| 研究課題/領域番号 |
22K06180
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
藤 泰子 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (10623978)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2024年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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| キーワード | エピジェネティクス / クロマチン / DNAメチル化 / ヒストンバリアント / 植物 / ゲノム |
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| 研究開始時の研究の概要 |
真核生物は、ゲノム中に存在する遺伝子と有害配列を正確に識別し、それぞれに適したクロマチン修飾を付加して転写制御する。この識別は個体発生やゲノム維持に不可欠であるが、識別メカニズムは未知である。本研究では、CGメチル化とヒストンバリアントに焦点をあて、遺伝学とエピゲノミクスを駆使して、エピゲノムパターン構築におけるこれら因子の寄与を評価し、遺伝子と有害配列を識別する機構解明を目指す。
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| 研究実績の概要 |
真核生物は、ゲノムにコードされる遺伝子と潜在的に有害なトランスポゾンとの違いを正確に識別し、それぞれ異なるクロマチン修飾を付加して転写制御する。本研究では、こうした抑制的クロマチン修飾の喪失からの回復過程において必要なエピゲノム情報の探索を通して、遺伝子と有害配列の識別メカニズムの理解を目指している。
今研究計画では、研究代表者の先行研究により見出された識別因子候補「CGメチル化」および「H２Aバリアント」に焦点を当て、また研究代表者が確立したde novoエピゲノム構築系を応用し、これら因子のゲノム分布を人為的に操作して喪失型および増加型de novoエピゲノム構築系を確立し、そのF１個体における抑制修飾回復の有無や親との同一性を評価する。2022年度はその準備として、「CGメチル化」および「H２Aバリアント」の喪失型および増加型de novoエピゲノム構築系を確立するため、系のコンストラクションや植物の交配、ジェノタイピングなどの作業を進めた。また、本研究に関連する最近の研究論文の総説執筆を行なった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本研究の主目的は、ホスト生物がトランスポゾンと遺伝子を識別するメカニズムの解明であり、2022年度はその足場となる実験系の確立作業を進めた。したがって、順調に進展していると考える。
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| 今後の研究の推進方策 |
2023年度は、引き続き実験系の確立作業を進め、年度内の完了を目指す。また、確立された系から順次、「CGメチル化」および「H２Aバリアント」が増減した際のエピゲノム構築課程を調べていく予定である。
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