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ADPリボシル化酵素PARP7による自然免疫制御の分子構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 22K06109
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関東京大学

研究代表者

山下 征輔  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 助教 (30769576)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードADPリボシル化酵素 / 構造生物学 / ADPリボシル化
研究開始時の研究の概要

本研究はポリADPリボシル化酵素ファミリーのタンパク質PARP7を対象とする。PARP7は自然免疫経路のキナーゼTBK1をADPリボシル化して阻害し、インターフェロンの産生を抑制する。PARP7のこの活性はシグナルのバランスをとるための機構だと考えられるが、一方でガン化の原因ともなりうる。異常なRNA転写に伴うべき増殖抑制が働かなくなるほか、免疫細胞によるガン細胞の除去を低減させるためである。PARP7がどのようにしてTBK1を認識しているのかはわかっていない。本研究の目的は、PARP7とTBK1の複合体構造解析から、PARP7によるガン化促進のメカニズムを原子分解能で明らかにすることである。

研究実績の概要

本研究はポリADPリボシル化酵素ファミリーのタンパク質PARP7を対象とする。PARP7は自然免疫経路のキナーゼTBK1をADPリボシル化して阻害し、インターフェロンの産生を抑制する。PARP7のこの活性はシグナルのバランスをとるための機構だと考えられるが、一方でガン化の原因ともなりうる。異常なRNA転写に伴うべき増殖抑制が働かなくなるほか、免疫細胞によるガン細胞の除去を低減させるためである。実際に多くのガン細胞ではPARP7の発現が亢進しており、PARP7の阻害剤は抗ガン剤の候補として治験が進められている。しかし、PARP7がどのようにしてTBK1を認識しているのかはわかっていない。本研究の目的は、PARP7とTBK1の複合体構造解析から、PARP7によるガン化促進のメカニズムを原子分解能で明らかにすることである。
これまでにPARP7とTBK1の発現系を構築し、大腸菌での発現を試みた。その結果、PARP7については可溶性の発現を確認することができた。今後発現領域や可溶性タグなどを検討し、さらに多くの量を得てクライオ電子顕微鏡への解析につなげたい。TBK1については可溶性が得られなかったが、こちらも発現領域や可溶性タグなどを検討して構造解析用試料の調製を目指す。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

PARP7については可溶性のサンプルの調製に成功しており、今後構造解析用試料の調製が見込めるため。

今後の研究の推進方策

発現領域や可溶性タグなどを各種検討し、良好なサンプル調製、構造解析を目指す。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Mechanism of U6 snRNA oligouridylation by human TUT12023

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Seisuke、Tomita Kozo
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-023-40420-9

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mechanism of tRNA recognition by heterotetrameric glycyl-tRNA synthetase from lactic acid bacteria2023

    • 著者名/発表者名
      Nagato Yasuha、Yamashita Seisuke、Ohashi Azusa、Furukawa Haruyuki、Takai Kazuyuki、Tomita Kozo、Tomikawa Chie
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 174 号: 3 ページ: 291-303

    • DOI

      10.1093/jb/mvad043

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of the<i>Caenorhabditis elegans</i>m6A methyltransferase METT10 that regulates SAM homeostasis2023

    • 著者名/発表者名
      Ju Jue、Aoyama Tomohiko、Yashiro Yuka、Yamashita Seisuke、Kuroyanagi Hidehito、Tomita Kozo
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 号: 5 ページ: 2434-2446

    • DOI

      10.1093/nar/gkad081

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reversible RNA phosphorylation stabilizes tRNA for cellular thermotolerance2022

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Ohira, Keiichi Minowa, Kei Sugiyama, Seisuke Yamashita, Yuriko Sakaguchi, Kenjyo Miyauchi, Ryo Noguchi, Akira Kaneko, Izumi Orita, Toshiaki Fukui, Kozo Tomita,Tsutomu Suzuki
    • 雑誌名

      Nature

      巻: - 号: 7909 ページ: 372-379

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04677-2

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Structural basis for the U6 snRNA uridylylation by human TUT12022

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Yamashita, Kozo Tomita
    • 学会等名
      第23回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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