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全長型アニオンチャネルロドプシンのイオン輸送機能:C末端ドメインの役割について

研究課題

研究課題/領域番号 22K06120
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

出村 誠  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (70188704)

研究分担者 塚本 卓  北海道大学, 先端生命科学研究院, 助教 (30744271)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードロドプシン / イオンチャネル / イオン選択性 / リン酸化 / 天然変性 / 相互作用 / 中間体 / 遺伝子組み換え発現 / 全長 / イオン輸送 / キネティクス / 膜タンパク質 / 光反応
研究開始時の研究の概要

光で活性化してアニオンを受動輸送するアニオンチャネルロドプシン(ACR)は、膜貫通ドメインのうしろに長いC末端ドメインをもつ。しかし、これまでの研究でC末端ドメインは切除されてきたため、機能的役割はわかっていない。これを解明するために、我々は世界初の全長型ACRの発現系を構築した。さらに、全長型ACRではアニオン選択性が変化し、C末端ドメインと膜貫通ドメインの間の相互作用が示唆された。そこで本研究では、①両ドメイン間の相互作用を確かめる、②変異体を用いて相互作用部位を特定する、③アニオン選択性と相互作用の関連性を明らかにする。本研究は、天然状態のACRの姿を明らかにする世界で唯一の研究である。

研究実績の概要

アニオンチャネルロドプシン(ACR)は、光で活性化してアニオンを輸送するイオンチャネルである。本研究は、我々が世界で初めて発現に成功した全長型ACRについて、これまで見過ごされてきた細胞内ドメインの機能的役割を中心に、天然状態のACRの分子機能を明らかにする研究である。
2023年度は、世界初の全長型ACRの発現に成功したこと、全長型ACRが硝酸イオンを選択的に輸送すること、その選択性に細胞内ドメインが大きく貢献していることを分子レベルで明らかにした成果を論文として発表した。
本論文を発展させて、細胞内ドメインがあることによって、硝酸イオンに対する選択性がどれくらい向上するのかを解析する研究が進行している。また、本論文で示唆された細胞内ドメインのリン酸化修飾を実験によって確かめた。さらに、リン酸化の有無により、アニオン輸送反応(フォトサイクル)が顕著に変化することを発見した。このことから、細胞内ドメインと膜貫通ドメインの間の相互作用に、細胞内ドメインのリン酸化修飾が関与する可能性が示唆された。リン酸化修飾を受ける領域を絞り込むことを目的に、細胞内ドメインを短く切断した変異体を用いた研究が進行している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

重要な研究成果について論文発表をできたこと、その成果を発展させて、全長型ACRの新たな機能的役割が明らかになりつつあることから、予定していた研究計画・研究内容以上に、研究が進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

2024年度は、前年度までに明らかになった成果をさらに推し進め、細胞内ドメインのリン酸化修飾の機能的役割、および細胞内ドメインによるイオン選択性の定量的な解析を実施する。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] The preferential transport of NO3- by full-length Guillardia theta anion channelrhodopsin 1 is enhanced by its extended cytoplasmic domain2023

    • 著者名/発表者名
      Ohki Yuya、Shinone Tsukasa、Inoko Sayo、Sudo Miu、Demura Makoto、Kikukawa Takashi、Tsukamoto Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 11 ページ: 105305-105305

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105305

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Unknown role of the extended cytoplasmic domain of anion channelrhodopsin2023

    • 著者名/発表者名
      Yuya Ohki, Tsukasa Shinone, Sayo Inoko, Miu Sudo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto
    • 学会等名
      第61回日本物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Biological Role and Molecular Mechanism of Preferential NO3- Transport by Full-Length Guillardia theta Anion Channelrhodopsin 12022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Ohki, Ryouhei Ohtake, Yukino Sato, Takuma Watanabe, Jo Watanabe, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto
    • 学会等名
      19th International Conference on Retinal Proteins
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparative Study in Thermodynamics of Microbial Proton-Pumping Rhodopsins Identified in Various Temperature Environments2022

    • 著者名/発表者名
      Ryouhei Ohtake, Kaori Kondo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto
    • 学会等名
      19th International Conference on Retinal Proteins
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Gate Closing Mechanism of Anion Channelrhodopsin Synchronized with transient Proton Release2022

    • 著者名/発表者名
      Sayo Inoko, Takuma Watanabe, Tsukasa Shinone, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto
    • 学会等名
      19th International Conference on Retinal Proteins
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comprehensive thermodynamic analysis for microbial proton pump rhodopsins identified in various temperature environments2022

    • 著者名/発表者名
      Ryouhei Ohtake, Kaori Kondo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto
    • 学会等名
      第60回生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 北海道大学プレスリリース(2023年10月10日)

    • URL

      https://www.hokudai.ac.jp/news/pdf/231010_pr.pdf

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] プレスリリースを解説!「切らないで!タンパク質の末端にも働き発見」

    • URL

      https://life.sci.hokudai.ac.jp/like-macromolecule/article/4712

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] プレスリリースを解説!「切らないで!タンパク質の末端にも働き発見」

    • URL

      https://www.youtube.com/watch?v=e5Bn_GEWb0g

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 北海道大学大学院先端生命科学研究院 生物情報解析科学研究室ホームページ

    • URL

      https://altair.sci.hokudai.ac.jp/infana/

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 北海道大学大学院先端生命科学研究院 生物情報解析科学研究室Twitter

    • URL

      https://twitter.com/Lab_BiolAnalSci

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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