック図を作成したところ、候補領域は0.3Mbp(15.8-16.1Mbp)にまで大幅に絞られた。そこで宮崎県集団でゲノムリシーケンス解析を行い、候補領域内の全多型1846SNPを検出した。これらについて、BMSとの関連を分散分析によって算出したところ、ICAM(Intercellular Adhesion Molecule)遺伝子上のアミノ酸置換が最も高い効果を示し、脂肪交雑の原因遺伝子である可能性が高いと考えられた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

和牛の脂肪交雑を支配する遺伝子および遺伝子変異を同定するべく、これまでに国内外を問わず多くの研究がなされてきたが、脂肪交雑を支配する主要な責任遺伝子および変異は未だ解明されていない。本研究の結果、7番染色体の候補領域を大幅に絞り込むことに成功し、その中でもICAM遺伝子上のアミノ酸置換が脂肪交雑と非常に高い効果を示した。以上、我が国を代表する黒毛和種の象徴である脂肪交雑についてその遺伝的要因の解明、および脂肪交雑をコントロールすることのできるDNAマーカーの開発に向けて、本研究の結果は有益な情報となりえると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Comprehensive genotyping analysis of single nucleotide polymorphisms responsible for beef marbling in Japanese Black cattle2024

    • 著者名/発表者名
      Sasazaki Shinji、Kondo Hina、Moriishi Yurika、Kawaguchi Fuki、Oyama Kenji、Mannen Hideyuki
    • 雑誌名

      BMC Genomic Data

      巻: 25 号: 1 ページ: 17-17

    • DOI

      10.1186/s12863-024-01199-w

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書 2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Verification of Candidate SNP Effects Reveals Two QTLs on BTA7 for Beef Marbling in Two Japanese Black Cattle Populations2022

    • 著者名/発表者名
      Shinji Sasazaki, Raito Yamamoto, Shintaro Toyomoto, Hina Kondo, Takayuki Akiyama, Namiko Kohama, Emi Yoshida, Fuki Kawaguchi, Kenji Oyama and Hideyuki Mannen
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 13 号: 7 ページ: 1190-1190

    • DOI

      10.3390/genes13071190

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Comprehensive verification of all SNPs within a QTL region suggested that ICAM gene polymorphisms would be responsible for beef marbling in Japanese Black cattle2024

    • 著者名/発表者名
      Shinji Sasazaki, Hina Kondo, Yurika Moriishi, Fuki Kawaguchi, Kenji Oyama, Hideyuki Mannen
    • 学会等名
      31th Plant & Animal Genome Conference
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書 2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Verification of Candidate SNP Effects Reveals Two QTLs on BTA7 for Beef Marbling in Two Japanese Black Cattle Populations2023

    • 著者名/発表者名
      Shinji Sasazaki, Raito Yamamoto, Shintaro Toyomoto, Hina Kondo, Namiko Kohama, Emi Yoshida, Eiji Iwamoto, Fuki Kawaguchi, Kenji Oyama and Hideyuki Mannen
    • 学会等名
      30th Plant & Animal Genome Conference
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2026-01-16  

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