| 研究課題/領域番号 |
22K06376
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分45030:多様性生物学および分類学関連
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| 研究機関 | 北里大学 |
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研究代表者 |
田村 啓 北里大学, 理学部, 講師 (50458767)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2025年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
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| キーワード | 陸上進出 / ミオシン重鎖遺伝子 / 肉鰭類 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究では，脊椎動物の進化過程で myh 遺伝子に起こった分子進化を明らかにする。具体的には，肉鰭類で新たに誕生した myh 遺伝子群の起源を明らかにし，骨格筋 myh 遺伝子と比較することで，発現制御（シス）領域の進化，および水棲・陸棲に特化したアミノ酸配列進化が起こったのかを明らかにするため，以下の2つの方向性から解析を行う。
①脊椎動物 myh 遺伝子の分子進化解析
②両生類 myh 遺伝子の発現機構とMYH タンパク質の機能解析
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| 研究実績の概要 |
陸上進出には、四肢形成、およびその骨格筋の獲得が重要であるが、その骨格筋の特性を決定するミオシン重鎖 (myh) 遺伝子の分子進化から、水棲・陸棲の運動様式に寄与する骨格筋の機構解明を目的として研究を行っている。
2022年度は、両生類(Xenopus tropcalis, Ambystoma mexicanum）およびハイギョ(Protopterus annectens) において特異的に保持されている新規型 myh 遺伝子群の発現解析および分子動力学(MD)シミュレーションを用いたMYHタンパク質の機能解析を行った。myh 遺伝子発現をアンプリコンシークエンスによって解析したところ、新規型 myh 遺伝子群は、両生類では尾部に発現していたが、ハイギョでは、尾部でも発現は認められたが、myh遺伝子における新規型myh 遺伝子の発現割合が低かった。また、両生類およびハイギョのMYH タンパク質のアミノ酸配列から立体構造を予測し、MDシミュレーションを行うことで、MYHタンパク質の特性を解析した。その結果、両生類およびハイギョの新規型 MYH タンパク質はヒトMYH1, MYH4 といった速筋型ミオシンと近い性質があることが分かった。以上のことから、脊椎動物の進化過程において、速筋型の性質をもつ新規型MYHを獲得し、四足動物へと分岐する過程で、発現部位が尾部や四肢に限局されていき、その後、完全陸棲脊椎動物では、新規型 myh 遺伝子群が消失した可能性が示唆された。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初の計画では、myh遺伝子の進化速度解析を行う予定だったが、タンデム重複しているmyh遺伝子は、各種で独自に重複していることが分かったため、祖先関係が類推できず、計画を変更した。しかし、「研究業績の概要」で述べたように、ハイギョの発現解析やMYHタンパク質の性質をMDシミュレーションによって解析を進めることができた。
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| 今後の研究の推進方策 |
本年度の解析からハイギョの発現解析が進んだため、当初計画していた myh 遺伝子の部位特異的な発現制御領域を同定するにあたり、ハイギョのゲノム配列データも含めることで効率的に探索を行っていく。
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