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天然変性領域を介した分子認識機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K06101
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関京都大学

研究代表者

星野 大  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (70304053)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード天然変性タンパク質 / 分子認識 / タンパク質間相互作用 / NMR
研究開始時の研究の概要

「タンパク質」は我々のからだを構築するだけでなく、摂取した食物を消化してエネルギーに変換したり、外界からの刺激(光・温度・匂い)を脳に伝達したり、あらゆる生命活動において中心的役割を果たしている。タンパク質は特有の立体構造により機能を発現しているが、機能に必要な「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、ヒトを含む高等な生物に多数存在することが明らかとなってきた。「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、どうやって機能を発揮しているのかを「タンパク質のかたち」に注目しつつ解明する。

研究実績の概要

「タンパク質」は我々のからだを構築するだけでなく、摂取した食物を消化してエネルギーに変換したり、外界からの刺激(光・温度・匂い)を脳に伝達したり、あらゆる生命活動において中心的役割を果たしている。タンパク質は特有の立体構造により機能を発現しているが、機能に必要な「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、ヒトを含む高等な生物に多数存在することが明らかとなってきた。「特有の立体構造」をもたないタンパク質が、どうやって機能を発揮しているのかを「タンパク質のかたち」に注目しつつ解明する。
転写因子であるSp1に存在する、グルタミン残基に富むSp1-QBドメインは、そのような天然変性タンパク質の一種である。興味深いことに、Sp1-QBドメインは、特定の構造をもたないにも関わらず自己会合してホモオリゴマーを形成する。さらに、TAF4という基本転写因子のタンパク質とも相互作用して、Sp1-TAF4ヘテロオリゴマーを形成する。
本研究では、特定の構造を持たない天然変性タンパク質が、複数の異なるタンパク質(Sp1-Sp1およびSp1-TAF4)を認識・相互作用する分子機構を明らかにすることを目的とする。そのために、溶液高分解能NMRを用いて両タンパク質の相互作用を残基レベル分解能で解析する。計画は順調に進行しており、相互作用にともなって特定の残基に由来する共鳴ピークが減弱することを見出している。今後さらに計画を進め、相互作用にともなう分子運動の変化を解析する予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

前年度までの研究により得られたNMRスペクトルの帰属情報をもとに、Sp1-QB ドメインと TAF4-中央ドメインの相互作用における相互作用部位を詳細に解析することに成功した。これにより、QB のC末端部分とTAF4のN末端部の関与が示唆された。

今後の研究の推進方策

両タンパク質における相互作用部位は比較的狭い領域に限局していることが明らかになった。今後は、この「局所的な」相互作用が、タンパク質の他の領域にどのような構造変化をもたらすのかを明らかにする。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 6件、 査読あり 6件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Insights into the dual nature of alphaB crystallin chaperone activity from the p.P39L mutant at the N-terminal region.2024

    • 著者名/発表者名
      A. Barati, L.R. Somee, M.B. Shahsavani, A. Ghasemi, M. Hoshino, J. Hong, A.A. Saboury, A.A. Moosavi-Movahedi, G. Agnetti & R. Yousefi
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 14 号: 1 ページ: 7353-7353

    • DOI

      10.1038/s41598-024-57651-5

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Unraveling the impact of the p.R107L mutation on the structure and function of human aB-Crystallin: Implications for cataract formation.2024

    • 著者名/発表者名
      F. Nasiri, P. Ebrahimi, M.B. Shahsavani, A. Barati, I. Zarei, J. Hong, M. Hoshino, A.A. Moosavi-Movahedi & R. Yousefi
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: 222 ページ: 151-168

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2024.03.004

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Understanding the structural and functional changes and biochemical pathomechanism of the cardiomyopathy-associated p.R123W mutation in human alphaB-crystallin.2024

    • 著者名/発表者名
      L.R. Somee, A. Barati, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, J. Hong, A. Kumar, A.A. Moosavi-Movahedi, M. Amanlou & R. Yousefi
    • 雑誌名

      BBA General Subjects

      巻: 1868 号: 4 ページ: 130579-130579

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2024.130579

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Charge manipulation of the human insulin B chain C-terminal to shed light on the complex mechanism of insulin fibrillation.2024

    • 著者名/発表者名
      M.B. Shahsavani, M. Hoshino, A. Kumar & R. Yousefi
    • 雑誌名

      10.1016/j.bbagen.2024.130578

      巻: 1868 号: 4 ページ: 130578-130578

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2024.130578

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Unveiling the structural and functional consequences of the p.D109G pathogenic mutation in human alphaB-Crystallin responsible for restrictive cardiomyopathy and skeletal myopathy.2024

    • 著者名/発表者名
      M.H. Jafari, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, J. Hong, A.A. Saboury, A.A. Moosavi-Movahedi & R. Yousefi
    • 雑誌名

      Int. J. Biol. Macromol.

      巻: 254 ページ: 127933-127933

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2023.127933

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Optimizing expression, purification, structural and functional assessments of a novel dimeric incretin (GLP-1cpGLP-1).2023

    • 著者名/発表者名
      R.M. Albaghlany, M.B. Shahsavani, M. Hoshino, A.A. Moosavi-Movahedi, Y. Ghasemi & R. Yousefi
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: - ページ: 133-146

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2023.10.020

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 血清アミロイドAの自己凝集機構の解析・アカモクフコイダンのアミロイドβ凝集抑制機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      星野 大、奥西 泰之、八木 寿梓
    • 学会等名
      第14回 タンパク質の異常凝集とその防御・修復機構に関する研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 血清アミロイドAのアミロイド線維形成機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 血清アミロイドAのアミロイド線維形成機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • 学会等名
      第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 血清アミロイドAの線維形成における主要な構造変化2023

    • 著者名/発表者名
      奥西 泰之、松崎 勝己、星野 大
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 血清アミロイドAの自己凝集機構の解析・アカモクフコイダンのアミロイドβ凝集抑制機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      星野 大、奥西 泰之、八木 寿梓
    • 学会等名
      第14回タンパク質の異常凝集とその防御・修復機構に関する研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Inhibitory effect of fucoidan on the fibril formation by amyloid-beta peptides2022

    • 著者名/発表者名
      Masaru Hoshino, Yoshinori Kato and Hisashi Yagi
    • 学会等名
      The 4th Proteostasis and Disease Research Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Biophysical analysis of the amyloid fibril formation by serum amyloid A2022

    • 著者名/発表者名
      Taishi Okunishi, Katsumi Matsuzaki and Masaru Hoshino
    • 学会等名
      The 4th Proteostasis and Disease Research Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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