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高等真核生物のアミノ酸ハーモニーを司る交換輸送メカニズムの解析

研究課題

研究課題/領域番号 22K06150
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関岩手大学 (2023)
東京慈恵会医科大学 (2022)

研究代表者

Wiriyasermkul Pattama  岩手大学, 農学部, 准教授 (80825836)

研究分担者 李 勇燦  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 助教 (00894932)
研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードcystinuria / amino acids / transporter / kidney / structure / HATs / homeostasis / exchanger / amino acid / mass spectrometry
研究開始時の研究の概要

ヘテロ二量体アミノ酸トランスポーター(HATs)は、高等真核生物に特異的に発現しているアミノ酸輸送ファミリーである。HATsの機能は、細胞レベルの栄養調和から組織レベルのアミノ酸再吸収・吸収に至るまで、多階層にわたり重要である。HATの機能不全は、がんの増殖、酸化還元バランスの崩れ、腎臓の遺伝性疾患であるシスチン尿症などの原因となる。そのため、HATの輸送機構を理解することは、それらの疾患に対する治療へのアプローチとして重要である。本研究では、HATの輸送機構を詳細に明らかにすることを目的とする。この研究によるHAT輸送機能の理解が基盤となり、HAT研究が創薬・治療につながることが期待される。

研究実績の概要

ヘテロ二量体アミノ酸トランスポーター (Heterodimeric amino acid transporters: HATs) は、哺乳類の数多くの細胞活動において重要な役割を果たすアミノ酸トランスポーターのファミリーである。HATsのトランスポーターメンバーは抗輸送体として機能し、数種類のアミノ酸を認識するため、HATはハーモニーのための主要なアミノ酸トランスポーターファミリーとなっている。HATの交換特性を理解するために、代表者らはrBAT-b0,+ATヘテロ二量体複合体の構造と機能を解明した。rBAT-b0,+ATは腎臓でシスチンと陽イオン性アミノ酸を再吸収する機能を持つ。rBATまたはb0,+ATのいずれかに変異があると、シスチン尿症と呼ばれる腎臓病になる。代表者らはrBAT-b0,+ATの野生型と変異型の両方の構造を低温電子顕微鏡によって高分解能で解明することに成功し、原子レベルでの構造解析が可能になった。代表者らは、rBAT-b0,+ATの野生型と変異型の両方の構造を低温電子顕微鏡法によって高分解能で解明することに成功し、原子レベルでの構造解析が可能になった。野生型複合体の構造は、基質結合のない内向きのコンフォメーションを示した。一方、変異体の構造は、野生型とは異なる位置にあるいくつかの残基を示した。これらの残基は基質輸送に重要であり、シスチン尿症におけるrBAT-b0,+AT欠損の発症メカニズムに関与していることが示唆された。このような残基の重要性を検証するため、我々はさらに変異体を構築し、その基質結合および輸送特性を評価した。これらのすべての結果は、HATのタンパ ク質構造と交換輸送機構の関係を説明する鍵になるものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

The research team aims to achieve high-resolution structures to evaluate important residues for the exchange properties of HATs. By optimization of lipid composition and reconstitution conditions, we succeeded in obtaining the stable protein complex in lipid nanodiscs, allowing structural analysis to go smoothly. Finally, high resolutions of both wild-type and mutant structures were obtained.
Structural analysis between the wild-type and mutants led to predict key residues for protein conformation alteration. Based on the results, we also expanded mutation analysis and predicted some additional residues for the transport mechanism. Expression and localization verified that the mutants do not alter plasma membrane translocation, convincing their specificity in the transport mechanism.

今後の研究の推進方策

The results from wild-type and mutant structures predicted important residues for protein conformation and transport function. The research team plans to focus on the functional analysis of these mutant residues by using cell-free assays. For substrate binding, interactions of the purified transporters and each amino acid will be determined in lipid nanodisc. For transport dynamics, proteoliposome will be employed to determine transport directions and kinetics. The results of all mutants will be compared with the wild-type and the roles of predicted residues will be obtained. Finally, this finding feature will be compared with other HAT members such as rBAT-AGT1. All results will be summarized and the model of exchange transport mechanism in HATs will be proposed.

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] Identification of three distinct cell populations for urate excretion in human kidneys2024

    • 著者名/発表者名
      Sakaguchi Yoshihiko M.、Wiriyasermkul Pattama、Matsubayashi Masaya、Miyasaka Masaki、Sakaguchi Nau、Sahara Yoshiki、Takasato Minoru、Kinugawa Kaoru、Sugie Kazuma、Eriguchi Masahiro、Tsuruya Kazuhiko、Kuniyasu Hiroki、Nagamori Shushi、Mori Eiichiro
    • 雑誌名

      The Journal of Physiological Sciences

      巻: 74 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1186/s12576-023-00894-0

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Nutrient Transport Systems: From Prescription to Prevention2024

    • 著者名/発表者名
      Pattama Wiriyasermkul
    • 学会等名
      第4回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A multi-hierarchical approach explores non-canonical transport systems for nutrients2024

    • 著者名/発表者名
      Pattama Wiriyasermkul
    • 学会等名
      2024 年度日本農芸化学会年度
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural Analysis Reveals the Biogenesis and Function of a Heterodimeric Amino Acid Transporter2024

    • 著者名/発表者名
      Pattama Wiriyasermkul
    • 学会等名
      日本生理学会 第101回記念大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Ca2+-mediated biogenesis of amino acid transporters and its implication in the development of cystinuria2023

    • 著者名/発表者名
      Pattama Wiriyasermkul
    • 学会等名
      the 30th Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists Conference and the 8th International Conference on Biochemistry and Molecular Biology,
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Integrative multi-omics and synthetic biochemistry unveil the hidden functions of the known transporters2023

    • 著者名/発表者名
      Wiriyasermkul Pattama
    • 学会等名
      日本生理学会 第100回記念大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Biogenesis of heterodimeric amino acid transporter rBAT-b0,+AT2022

    • 著者名/発表者名
      Wiriyasermkul Pattama
    • 学会等名
      第3回細胞形成研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Insight into the recognition of different substrates in amino acid transporters: from structural information to biochemical analyses2022

    • 著者名/発表者名
      Wiriyasermkul Pattama
    • 学会等名
      第 95 回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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