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原始概日時計の試験管内再構成

研究課題

研究課題/領域番号 22K06175
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関福井県立大学 (2023)
分子科学研究所 (2022)

研究代表者

向山 厚  福井県立大学, 生物資源学部, 准教授 (80647446)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2024年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード概日時計 / 時計タンパク質 / KaiC / 分子進化 / 進化・多様性
研究開始時の研究の概要

シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942株の概日時計において、時計の周期長を規定する主要な因子はKaiCただ1種のタンパク質の構造に内包されている。KaiCはシアノバクテリア以外の真正細菌および一部の古細菌にも保存され、誕生の起源は原始シアノバクテリアの誕生よりも古いとされるが、原始KaiCがいつ、いかにして時計としての機能を獲得したかは謎に包まれている。
本課題では、現生KaiCホモログのアミノ酸配列に基づいて祖先型KaiCを推定、機能・構造解析による実験的検証を通して、概日時計の進化的起源とその分子基盤を解明するとともに、地球進化との関連について考察する。

研究実績の概要

今日の地球上に存在する生物の多くは、概日時計を用いて地球の自転に伴う周期的な環境変化を予測し、自らの生理機能の時間的統合を図っている。光合成細菌 であるシアノバクテリアの概日時計はKaiA、KaiB、KaiCの3種類のタンパク質から構成され、これら3種類のKaiタンパク質とATPを混合すると、試験管内に24時間のリズムが再構成される。シアノバクテリアは約30億年ほど前に地球上に誕生し、その光合成能によって地球の大気環境を酸化的な環境へ変貌させたため、概日時計を持つ他生物の誕生をもたらしたとされる。本研究課題はシアノバクテリア時計タンパク質の祖先型を復元し、再構成系アプローチを駆使することで、生命が「いつ、どのようにして概日時計を獲得したのか?」という進化の謎に迫る実験研究である。昨年度に引き続き、祖先型KaiA、KaiB、KaiCの発現、精製を行った。融合タグの種類や、各種クロマトグラフィーの条件検討、最適化を進めることで、高純度精製に成功した祖先型Kaiタンパク質の数をさらに増やすことに成功し、進化系統樹上の主要な分岐点を概ね網羅することができた。取得した祖先型KaiCについて独自に整備した周波数特性解析手法をもとに評価したところ、振動能を獲得した分岐点について先例のない知見が得られた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

昨年度から高純度に精製可能な祖先型KAiタンパク質の数をさらに増やすことに成功し、進化系統樹上の主要な分岐点を概ね網羅することができた。また取得した祖先型KaiCについて酵素反応の周波数特性解析を行った結果、振動能を獲得した進化の分岐点に関して有力な知見を得たことから、順調に進んでいると判断した。

今後の研究の推進方策

昨年度に引き続き、祖先型Kaiタンパク質の取得、酵素特性解析、そして周波数特性解析を進める。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 オープンアクセス 5件、 査読あり 4件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Master allostery in clock protein KaiC orchestrates circadian rhythm2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Shuji Akiyama
    • 雑誌名

      SPring-8/SACLA Research Frontiers 2022

      巻: - ページ: 26-27

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Highly sensitive tryptophan fluorescence probe for detecting rhythmic conformational changes of KaiC in the cyanobacterial circadian clock system2022

    • 著者名/発表者名
      Mukaiyama Atsushi、Furuike Yoshihiko、Yamashita Eiki、Akiyama Shuji
    • 雑誌名

      Biochemical Journal

      巻: 479 号: 14 ページ: 1505-1515

    • DOI

      10.1042/bcj20210544

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Regulation mechanisms of the dual ATPase in KaiC2022

    • 著者名/発表者名
      Furuike Yoshihiko、Mukaiyama Atsushi、Koda Shin-ichi、Simon Damien、Ouyang Dongyan、Ito-Miwa Kumiko、Saito Shinji、Yamashita Eiki、Nishiwaki-Ohkawa Taeko、Terauchi Kazuki、Kondo Takao、Akiyama Shuji
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 19

    • DOI

      10.1073/pnas.2119627119

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Elucidation of master allostery essential for circadian clock oscillation in cyanobacteria2022

    • 著者名/発表者名
      Furuike Yoshihiko、Mukaiyama Atsushi、Ouyang Dongyan、Ito-Miwa Kumiko、Simon Damien、Yamashita Eiki、Kondo Takao、Akiyama Shuji
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 8 号: 15

    • DOI

      10.1126/sciadv.abm8990

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cross-scale analysis of temperature compensation in the cyanobacterial circadian clock system2022

    • 著者名/発表者名
      Furuike Yoshihiko、Ouyang Dongyan、Tominaga Taiki、Matsuo Tatsuhito、Mukaiyama Atsushi、Kawakita Yukinobu、Fujiwara Satoru、Akiyama Shuji
    • 雑誌名

      Communications Physics

      巻: 5 号: 1 ページ: 75-75

    • DOI

      10.1038/s42005-022-00852-z

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 概日時計の周波数特性を備えた時計タンパク質の分子起源解明2023

    • 著者名/発表者名
      向山厚
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring ancient origins of the circadian clock system through molecular evolution2022

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Mukaiyama, Yoshihiko Furuike and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2024-12-25  

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